EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-14091 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr15:29553626-29557107 
TF binding sites/motifs
Number: 35             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr15:29554148-29554167CTGCCAGCTGGTGGCGCTA+6.22
CTCFMA0139.1chr15:29553881-29553900CTGTCAGCAGGTGGCGCTA+6.51
CTCFMA0139.1chr15:29554014-29554033CTGTCAGCAGGTGGCGCTA+6.51
CTCFMA0139.1chr15:29556026-29556045CTGTCAGCAGGTGGCGCTA+6.51
CTCFMA0139.1chr15:29556159-29556178TTGTCAGCAGGTGGCGCTA+6.75
CTCFMA0139.1chr15:29556423-29556442CTGCCAGCAGGTGGCGTTA+6.79
CTCFMA0139.1chr15:29554455-29554474TGGCCAGCAGGTGGCACTT+7.67
CTCFMA0139.1chr15:29556290-29556309CTGCCAGCAGGTGGCGCTA+8.36
CTCFMA0139.1chr15:29555242-29555261TGGCCAGCAGGTGGCGCTA+9.81
CTCFMA0139.1chr15:29556729-29556748TGGCCAGCAGGTGGCGCTA+9.81
GSX1MA0892.1chr15:29553725-29553735CCTAATTAAA+6.02
IKZF1MA1508.1chr15:29554270-29554282ACTTCCTGTTCC-6.44
IKZF1MA1508.1chr15:29555057-29555069ACTTCCTGTTCC-6.44
IKZF1MA1508.1chr15:29556543-29556555ACTTCCTGTTCC-6.44
IKZF1MA1508.1chr15:29554577-29554589ACTTCCTGTTTT-6.74
IKZF1MA1508.1chr15:29555364-29555376ACTTCCTGTTTT-6.74
KLF13MA0657.1chr15:29554950-29554968TTGCCACGCCCACTTCAA+6.21
KLF13MA0657.1chr15:29555737-29555755TTGCCACGCCCACTTCCG+6.46
KLF13MA0657.1chr15:29554314-29554332CGGACACGCCCCTCTCTG+6.56
KLF14MA0740.1chr15:29554315-29554329GGACACGCCCCTCT+6.17
KLF14MA0740.1chr15:29555102-29555116GGACACGCCCCTCT+6.17
KLF14MA0740.1chr15:29556588-29556602GGACACGCCCCTCT+6.17
KLF14MA0740.1chr15:29554951-29554965TGCCACGCCCACTT+7.73
KLF14MA0740.1chr15:29555738-29555752TGCCACGCCCACTT+7.73
Rhox11MA0629.1chr15:29556701-29556718ATTACGCTGTAAATCAT+6.65
SP1MA0079.4chr15:29554949-29554964TTTGCCACGCCCACT+6.18
SP1MA0079.4chr15:29555736-29555751TTTGCCACGCCCACT+6.18
SP3MA0746.2chr15:29554951-29554964TGCCACGCCCACT+6.71
SP3MA0746.2chr15:29555738-29555751TGCCACGCCCACT+6.71
SP4MA0685.1chr15:29554949-29554966TTTGCCACGCCCACTTC+6.99
SP4MA0685.1chr15:29555736-29555753TTTGCCACGCCCACTTC+6.99
SP8MA0747.1chr15:29554952-29554964GCCACGCCCACT+7.22
SP8MA0747.1chr15:29555739-29555751GCCACGCCCACT+7.22
