EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-06808 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr12:11240392-11241470 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr12:11240792-11240811TAGCGCCACCTGCTGACAG-6.51
CTCFMA0139.1chr12:11240659-11240678TAATGCCACCTGCTGGCAG-6.63
CTCFMA0139.1chr12:11240394-11240413TAGCGCCACCTGCTGGCAG-8.36
CTCFMA0139.1chr12:11240525-11240544TAGCGCCACCTGCTGGCAG-8.36
KLF9MA1107.1chr12:11241087-11241100AGTGGGTGTGGCA-6.54
Enhancer Sequence
CATAGCGCCA CCTGCTGGCA GAAGAAATTT TGGCTTGTAA CTCGGCCACA CAATGTCAGA 60
TCTGCCTAAA ATGTCACATG GTTGATGAAA GTCCTCTCCT AAACACATCT ACATAATAAT 120
ATTGAGTCTT TCATAGCGCC ACCTGCTGGC AGAATGTAGT TTGTCTTAAA ACAAAATCTC 180
CACACAATCT CTGATCTGCC TGAAACTTCA CATGGTTGAT AAAAGTCCGC TCCTGAACAC 240
ATCCACATAA CAATATTGAG TCAGTCATAA TGCCACCTGC TGGCAGAAGG TAGTTTGGCT 300
TATAACTCAG CCACACAATG TCCCATGTGC CTGAAACTTC ACATGGTTGA TAACATTCTT 360
CTCCGGAAGA CATCTACATG CCAATCTTAA GTCACAGTTA TAGCGCCACC TGCTGACAGG 420
AGGAAGTTTG GCATAAATCT GTGATTTTCT TAGATCTTTT TTTATATATT GGCTTAAATT 480
ATTATTGTTC GCTGTTCTCT GTCATCGTAA GGTCACCGGG CGGCGGTGAG CCTGGGTGCG 540
AGGTCCCTAT CATCGCTGCT TGCAGCTTTA ATTATTATTA TTATTCTTTT CCGGAATGAA 600
TCGCGATTTT GAGGGGCTAA ACATAACCGA AAACTCACGG AACTTTGCAC ACACCTCAGA 660
AGTGGCGAAA ATTTACGTTT ATTATGGGTC TCGGAAGTGG GTGTGGCAAA ATGACTCGAC 720
AGCGCCACCT AGAAAAATTA AACGGACAAG CCCCCGATCT ACGAATCACG CACATGCACG 780
AAAATTGGCA CACACCTTAA ACATGCCAAA ACATACGAAA AAGTCTCTTG GAGCCATATC 840
TCAAACCCAA CAGGAAGTCG GATACTTTTA ACTTCCTGCG GCGAAAAAGT GGCGTTTTTG 900
CCATTTCCAG GCGTTGTATT TTAACGAACT CCTCCTAGGG ATTTTATCCG ATCGACACCA 960
AAATTGGGTT TTGTCATCTA AAGGCCTTGG CAATGTTAAA TTGCGAAGCT TTAGAGTTTT 1020
CGTCGATGGG CGTGTCCATG GCGGCCTCGC AAACTTTGAC GATTTGCCAC AAAACAGG 1078