EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-06949 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr12:13991660-13993572 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr12:13992327-13992346CTCTGCCCCCTACTGGCAA-7.14
Foxd3MA0041.1chr12:13992649-13992661AAACAAACAATT-6.22
IRF1MA0050.2chr12:13993037-13993058AATGAGAAACTGAAAGTGTAT-7.18
Lhx3MA0135.1chr12:13992474-13992487AAATTAATTAAAT+6.07
TCF7L1MA1421.1chr12:13993529-13993541AAACATCAAAGA+6.14
Tcf7MA0769.1chr12:13993529-13993541AAACATCAAAGA+6.18
Enhancer Sequence
CAGATTTAAG TTCATCATAA TTCAAAGATT CATCAACATC CATGTGAACA TAAGCAGCCC 60
GGGCCTTACC CGTCAGAAGG GGAATCAGAT GAAATACCCA CTCCTCTTTT GGCCATCGGC 120
AAACTGCTGC CATTCTCTCA AAGGTAATTA GGAAATGCTC AACATCATCA CCATCAGACA 180
ACTTTTCCAA TTTAGGCTCT TTGAGTGGGC ACTGACCTGT ATCACGGGCT TCAGCTCCCT 240
CTCTCCGACA GGTACTTGAC TGAGATAATG GCCTACTTGG ACCAGCACCC TCATCTGGGT 300
GATCCAAATC ATCATGAGAT GTTACCAATG TATTTGGAAC AGTAGTTGTG CGGGCCTGCA 360
CCTCCAGCTG CAACAGCCCA AACTGATGAT GGAGAGCTTT GAATCGGCGT TCCTGCTGGG 420
CCAGCTCTGC AATCCTTTGT GCTTCCTGAG CCTCCATTTT TGCCATGTGA GCTCTCAACA 480
AGCCTGTCAA GTCAGCTATT GTTGGTTCTG TGCATTCAGT CTCCACATCA AATTCTCTCA 540
CCTCCTGTAA TTCTTTATCC CCCAGCTCTT GTGCAACTTC ATCCAGTTGC TCCACTGAAA 600
CAGCCTTTGG GGCTCCTCTT CGTCCTCCTC GGTTCATGGC CCAGAAAGTT CACCAAGGAA 660
AAAAAAACTC TGCCCCCTAC TGGCAAAATC CCACTTCTGA CACCACTTGT GAGGGACCGA 720
GCCAGCACGT ACAGTAAGGG GCATACAAAA AAGAAGATTT TCAAAAATAA TTATTTTTAA 780
TAAAGTCAAA AAGGTTTACA AAAAGTTCAA AAATAAATTA ATTAAATAAT TAAATCAATT 840
GAAAGAACAA TAAACTAAAC AAGGAAAACA AACTGAGTTC AAACCAAACA AATCATGTCT 900
AAACCAAAAA CAGAACTCCA TGAAATGACA AGACAGACCA CATTTATAGC ACAGGGACTA 960
GTCCACATTA AACAAGAAGG GGGAGACAAA AACAAACAAT TTACAAATAC AATAAACTAA 1020
GCCAAACATT TAAATACAAA TCTAAATAGA AGTTAAAGAA ATTATAAATA AGGCAAAACT 1080
AAATATAAAT CTGAATAAAC AAACATTGCA AATCATTATT GAACCTAAAC TAAACATGAG 1140
CTCTCCCTCC AAGCCATTAA GCCAATGGTA TCGGCAGGCG GAACCAAAAG ACGGCATCTC 1200
GCGGCACGTC GGACCTTTAC TTGGGCGGAC CACACCCGGA AACTGTTCCT CGTCGGCACT 1260
GCAGCACGGT AACTTAAACT CAAAAGAAAA CTAAATTAAC AAAACATACA GTACAGATAA 1320
CTGATTTTGT GTGCACCCAA AATAGTAATA AATGTACTGT GAATAATAAA GAAAGGTAAT 1380
GAGAAACTGA AAGTGTATGA GTCTTATTTA AATCAGATAT GAATGAAACG AAAATGTATA 1440
AACACAATAA CTGAACTGTA ACCAATAAAT AATCTTAAAT GAATAAGTAT AACGTGTGTG 1500
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGCG TGCATGCCTC ACTCTCAATG TGTGGCCACC 1560
ACACTGGCCA TCACAGCATT GTTGTGTTGA GCCTATGAAA GTAGACAAGT AATTTGTAAA 1620
GTGTTATGTC TTTCTGTTGT ATTCATATTT TGTATTATCT CCAAGATAAA TTAAAAAGAA 1680
GCCGCTCGCG GCATCAACAG AGCTGTCAAG CGAGCACTCT TATGCCCGGC CTCACACTCA 1740
CTTACAAGCT TTTAAGTTTT AACGTGCACA TATGGCACAA ACACACCTTT TAAGCTTGAC 1800
AAAAACTCTC AACAACCTTT ACTGGCTGCT GTGTCTTTAA TATGGTGTAA AGATTATTAT 1860
GCGTTATCAA AACATCAAAG AGGACGGTGC AGAGAAATGT CACTTATTAA TT 1912