EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-10165 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr13:48085097-48086239 
TF binding sites/motifs
Number: 27             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr13:48085125-48085142TTAATTAATTAATGACC-6.06
BHLHE40MA0464.2chr13:48085477-48085487GTCACGTGAT-6.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr13:48085500-48085518GGTAGAGAGGAAGGAGGG+6.09
KLF13MA0657.1chr13:48085912-48085930GACATGGGGGCGTGGCAG-6.01
KLF14MA0740.1chr13:48085915-48085929ATGGGGGCGTGGCA-6.72
KLF16MA0741.1chr13:48085917-48085928GGGGGCGTGGC-6.62
Lhx3MA0135.1chr13:48085126-48085139TAATTAATTAATG+6.46
Lhx3MA0135.1chr13:48085122-48085135TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr13:48085123-48085136AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr13:48085119-48085132GAATAATTAATTA-7.12
PBX2MA1113.1chr13:48085255-48085267CCTGTCAATCAC-7.22
PBX3MA1114.1chr13:48085252-48085269CCACCTGTCAATCACTT-6.14
POU4F1MA0790.1chr13:48085117-48085131ATGAATAATTAATT+7.82
POU4F2MA0683.1chr13:48085117-48085133ATGAATAATTAATTAA+7.91
POU4F3MA0791.1chr13:48085117-48085133ATGAATAATTAATTAA+8
POU6F1MA0628.1chr13:48085124-48085134ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr13:48085128-48085138ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr13:48085124-48085134ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr13:48085128-48085138ATTAATTAAT-6.02
SOX10MA0442.2chr13:48085581-48085592AAAACAAAGAC+6.14
SOX10MA0442.2chr13:48085187-48085198GTCTTTGTTTT-6.14
SP3MA0746.2chr13:48085916-48085929TGGGGGCGTGGCA-6.41
SP8MA0747.1chr13:48085916-48085928TGGGGGCGTGGC-6.11
SREBF2(var.2)MA0828.1chr13:48085477-48085487GTCACGTGAT-6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr13:48085477-48085487GTCACGTGAT-6.02
TFEBMA0692.1chr13:48085477-48085487GTCACGTGAT-6.02
Tcf12MA0521.1chr13:48086022-48086033AACAGCTGCTG+6.32
Enhancer Sequence
AGTCACGATT CGATTCGATT ATGAATAATT AATTAATTAA TGACCAATTA ATTATTTGTA 60
GCCTACCGTT TAAACTACCT GACCTGCATG GTCTTTGTTT TACCCATAAA CAAATCATAC 120
AGTAAATGAA TAAAGGCAAG ATACACACAT AATTACCACC TGTCAATCAC TTTTTCTGCG 180
GGACTCGTGA ATAGGCAGTG ATCTGTGTCG TTATAATGGC GTCGGTAAAA AAGATGCACA 240
ACCAACAGGA ACCAGCCAAC AGTATCTGAG GTGTTCGCTA AAATGACAAA GTACAAGTGA 300
GTGAAAGATT GAAGCAGTCC TCTGACTGCC TGGACCTGCT GTCTCGAGCG CATGACTGTG 360
TGTGCTTCTG TGTCTGTGTG GTCACGTGAT GTGCATTTTC AGAGGTAGAG AGGAAGGAGG 420
GCTGCTCAGA AATGCTACAC GCCACTGTGG ATGTCAAATC GTTGTCGTTC TAAAATGCCA 480
TTTAAAAACA AAGACAGTGT AAACAGGGCC TGAGTGTGTA CTTTTCGCGA GCGGATTTGC 540
AACGGGGGCG GGCGGAGGAT CGCGATGCCG GTGTTGTCTA TCGAACGAAC CGTATGTAAT 600
ACGTACATAG CAGAGCTTGC AAAACTGTGT TTTTTTTTTG TCGACAACAC GAACGTTGTC 660
AACATAACTC ACTGGAAATC CAAAATGCTT CCACACCGGC GACTTCATTG AAAGAGGAGA 720
GGGTTTAAGT TCTGTCGACG GGTCTCCTGC TTCTGCAGTT TAACAAGCAC TTCAACAAGC 780
CTGTTATTTT CCCGCTTGGC AAGCTAAGCT GACGCGACAT GGGGGCGTGG CAGCATCGAC 840
GATTCTATTT TTTGATCCGA TAATCGAAAT TGAGCATAAA ATTCGATCGA TTTCAATTAA 900
AAATCGAAAT CGTGACACCC CTATCAACAG CTGCTGCTTT GCTCACGTAG CAGAGCTTTC 960
GGGCACTGAT GTTGAATTAC ACTATTTATT TTGGATTGTG GGCGAAGCAG TGGCGCAGTA 1020
GATGTGCTGT CGCCTCACAG CAAGAAGGTC GCTGGTTTGA GCCTCGGCTC AGTTGGTGTT 1080
TCTGTGTGGA GTTTGCATGT TCTCCCTGCG TTCACGTGGG TTTCCTCTGG GTGCTCCCAT 1140
TT 1142