SPICMA0687.1chr15:29554576-29554590GACTTCCTGTTTTG-6.22
SPICMA0687.1chr15:29555363-29555377GACTTCCTGTTTTG-6.22
Enhancer Sequence
GGAGCAATTC CAATAGGGCC TTGCACCGTT CGGTGCTCGG TCCCTAATAA TAAACGGAGC 60
AATTCCAATA GGGCCTACGC ACCGTTTCGG TGCTCGGTCC CTAATTAAAG CTGCAAGCAG 120
CGATGATAGG GACCTCGCAC CCGGGCTCAC CGCCGCCCGG TGGTCTCAGT ATGACAGAAA 180
ACAGCGAACA ATAATATTTT AAGCTGATAT ATATAAAAAA CATGAGAAAA TCACAGATTT 240
ATGCCAAACT TCCTCCTGTC AGCAGGTGGC GCTATAACTG TGACTCAATA TTCATATGTA 300
GATGCCTTCA ATGCAGGAAT CTTATCAACC ATGTGAATTT TTAGGCCGAT CAGACATTGT 360
GTGGCTGAGT TATAAGCCAA AATTCCTTCT GTCAGCAGGT GGCGCTATGA CTGACTCAAT 420
ATTGGCATGT AGATGTGTTC AGGAGAGGAC TTTATTTAAC CATGTGAAGT TTCAGGCAGA 480
TCAGACATTG TGTGGCTGAG TTTTTATGAG CCAAACTACC TTCTGCCAGC TGGTGGCGCT 540
ATGACTGTGA CTTAATTTTC TTATGTAGAT GTGTTCAGGA GAGGACTTTT ATCAACCATG 600
TGAAGTTTCA GGCAGGTGAG ACATTGTGTG GTTGAGTTAT AACGACTTCC TGTTCCGTGG 660
CGAAGCGTTG AGGTTTGTCA TGCCGCCACG GACACGCCCC TCTCTGAAAA CTCTAGATCT 720
TCACAATATA TCATCGCTAG AGCTTTGAAA TGACACCCCT CAAATTTGGT GCTGATATGA 780
TAAAGTTTGT AGAAGGAGTT TGTTACAGTG TAAAACATGT CATTTCCTGT GGCCAGCAGG 840
TGGCACTTTA ACTGTATCTG GATATTGGCA TGTAAACGTG TTCAGGTCAG GAATGTTATC 900
AGAGGTGTGA ATTTTGAGGT GGATCTGATA ATGCATGCCT GAGTTATAAT GACTTCCTGT 960
TTTGTGGCGA ATCATCAAAG TTTGCGAGGC CGCCATGGAC ACGTTCATCG ACGAGAACTC 1020
TAAAGCTTCG CAATTTAACA TCGCCAAGGC CTTTAGATGA CAAAACCCAA TTTTGGTGTC 1080
GATCGGATAA AATCCCTAGG AGGAGTTCGT TAAAATACAA CGCCTGGAAA TGGCAAAAAC 1140
GCTACTTTTT CGCCGCAAGA AGTTAATAAT ATCCGACTTC CTGTTGGGTT TGAGATATGG 1200
CTCCAAGAGA CTTTTTCGTA TGTTTTGACA TGTTTAACGT ATGTGCCAAT TTTCGTGCAT 1260
GTGCGTGATT CGTAGCTCGG GGGCTCGTCC GATTAATTTT TCTAGGTGGC GCTGTCGAGT 1320
CATTTTGCCA CGCCCACTTC AATATTGTTA TGAGGATGTT TTCAGGAGAG GACTTTTATT 1380
AACCATGTGA AGTTTCAGGC TGATCAGACA TTGTGTGGTT GAGTTATAAG GACTTCCTGT 1440
TCCATGGCGA AGCTTTGAGG TTTGTCATGC CGCCACGGAC ACGCCCCTCT GCGAAAACTC 1500
TAGATCTTCA CAATATATCA TCGCTAGGGC TTTCAGATAA AACAACCCAA ATTTGGTGCT 1560
GATACGAAAA AATTTGTGGG AGGAGTTTGT TATGATGTAA AACATGTCAT TTCCTGTGGC 1620
CAGCAGGTGG CGCTATAACT GTATCTGGAT ATCGGCATGT AAACGTTTTC AGGTCAGGGC 1680
