EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-10320 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr13:50290483-50292111 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Hmx1MA0896.1chr13:50291797-50291814ATAAGCAATTAATGCAT+7.47
Hmx2MA0897.1chr13:50291797-50291814ATAAGCAATTAATGCAT+8.1
Hmx3MA0898.1chr13:50291797-50291814ATAAGCAATTAATGCAT+7.69
Lhx3MA0135.1chr13:50291414-50291427GTATAATTAATTA-6.12
NR2C2MA0504.1chr13:50291612-50291627GCAGGTCAGAGTTCA+6.16
PHOX2AMA0713.1chr13:50290519-50290530TAATCTAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr13:50290519-50290530TAATCTAATTA+6.14
Phox2bMA0681.1chr13:50290519-50290530TAATCTAATTA+6.32
SOX21MA0866.1chr13:50291101-50291116AGCAATATTAGTGTT+6.56
Enhancer Sequence
TCTTTTTTCA ATTCCGTGGC AAAAAACACA CTTTTATAAT CTAATTATCA GCATGATTAG 60
CTGTTAAAAG CATCATATCA GCATTACGGA CAGCTATTAA CGAGCAGTGA ATTACTGATG 120
ATTGTACATT ATTCTGTCAG CTGATCAGAG ATCTGTCATT CAGATGTTAA AGCTGATCTT 180
GTATAAATGC ACATGTATGA TGATGTGTGT TTTACAGCAG TTTTCTAACC GCTCCAACAT 240
TATCTGCTCA TCAACGCGCA CACGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGCGTG CGTGCGTGCG 300
TGCATGTGTG TTAAAGAGAT CCGATCATCA ATTCACACTT TCAGGTCAGA TTAAACTGCA 360
GATGCAAATT ATAGACTCAT ACTGCCTCCC TGTGGACACA TACAGATGCA TATACAGGTG 420
AGGTCAGAAT TATTCGCCCT CCTGTGGTGT TTTTATATAT TTCTTAAATG ATGTTGAACA 480
GATTGAGGAA TTTCTCACAG TGTTTCCTCT AATATTTCTT CTTCTGGAGA AAGTCTTATT 540
TGTTTTATTT CGGCTAGAAT AAAAGCAGTT TTTAATTGTT TTAAAGCCAT TTTAAGGTCA 600
ATATTATTCG CCCCATTCAG CAATATTAGT GTTGGATTGT CTCCAGAACA AACCACTGTT 660
ATACAATGAC TTGCCTAATT ACCCTAACTT TACCCTAATT ACCCTAGTGA AGCCTTTAAA 720
TGTCACTTTA AGCTGAATAC TAGTGTCTTG AAGAATATCT AGTCTAATAT TATTTACTGT 780
CATCATGGCA AAGATAAAAT AAATCAGTCA TTAAAAATGA GTTAATAAAA CTAATATGAT 840
TAGATAAAAT CTCTCCAATA AAACTAAAAT TGGGGGAAAA AAATAAAAAG GGGGGCTAAT 900
AATTCTGACC ATACACACAA ACTTAATTTT GGTATAATTA ATTACTCTGG TTTAGTTCAT 960
ATTAAGCCGC GGTCACACCC TATAGTTTGA GTTTGCGAAA TTCTGTCGTA CGGCTCTGTG 1020
TAAAGGGGCG GGATTAAACA AGATGATTAG ACATTAATTT TAAATTTCTG TCCAGAGAGG 1080
TCATGTTTTG ATCCTCGGTT GGTCTCACGC AGTCTAGTGA TGCCATTTCG CAGGTCAGAG 1140
TTCACCAAGC TTGAACTTTA CACCGCAGCA ATTTACGAAA CTTGACGCAT GACGGCGCGT 1200
TTCCAGTCTG ATGCATTTGC GTGCGTATGA ATGGAAGTCT ATGGGGAGAC AAGTCCAGAG 1260
TGACCGCAGC TTTACTGTGT GGGTTGTGTG GGTTTAGTTT GGGAGACGTT ATTAATAAGC 1320
AATTAATGCA TAATTTAATA AATAATGCGA ATAATTCTCG TTAACTTCCG ACTGCAGCTG 1380
TATCTCTTTT AACAACCATC CGCATCAACT CGAAATAAAC AGGTGCTGTT TCCCTTTCCT 1440
TCAAATGAAA ATCTATATTC CACCATTTCT CTAAGGAAAA AGATAAAGGC TTCAGATAAA 1500
GATGAAAATA AAGAACTAAA TATTTCTTAA GTTGAGTTTC CCCAAGTCCA TTTTAAAACT 1560
GTAAATGGAG TAAATCCTTC TCAAGACATT TTGAGATGTC GATTTGGTTT TGTTCCTTTT 1620
GTGATGAT 1628