EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-14723 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr15:45653254-45654532 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC1MA0032.2chr15:45654399-45654410TAAGTAAATAT+6.14
Rarg(var.2)MA0860.1chr15:45654434-45654451TGACCTTTGCTGCCCCT-6.14
RargMA0859.1chr15:45654451-45654467TTCACCCTTTGACCCC-6.15
Enhancer Sequence
TAAGCTGGTG TTAGTCAACC CTATTCCTGG CCGACTACTA TTCTTCAGAC TCTAGTGCCA 60
ACTCTGCTTT AAAACACTTG CCTGTTAGTT TAAAGTATTC CTGAACACAT CGATTAGCTG 120
GTTAAGGTGT GTTTTCTGTA TTTGTGTGCT GGTTTAGAAA GTAGAGATTG ACTAGGAGTT 180
TAAGTAGTAG AGTGTGGGAT GCAGATGTAG GTCTCTACTC CCAGTTAAGG TCTGTAGTGG 240
GGAACTCATT TTCCATGAAA TCTCTTGACA ACATGTCATC ACATCTGTCA GGGTACAATA 300
GGTACCCACT GAATGTGCTG CTGGACTCGG TGCCAGTGAA AATGCCATTA GTGGTGCTGT 360
CTTTCACCTG CAACCACACC CAATCACCTT GACCCAGACC CATCACCACC TGCTGAGAAG 420
CGGTGTTCAT TTCCACCGGT GTAGTTGTCC TCACCACGGC CTCAAAGTTG CGGAAGAGTC 480
CAACCTTCAG CATACGGGTA GACACTTGTA AGTTGTAGCT AAACACGTAT GTTCCGTTAA 540
TAGGGGCTGT GTACACACCA TTATCAGGGC TATAGTTCTG GTTTAAGTTG TAGATTACAC 600
GTTTGAAAAG AACGGGGCGG TTTGGTGCAG GATAAGGGGT GGTAATAGTG GCAGAGAAAG 660
CAGATTGCAC TGTAGGTGAG CAAGGTCCAG GAATGCCAGC CAATCCCATG TCCCCCTTGG 720
CACCTTTAGG GCCTATGGTT CCATTCACAC CCTGTGCCCC TGCCAAACCA TTATCTCCCT 780
TATCACCTTT GTCTCCCTTT TGACCCTGGG CTCCTGGAGC CCCATCATGA CAATTGCACA 840
GGCCCTGTGG ACCTTGGTCA CCCTTTGGCC CTGTGTCACC TGGAGTGCCA GGTCCGCCTG 900
CCACACCCGG ATCTCCCTTC TGCCCTTTGG GTCCAAGGTC TCCATTCAGA CCAGGTAACC 960
CACGTGCACC TACAAGCCCA GGAAGACCAG GTGCACCATC TTGTCCAGGT ATGGGTGCAC 1020
AGCTTTGCGG GCATTGACCA TCTTCTCCTT TTGGGCCTGG TTCTCCAGAA GGACCATCCA 1080
GACCTTGGTC ACCCTTTTCA CCTGAGTAGC ACGTATACAA GCATGGTCAT CATAGACATT 1140
CTGTGTAAGT AAATATGATA AAGATTTAGA GACGTTTCAC TGACCTTTGC TGCCCCTTTC 1200
ACCCTTTGAC CCCGAAGTTC CAGGTAGACC CAAGTCTCCC TTATCTCCAA TATCTCCTTT 1260
CTCACCTGTA ACATAATT 1278