EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-06049 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr11:40415894-40417109 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr11:40416530-40416541TTAATTAAAAT-6.62
NRF1MA0506.1chr11:40416165-40416176GCGCATGCGCG+6.02
NRF1MA0506.1chr11:40416164-40416175CGCGCATGCGC-6.02
Rarg(var.2)MA0860.1chr11:40416092-40416109GAGGTCACGTAAGGTTA+6.57
Enhancer Sequence
TATTCTTTTC AATGAAGCTT TATTGACTAT ATATGTATAA TAGTTAGTCA TAAAGCGATT 60
AATGGTAAAA CTATTTATTT TTGGGCTCGG TTGTATAGTT TTTTTTCTAA AAACGGTCCT 120
ACAATAGATC TATTATTTAC TCAATCGATT CAAGCTCACG CCTTCGTGAA TTAAATCTAT 180
TGTTCGGACA CACATGTCGA GGTCACGTAA GGTTATTTCG TGCCGTCTTG CCCCCTATGC 240
CCCTTTTTAT TCCCCGGTTA CACTCGTGCA CGCGCATGCG CGCACACGCG TCGAGCTGGA 300
AACAAAAGGA GGTAGAGCGC GCGCCAAGAC AACGTGCTCG AGAGACTGGG GGCGGGAGGC 360
GCGAACGATT TACAGCACGC GGCGGCGATA TTCCCGCCTA TTCGAGCGGC AGAGATCAAG 420
AGCCCTGACT TTACACACAC ACACACACAC ACAGACAAAA AAATTCAAAG AAAGAAAAAA 480
TGGCAGATGG TTCACCAATT CACTCCCCCC GATACCCTAC ACTTAACGTT AATGGGATAT 540
GATTACATAT GGGAATAGAC GTCGAATTCA CTTCTCACAG AGGTTTGTTT CAATTCTTCA 600
CTTACTGTTG AATGAAAATG TTTTCCTTTT TAACCGTTAA TTAAAATATG ACGCGAATAA 660
ACGGAAAAAT ATTGCTAATT GAAGAAAATA ACCATTCACA CATTTCCGTT AAGTAACGTT 720
ATAAAAGAAA CCGTTGAGAA CACCTCCAAC GTTAATCGAC AGATTTCTTT TTCTCTTTTT 780
TATTTCCAGG TAAGCCCTTT TACATCAAAT ACATCGTATT CAGGTAAACT TACCTTTGCG 840
GTGATCTCGG AGGTGGTGGT TGTATCAACA GCGGTATCGG CCATGGTGGT TTATAGAGAT 900
GATTTAAAGA AAAATGTCCG AGAAAGCGTT AAGAGAGGTG GGATGAGGTA GGAGACGGTC 960
GGTCGGACGG ACGTGAGGAG GAAGAGTGAA TCAAAACTGC CTGAACCTGA GAACTGAAAG 1020
GCACGTCGAG CGCAGCGGCA ACCACACTGA TATCTGATTG GACAGGAGCA CAGCAACGTA 1080
AATCCGTTCT TTGATTTGAT TGGTGAAGCC ACTGTCGATT GTCCTCCCCT TTGCCCGCCT 1140
CAGTGTAGTG CGTCCTTCTG GTCTTATTGG TGGAATATAT AATTTGACTC TTTACCCGGT 1200
CTTTTAAAAT TCATG 1215