EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-13035 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr15:7927644-7928991 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CUX1MA0754.1chr15:7928622-7928632TTATCGATTA-6.02
CUX2MA0755.1chr15:7928622-7928632TTATCGATTA-6.02
RFX1MA0509.2chr15:7928829-7928845GGTTACCATGGCTACA-7.02
RFX1MA0509.2chr15:7928829-7928845GGTTACCATGGCTACA+7.05
RFX2MA0600.2chr15:7928829-7928845GGTTACCATGGCTACA+6.98
RFX2MA0600.2chr15:7928829-7928845GGTTACCATGGCTACA-7.03
RFX3MA0798.1chr15:7928829-7928845GGTTACCATGGCTACA+6.95
RFX3MA0798.1chr15:7928829-7928845GGTTACCATGGCTACA-7.24
RFX4MA0799.1chr15:7928829-7928845GGTTACCATGGCTACA+7.06
RFX4MA0799.1chr15:7928829-7928845GGTTACCATGGCTACA-7.45
RFX5MA0510.2chr15:7928829-7928845GGTTACCATGGCTACA+6.42
RFX5MA0510.2chr15:7928829-7928845GGTTACCATGGCTACA-6.43
Enhancer Sequence
AGCCATCCAG GTTTTGTCTC ACGAAGTCAC CACACAAGCT CAGGTATTGT CAACCCACCA 60
ACAACAACTA ACACACCTAA CTCAGTTAAC AGATGAACTG GTGAAATCCC TCCAAAACCT 120
GCAAGCTGCT GCCACTGCGC AACCCACCGC CAACTACCCT CCAAGTCCAC TTGTTGTTGC 180
ACAACCCCCG ATGACTTCCG GAGTTCGATT GGCTTTTCCT GACAAGTTCT CAGGTAACCC 240
AGCAAAATGT AAAGGCTTTC TATTGCAATG CAAACTGTTT ATCGCCCAAC AACCCCATCT 300
GTTTAAGGAC GAGAACGGGA AAATTGCTTT TGTGTGCTCA CTGCTCACTG GGAAAGCGCT 360
AGACTGGGCT ACTGCAGTTT GGCCAGACAG TACCCCGATA TTTCCCTCGT TTAATGACTT 420
TCTCAAACGT TTCTGGCGAG GAGCTATTGT GTATCCAACA GGGAGATCGC TCCGCAGCTG 480
AGTTCGCTCT GCAGTTCCGC ACCTTGGCAG CGCAAACTGG CTGGGCTGAT GATCCGCTCG 540
TCACGCTCTA CAGAAGGGCT CTAAAGCCAG AATTGCAGCG AGAGATGGCA TGTCGTGACG 600
ATGGGAAAAC TCTGGATCAA CTAATCGAGC TTTCCATAAG GTTAGACACT CTCCTCCGCA 660
CTCGCAATCC GCTCTGCTCA ATTGCTTCCA GTCCTGTATC CCCTGAAACC TCCGCTGAAC 720
CCATGCAATT GGGGAGAACC CGTCTGAATC CAGAGGAGCG AGAACGACGG AGAAGAAATC 780
ACTTGTGCAT TTACTGCGGA CTTCCAGGTC ATACGAAGGT TTTATGTCCC AACAAGCCTC 840
TCCCTAAAAC CCTCTCGGTG AGTGCAACCA CTATGTTCAC TACCACTAAT AATGTTGTGA 900
ATCTGCCTGT CACTTTGAGA AATGATGGAA ACGAGATTGA GACTATGGCC ATGATCGATT 960
CAGGAGCCGC TGGTAACTTT ATCGATTACA CGTTTGCCAC CACTCACTCC ATTCCTCTAA 1020
CCTCCTGTGA TTCCTCCATA GCCATCACTG CTGTAGATGG GCGCCCTTTG GGAGAAGGAC 1080
GTATAAAATT CCAGACCCTG CCAGTCTTGC TTCAAACAGG CTCTCTTCAT GAAGAAGAAA 1140
TTTCCCTTCT CGCCATCAAC TCCCCTAAAC ACTCTGTGAT TCTCGGGTTA CCATGGCTAC 1200
AACAGCATGA CCCTCAAGTC TCTTGGAGAA CTGGTGAGAT CATAAAATGG AGCAATCAAT 1260
GCTTTACCCA ATGTCTGCAT CCTGTTTCCC CTATCCAGAT CAACATAATC AACAAGACCG 1320
AAGACTCTGA ACTCCATCAT GTTCCTG 1347