EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-06119 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr11:42118771-42119806 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr11:42119724-42119743GAGCGCCCCCTGCTGGCCT-7.77
CTCFLMA1102.1chr11:42119725-42119739AGCGCCCCCTGCTG-6.84
SP1MA0079.4chr11:42119507-42119522TGGGGGCGGGGTTTG-6.37
Enhancer Sequence
TTCGGGGTGA GTGAACGCAG AAATAGGCGA CCTTTTTTTC TGTCTGCAGC TGCGCAGCAC 60
TTTTTTAGAC GGGGAAAACT GCAAGTTCAA ATGTGTTCTG TGTCCTCAAA CAAGTGTGTA 120
TGTTTTTAAA TAACGTGGTA AAATTAAAAA AGGAAATTTA AAATACATAA AGAGCTTTAT 180
TAGTGCATTG CTGCTGAGCG CAACGAAATA TAGGCAATAT TTTATTACGT GCTGCTCTTA 240
TGTGCTGAAA CACTGAACAC TTTCTTTTAC TTAAGATATA ATAAGCAACA TCTTTAAATA 300
AAGGGAATCA CCTATTAAGT GTCATAAAGC CTATAGGGGG AAAAAATCAT GTTTCAGTTC 360
TCTCCGGAGC ATTTGGGATG AATGTTGGAC AGGGTCTGTC TAGAGGATGT TATAAAATAC 420
ATTTTATATC GAGTTATTAA CGGAGAATTT TACATATGTG GTTTTATATT ATGGATGTGT 480
GCGCTCCCTG TGCTGGGTCC CTCCGTTGGT GGCAAGACCA CTGGATTTCG ATGCCAGTCG 540
GTCGGCGAGT AAATGAATAT GATGAATGAA AACACACAGG CATGTGCGTA TAGACATGCG 600
TTGTACTGCT GTACAGTAAC GTGTCATTTG TTTGTTTTGG TTGTCCTAAT TTTAATAGTT 660
TCGTGACGAT GTGCTTTATC TGCATGATTC TCGCTGAAGT GGGCGGTTTG AGTGACGTTC 720
GATTCGGGTT ATGTTCTGGG GGCGGGGTTT GCTGACGCGC TGCAAGCTAC TAGCCCCACA 780
GTGGAAACGC GACATGATTT CGGCCTCACT GCTCAACCTC CTGGGCGATT GGCCCGGCCT 840
GGCCCGATAT AAGCCCTGGC TCGCACTGGC CTGATAGTGG AAATGCGGCT ACTGATAGTA 900
TAGTGTCCCA TTTACTTTTA CTGGGGCATA AGGACTCACA CAGACCGCAG TTTGAGCGCC 960
CCCTGCTGGC CTCACTAACA CCACTTTTGG CAGCAGCCTA GTTTTCCCAT GTGGTCTCCC 1020
ATTCAGGTAC TAACC 1035