EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-04400 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr10:45438869-45440046 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr10:45439196-45439217TCAGTCTTTCACTTTCACTCT+6.5
Lhx3MA0135.1chr10:45439470-45439483TATTAATTAATTA-6.25
PBX2MA1113.1chr10:45439347-45439359GTGATTGACAGG+7.22
PBX3MA1114.1chr10:45439345-45439362AAGTGATTGACAGGTGG+6.14
POU4F1MA0790.1chr10:45439492-45439506ATTCATAATTAATT+6.33
POU4F3MA0791.1chr10:45439492-45439508ATTCATAATTAATTCA+6.33
POU6F1MA0628.1chr10:45439471-45439481ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr10:45439471-45439481ATTAATTAAT-6.02
PRDM1MA0508.2chr10:45439204-45439214TCACTTTCAC+6.02
RREB1MA0073.1chr10:45439119-45439139CCCCCCCACACACACACACA+6.17
RREB1MA0073.1chr10:45439121-45439141CCCCCACACACACACACACA+6.95
SOX10MA0442.2chr10:45439411-45439422AAAACAAAGAC+6.14
mix-aMA0621.1chr10:45439474-45439485AATTAATTAGG+6.32
Enhancer Sequence
ATCTGGGTTA GTGCAGACTA GGGTTGGGCT GATAGATGAT GCCATCGGCA ATGGCCCACA 60
AACACCGCGA TCCTCCGCCC CCGTTGCAAA TCTGCTCGTG AAAAATACAC ACTCACACCC 120
CGTTTACACT AATAGGTCTT AAGTTTTAAA TGGCAATTGA GAACGAAAAT GGTCCACATC 180
CACTCTGGCG TTTAGTATTT CCTGAGCAGC CCTCCTTCCA CAATACTGCC GAAAACCCAC 240
ATCATGTGAC CCCCCCCACA CACACACACA CATTCAAACA CAGGCACACA CTGTCATGCG 300
CACGAGACAG CGGGTCAGTA CACTGCTTCA GTCTTTCACT TTCACTCTTG TAATTTTAGC 360
GAACACCTCA GATACTTTTG GCTGGTTCCT GTTGGTTCTT CACCTTTTTT ACCGACGCCA 420
TTATAAGGAC ACGGATCACT CCGCCTATCC ACGCATATTC ACGAGTCCTG CGGAAAAAGT 480
GATTGACAGG TGGTAATCAT GTGTGTAACT TGATTAATCT ACTGTATGAT TTGTTTATGG 540
GTAAAACAAA GACCATGCGG GTCAGGTAGC TAAAACGGTA GGCTACAAAT AATTACTTCG 600
TTATTAATTA ATTAGGCCTA ATTATTCATA ATTAATTCAC TGCCATGATG CCATAGTCCA 660
TCGCAATGTT TCATATTAGA CATCGTACGA TGCCAAATTG GTGGACATCG CCCAAATTGG 720
ATGAGCTGAT TGCAAATATG TCCACCCACT ATACGGACTT TCCTTGAAAG GGACTTTGGC 780
GTGGCTCTGT GTTAGCGTAG CGCGGCCGCT ATTAGAATAA TTTTCTGCTC TAGTCTCCAT 840
CGAGTGACTC TGTCAGCGTT CATCAGCCAA AACATCAGTC AGTCAACCTG TTTCCCTCCA 900
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA GAGAAAGACG CTGCTGTGTG 960
CAGACTTGGT CACGTTGCAC TCTCTCTCTC ACACACACAC ACACACACAC AAACACACAC 1020
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACGC AGGAGTCAGA 1080
CAAGTTTATC AAGCACAGGC CTTCACTCAG CCAGCTCTGC TTCTGCAAAG GACAGTCAGA 1140
GGCGTAACAA AGTCATTAAA GGAGAATCAA TACAATG 1177