EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-05889 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr11:34715413-34716518 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE40MA0464.2chr11:34716497-34716507GTCACGTGAT-6.02
CUX1MA0754.1chr11:34716163-34716173TAATCGATAA+6.02
CUX2MA0755.1chr11:34716163-34716173TAATCGATAA+6.02
FOXK2MA1103.1chr11:34715953-34715964ATGTAAACATG+6.14
HNF1AMA0046.2chr11:34716245-34716260GATTAATCATTAACT-6.31
HNF1AMA0046.2chr11:34716245-34716260GATTAATCATTAACT+7.58
HNF1BMA0153.2chr11:34716246-34716259ATTAATCATTAAC+6.02
HNF1BMA0153.2chr11:34716246-34716259ATTAATCATTAAC-7.34
HOXA13MA0650.2chr11:34715452-34715463GTTTTATTGGT-6.32
HOXB13MA0901.2chr11:34715452-34715463GTTTTATTGGT-6.32
ONECUT1MA0679.1chr11:34716160-34716174TAATAATCGATAAT+6.17
ONECUT2MA0756.1chr11:34716160-34716174TAATAATCGATAAT+6.32
ONECUT3MA0757.1chr11:34716160-34716174TAATAATCGATAAT+6.05
SREBF2(var.2)MA0828.1chr11:34716497-34716507GTCACGTGAT-6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr11:34716497-34716507GTCACGTGAT-6.02
TFEBMA0692.1chr11:34716497-34716507GTCACGTGAT-6.02
Enhancer Sequence
TTAATTCAAA CATGAACTGT AAAATAAAAC TAAATGTATG TTTTATTGGT ATTACCTCAT 60
TTTGATGGCA CATTTCGATG ACTATAAGGC CCCGTTTACA CTAATGCGTT TTAGTTTGAA 120
AACGCATAAG TTTTGCTACG GTTACGCCAA TTCGTCCACA CTACGCCGGA GTTCTCGGGC 180
GCCGAAAACG GAGCGTTTCG AAAACGCTGG AGATGCCGTT TTCATTCTAA AACGCTGCTG 240
CTCCGTCTCA GTGTGGATGG GGAAAGACGG AGACATCTGA AAACGGAGGC GGGGCTGCAA 300
ACGTTCGCCT ATCTGATTGG GGCTTTTCCT CAATATTAAG TAGCCCACAC ACAGTTCAGT 360
CTCGCATCCT CTTCTTGTAA GTTAAGACTT CGCAAGTTTG ATCAAGGCTG CAGTCTCCCC 420
CTTCTCAGTT TGATATGGAA AACATACCGA GGACACGGGT AAATCTTCAA AGGGAACAGT 480
GTACTTTATA ACTTCATTCA CATCACCTTG GCTACGTTGT TTCACTTTCT CAACAATAAA 540
ATGTAAACAT GATTTAAGGA ACTGCCTATT TTCTTTTTAA TATTAGCAAC TTAACAGACA 600
GCAGAACTGT TGAGGCGCCG TGCTGCATTT ATGAGCGTCA TCTTCACTGT GTGGATCTTT 660
ATAACAAAAC GGAGCCGATA ACAACTGCCT CCTTTCAATT TCAGTGAAAA TACGAAACGC 720
ACCCTCTCTT TTGCTGAATA TCAGTTTTAA TAATCGATAA TTATAAAAGT ATAACATACA 780
ATAAGTTTAT ACATTGTAGG AAATAAAGGC AAGCGATCGG TCAATGTACC TGGATTAATC 840
ATTAACTTAT CTTTGCGCTT AACCAAAACA TGTTACCCGT GAACAAGTAA CTTAATAGAT 900
TCCAATGACC AAAGTCAGGG AATTGGCCTA TGTCGTTAGA TAAAGACAAC AACATGAATG 960
AAATATCACG TTTAGCAAAT ATAGTGAGAT TAGATCCAGC GGGAGATGCT TGATGAGCAG 1020
TCCGACAAGC AGAGCTCTCA TCTGGGTAGA AATGCTGGAG CGCTTGCCTG AGTGTGTGTG 1080
TGTGGTCACG TGATGTGCGT TTTCA 1105