EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-15600 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr16:16025819-16026769 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF16MA0741.1chr16:16026359-16026370ACCACGCCCCC+6.14
RARA(var.2)MA0730.1chr16:16025903-16025920AGGTCATACTAAGGTCT+6.46
RFX1MA0509.2chr16:16026099-16026115GGTTACCATGGTTACA-6.76
RFX1MA0509.2chr16:16026099-16026115GGTTACCATGGTTACA+6.78
RFX2MA0600.2chr16:16026099-16026115GGTTACCATGGTTACA-6.73
RFX2MA0600.2chr16:16026099-16026115GGTTACCATGGTTACA+6.7
RFX3MA0798.1chr16:16026099-16026115GGTTACCATGGTTACA+6.67
RFX3MA0798.1chr16:16026099-16026115GGTTACCATGGTTACA-6.89
RFX4MA0799.1chr16:16026099-16026115GGTTACCATGGTTACA+6.79
RFX4MA0799.1chr16:16026099-16026115GGTTACCATGGTTACA-7.11
RFX5MA0510.2chr16:16026099-16026115GGTTACCATGGTTACA-6.15
RFX5MA0510.2chr16:16026099-16026115GGTTACCATGGTTACA+6.18
Rarb(var.2)MA0858.1chr16:16025903-16025920AGGTCATACTAAGGTCT+6.72
SP3MA0746.2chr16:16026358-16026371CACCACGCCCCCT+6.29
SP8MA0747.1chr16:16026359-16026371ACCACGCCCCCT+6.52
Enhancer Sequence
TATGCAACTG GGCAGAACCC GTCTAAACCC CGAGGAATGT GAGCGAAGGA GGAAGAATCA 60
CCTATGCCTC TACTGCGGAC TTCCAGGTCA TACTAAGGTC TTATGTCCCA ACAAGCCTCC 120
CCCTAAGACC CTTCCGCCAT CACTGCTATA GACGGGCGCC CCCTGGAAGA GGGACACATA 180
AAATTCCAAA CACTGCCGAT ATCTCTTCAA ACAGGCTCTC TCCACGTAGA AGAGATTTCC 240
CTCCTTGCGA TAGACTCTCC TCGACACACT GTAATCCTCG GGTTACCATG GTTACAACTT 300
CATGACCCTC AAGTTTCCTG GAGAACTGGT GAGATCACTA AATGGAGCGA TCATTGCTTT 360
ACCCAGTGTC TGCATTCTGT TTCCCCAGTC CAGATCAACA TGATCACCAG TGCCGAAGAC 420
CCTGAACTCA GTCAAATTCC GGAAGTTTAT CATGACTTAA CCGAAGCTTT TAATAAGCAG 480
AAAGCTACCG AGCTCCCTCC TCATCGTGAA AGCGACTGTG CCATCGAACT ACTGCCAGGC 540
ACCACGCCCC CTCGTGGCCG AATTTTCCCT CTCTCTCAAC CGGAGACTGC AGCCATGAAC 600
ACTTATATCT CTGAGGAGCT AGAAAAGGGC TTTATCAGAC CATCCACATC ACCTGCTTCA 660
GCCGGCTTCT TCTTCGTTAA GAAGAAGGAT GGCAGTTTAC GCCCCTGCAT CGATTACAGA 720
GGATTGAACG AAATTACTGT CAAGTATCGC TATCCCTTGC CACTGGTTCC AGCAGCCCTT 780
GAACAGCTCC GCTCAGCTCA GTATTTCACC AAATTGGACC TCCGCAGTGC TTACAACCTC 840
ATCCGTATCC GACAGGGAGA CGAGTGGAAA ACCGGGTTCT CCACCATCAA CGGCCACTAT 900
GAATATCTCG TTATGCCCTT CGGCCTAGCA AACAGTCCTT CCGTGTTACA 950