TCTTATCAAA CGTGTGAATT TTGAGGCAGA TCGGATAATG CATGCCTGAG TTATAACGAC 1740
TTCCTGTTTT GTGGCGAATC GTCAAAGTTT GCGAGGCCGC CACGGACACG CCCATCGACG 1800
AAAACTCTAA AGCTTCGCAA TTTAACATCG CCAAGGTCTT TAGATGACAA AACCCAATTT 1860
TGGTGTCGAT CGGATAAAAT CCCTAGGAGG AGTTCGTTAA AATACAACGC CTGGAAATGG 1920
CAAAAATGCC ACTTTTTCGT CGCAGGAAGT CAAAAATATC CAACTTCCTG TTGGGTTTGA 1980
GATATGGCTC CAAGAGACTT TTTTGTATGT TTTGGCATGT TTGAGGTGTG GGCCAATTTT 2040
CGTGCATGTG CGTGATTCGT GGATCGGGGG CTTGTCCGTT TAATTTTTCT AGGTGGCGCT 2100
GTCGAGTCAT TTTGCCACGC CCACTTCCGA AGACCATAAA AAACGTAAAT TTTCGCCACT 2160
TCTGAGGTGT GTGCAAAGTT GCGTGAGTTT TCGGGCATGT TTAGCCCCTC AAAATCGCGA 2220
TTCATTGGAG AGAAGAATAA TAATAATAAT TAAAGCTGCA AGCAGCGATG ATAGGGACCT 2280
CGCACCCGGG CTCACCGCCG ACCGGTGGCC TCAGGATGAC AGAGAACAGC GAACAGTAAT 2340
AATTTAAGCC GATATATAAA AAAAATCTGA GAAAATCACA GATTTATGCC AAATTTCCTC 2400
CTGTCAGCAG GTGGCGCTAT AACTGTGACT CACGATTGGC ATGTAGATGT CTTCAGGAGA 2460
GGAAACTTAT CAACCATGTG AAGTTTCAGG CAGATCGGAC ATTGTTTGGC TGAGTTATAA 2520
GCCAAACTGC CTTTTGTCAG CAGGTGGCGC TATGACAGAC TCAATGTTGT TATGTAAATG 2580
TGTTCAGGAG AGGACTTTTG TCAACCATGT GAACTTTCAG GCAGATCAGA CTTTGTGTGG 2640
TTGAGTTATA ATGCAAACTA CCATCTGCCA GCAGGTGGCG CTATAACTAT GACTTAAGAT 2700
TGGCATGTAG ATGCCTTCAG TAATGGAATT TAATCAACCA TGTGAAGTTT CAGGCTGATC 2760
GGATGTTGTT TGGCTGAGTT ATAAGCCTAT CAACCTTCTG CCAGCAGGTG GCGTTATGAC 2820
TGACTCATTA CTGTTTTGGG GATGTGTTCA GAAGAGGACT TTTATGAGCC ATGTGAAGTT 2880
TCAGGCTGAT CTGACTTTGT GTGGTTGAGA TATAAGGACT TCCTGTTCCA CGGCGAAGTG 2940
TTGGGGTTTG TCATGATGCC ACGGACACGC CCCTCTGCAA AAACTCTAGA TCTTGACAAT 3000
ATATCATCAC TTAAGCTTTC AGATAACAAC CCACCAAATT TGGTGCTGAT ACGAAAAAAT 3060
TTGTGGGAGG AGTTTATTAC GCTGTAAATC ATGACATTTC CTGTGGCCAG CAGGTGGCGC 3120
TATAACTGTA TCTGGATATC GGCATGTAAA CGTGTTCTGG TCTGGACTCT TATTAAACAT 3180
GTGAATTTTG AGGCAGATCA GATAATGCAT GCCTGAGTTA TAATGACTTC CGGTTTTGTG 3240
GCGAATCGTC AAAGTTTGCG GGGCCGCTAC GGACACTCCC ATCGACAAAA ACTATAAAGC 3300
TCCGCAATTT AACATCGCCA AGGCCTTTAG ATGACAAAAC CCAATTTTGG TGTCGATAGT 3360
ATAAAATCCC TAGGAGGAGT TCGTTAAGAT ACAACGCCTG GAAATGGCAA AAATGCCACT 3420
TATTTGCAGC AGGAAGTTAA AAATATCTGA CTTCCTGTTG GGTTTGAGAT ATGGCTCCAA 3480
G 3481