EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-06020 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr11:39690646-39691324 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr11:39690772-39690789TTAATTAATTAATGACC-6.06
EWSR1-FLI1MA0149.1chr11:39691141-39691159GGTAGAGAGGAAGGAGGG+6.09
Lhx3MA0135.1chr11:39690773-39690786TAATTAATTAATG+6.46
Lhx3MA0135.1chr11:39690769-39690782TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr11:39690770-39690783AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr11:39690766-39690779GAATAATTAATTA-7.12
PBX2MA1113.1chr11:39690902-39690914CCTGTCAATCAC-7.22
PBX3MA1114.1chr11:39690899-39690916CCACCTGTCAATCACTT-6.14
POU4F1MA0790.1chr11:39690764-39690778ATGAATAATTAATT+7.82
POU4F2MA0683.1chr11:39690764-39690780ATGAATAATTAATTAA+7.91
POU4F3MA0791.1chr11:39690764-39690780ATGAATAATTAATTAA+8
POU6F1MA0628.1chr11:39690771-39690781ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr11:39690775-39690785ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr11:39690771-39690781ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr11:39690775-39690785ATTAATTAAT-6.02
RBPJMA1116.1chr11:39690646-39690656CTTTCCCAGG-6.02
SOX10MA0442.2chr11:39691222-39691233AAAACAAAGAC+6.14
SOX10MA0442.2chr11:39690834-39690845GTCTTTGTTTT-6.14
Enhancer Sequence
CTTTCCCAGG CCAGCCGAGA TATATAGTCC CTCCAGCGTG TACTGTAAGG GTGTCACGAT 60
CCTCCAAATC CTCGATTCGA TTACATTTTT GATTCTAAAG GCACGATTCG ATTCGATTAT 120
GAATAATTAA TTAATTAATG ACCAATTAAT TATTTGTAGC CTACCGTTTA AACCACCTGA 180
CCTGCATGGT CTTTGTTTTA CCCATAAACA AATCATACAG TAAATGAATA AAGGCAAGAT 240
ACACACATAA TTACCACCTG TCAATCACTT TTTCTGCGGG ACTCGTGAAT GGGCAGTGAT 300
CTGTGTCGTT ATAATGGCGT CGGTAAAAAA GACGCACAAC AGGAACCAGC CAACAGTATC 360
TGAGGTGTTC GCTAAAATGA CTAAGTACAA GTGAGTGAAA GCTTGAAGCA GTCCTCTGAC 420
TGCCTGGACC TGCTGTCTCG AGCGCATGGC TGTGTGTGCG TCTGTGTCTG TGTGGTCATG 480
TGATGTGCAT TCAGAGGTAG AGAGGAAGGA GGGCTGCTCA GAAACGCTAC ACGCCACTGT 540
GGATGTCAAA TCGTTGTCGT TCTAAAATGC CATTTAAAAA CAAAGACAGT GTAAACAGGG 600
CCTGAGTGTG TACTTTTCGC GAGCGGATTT GCAACGGGGG TGGACGGAGG AACGCGATGC 660
CAGTGTTGTC TATCGGAC 678