EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-07656 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr12:27460855-27462550 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PAX1MA0779.1chr12:27461863-27461880AGCACTCAACCATGACC-6.31
PAX9MA0781.1chr12:27461863-27461880AGCACTCAACCATGACC-6.39
SIX2MA1119.1chr12:27461441-27461457AACTGAAATCTGATTT+6.08
Enhancer Sequence
TGTACTTAAA AAGAACCAGG CTAGCTTTGA GAGCCGTGTT AAGTGGGCTG CCCAAAATCA 60
ATACCACCAT TTCAACCTTT AAGCCATTCA GACATAATTG GCATCCTTGT TGTTCTTATT 120
GATTTGTCAC TGTGGGTCTC AAATGGCCAG TGGGAGGCCA GGTGGCATCT CTTCACTGAC 180
CGTCAAGCAG ACTGTTATCG TAATCTGAAA TCAGATTTTA TCACAACATC AGCTCAAATA 240
TCAAACGCCT GTGAAGGATT TGCTCACCTC GCAGCAGACT AACACAATAC GATAATCCAT 300
TGTTCAGTGT TTTTTATCAA ACAGTCTTTG CATAAAGCCT CGTTCTGCTC AGGATATGTG 360
TTTTATCTGA CAACAGGCTA TAACAGTCGC GTTCCTACGA CTGGTAAAAT ACGATCGGTT 420
TATAGTCTTG AGATATTATT ACTCAAACTG TGGTTCCTCG TATCTGTTGT GTTGATACGG 480
CTGGCCTCAA CTGTAACTGT CATAAGATGA AAATTTCCAG GATGTGGGCC TGACGTGAAT 540
ATACAATATT GTCCAGATGA TCATTAAGCT GTCCTGCCTT AACAGTAACT GAAATCTGAT 600
TTTCTTAATC CAAAATTGTG CTTTAAACAA GGGTTAGTTC ACGCAAAAAA AGTTATTTCA 660
CCCTGTGCCT GTTTCAAACC TGTATGAATG CTTTCTTCCG TCGAATACAA ATATAATTTA 720
TATATATATT GTTCAACAGA ATTAAAAAAC TCATAAAGGT TTGGAACCAG TTGAGGGTAA 780
ATGGCTAAAT AACATTTTTG GGTGAACTAT ATCCTCTTAA TTTACTCATG ATTGTACATT 840
TAACACACTC TCCCGCAGAA CTCCCAGCTA AGGCCACCGG TATCTCCATC TGTCACAGCT 900
GGTGGATCTT TTCTGTTGTT GTTTGGGGCA GGGGGGTATC GAGTCCTGAG ATTTGTTTGT 960
GGTGGGAGTT GACTGAATGG CCCTCCATAA TGATCCCCTA CTTCCTAAAG CACTCAACCA 1020
TGACCATCAC CTTTCACCTC TTATCCTCTT CACTGAATCG CGCTATTTAC ATATGTAAAG 1080
TCCAGCTCCC ACCTCTAGCC CTGGCTGTCT CTATAGGCTC ATCCTGAAAG GAGACACTTG 1140
TCGTTTAGGT ACAATGCTAC TGGTTTTTCA CACTTAGATG TAGCTTGAAA GGAGGTGTGA 1200
ATGTTAAATA CAGTTGTGTT TGAGAAGAGC ATTATTTAAA TCTACTGCAC TGTAAACACC 1260
TAGTATTAAA ATGCATTTTT GGACAACGCT AAGTACTGGT GTAAATGGAG TATAAATGTT 1320
TTAACCACTT CTAGATATAG TCAGAAGCCC AATTGATCTG ATTGTTTTCA TGTTGTAGAT 1380
GCTCATGTGT TTAAATAGCC ACAAAGGACA GCTTTTCTAA ACATATCTGG ATGCGTTGTT 1440
GAATAGGGTT TGAATTGGCT GGCTAAAAAT TTAAACTTGG TCCGAAGACA TAAAAGAAAA 1500
GTAAACAGCT CAATGTTCTC TTACTGATCC TCAGTTTTTG ATTCTTGATT CTGTGGTATT 1560
GTAAGAGCTT TAACAATAGG CCATTGAATT ATTTGAAAAT AGTACACAAT AATGTTTAAC 1620
TTACGTTAAC TTTTTACATT TCATATTAAT CAATAGCAAT GATATCTGGA AATTAGGAAA 1680
TTATGCAGAT TTAAT 1695