EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-09164 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr13:18524147-18525021 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA13MA0650.2chr13:18524732-18524743GTTTTATTGGT-6.32
HOXB13MA0901.2chr13:18524732-18524743GTTTTATTGGT-6.32
IRF3MA1418.1chr13:18524841-18524862GTTGAACGGAAAGTGAAACGT+6.09
Enhancer Sequence
TAATCGTGAA TTAGCAGCTT TCAGTGCATA AATGAAAACA ATTATATACT TACCGTTATT 60
CTGATTACAG TCTCGGAGAG TCCGGTCCCA TTTTCTATTA TATAATAGTT ATCGCTTCTC 120
GGCCTTTTGG CTAAGATCAA GTGTAGTATC TGTTCTTATC AGTTTAATAT CTGATACGTG 180
CCCTACCCGG GCACCATATA TTAAATTGAT TTTTGGAACA GGGAGATGGA ATAGGGGCTT 240
GCTCCGTCCA CTCCACGCAT CGACCCGGTA TTGCAGTACC TCCGGGAACG GTGCACCCCC 300
TAACCTGGTA AAAAATAGAT TAATAAATGA ATGGAAATGT TAAAGTATAG AAGAAGCTAG 360
CCGTACGAAT GATGTGTATC AACGAATTAA GCAGGTGGCT TATCACATAT GTTATACAAT 420
TTAATACGAT GTGAAAAAAT GCATATGACG CTTGTTTGGC ACTGGTACGT GGTACTGAAG 480
TGGATGTTGT TCCCTGGTGG GATTTCATTA TTATAATAAA GCATAATGGA GCTGCCGAAG 540
TTATGTTCAT ACCTAATTAA CTGCACATTA AGTATATGAT ATTAGGTTTT ATTGGTGTAG 600
TTTATTAAAT CTCGTGTTTC CAGTCTGTGC TCTTACTAAA CTAAGCCACC CGACTAATGA 660
GTTTGTTTTT TATACAACAA CAAATACATC TTGTGTTGAA CGGAAAGTGA AACGTTGGTT 720
TGCAGGAATC AATCGTTATC TGTGTTGGTT TGTGTTGTGA CCACTAGATG TCCTCACACT 780
ACTTCGTATT GAAAAGCTTT GTTGAAGTAG AAAAGATGCT TCGCCATCAG TGTAAATGAA 840
CACGTCTTAA AGGTCCCTAT TCAGCTAATA ACTT 874