EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-04394 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr10:45411651-45412753 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr10:45411897-45411914CGAATTAATTAATTGTA+6.19
Lhx3MA0135.1chr10:45411898-45411911GAATTAATTAATT+6.29
PBX2MA1113.1chr10:45412001-45412013CCTGTCAATCAC-7.22
PBX3MA1114.1chr10:45411998-45412015CCACCTGTCAATCACTT-6.14
POU6F1MA0628.1chr10:45411900-45411910ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr10:45411900-45411910ATTAATTAAT-6.02
Sox3MA0514.1chr10:45411945-45411955CCTTTGTTTT+6.02
Enhancer Sequence
CACAAACTAA AAAAACATCG CTGCAGCTCT GATACAAGTT TAATTATGGA GAACAGTAAA 60
AACACTTGGC GTTTTGTGTT TGTCTGAGGT AATTACCCTA CCATTATTAC TGAAATGTGG 120
GTGTTCCATA CTAGGGTTGG CCAATTTAGC ATTGTACGAT GTCCAATGTG AAACATTGCG 180
ATGGACGATG CCATCGTCGT CGTAGCGGGG GGTGAGGGTG GTTGTTAAAT ATCAATTAAT 240
TCATAACGAA TTAATTAATT GTAGCCTACC GTTTTCGCTA CCTGACCCAC ATGGCCTTTG 300
TTTTACCCAT ATCCAAACCA TAAATAAATT CAGTCACAAA CAAATGTCCA CCTGTCAATC 360
ACTTTTTTTT CCCGCGGGAC TCTGGCATGA ATATGCATGG TGATCTGTGT TGTTCTGATG 420
GATTTTCCCA CAGCTTTTGG AGGAGATGAG AGTTTAGTTG GAGTTCATTG TGGTGTATAC 480
ATTTTCATTG TTTTCACAGC AAAATCCTCA CCGCGTGCAC GCATTAAGGA GACATTTACG 540
CAGAATGCAT CTTTAAACCT AAAAACACCA AACGCAGCAC TCAGGTACAG ATTAAAACAG 600
TTATGTGAAC TTGCTGAAGT AAAAAGCCTG CAATGCTTGC CCCTCCTTTG TGCTCTTCTT 660
ATTGGCCCAC TGCTCTAGAA CTGAACAGGA ATGATTGGCT AATGTCAGCC GTCAATCACT 720
CAGTCAATCC TTCAGATGAC AGGAGCTACA ACTGCAAAAA TGTGAAGCGC TGAAGATGAG 780
AGAATGAAAA TAACACTGGC AGATTTACCT ACAGTTACTA ATAATGGCGC ACATTATTAG 840
TGATCATGTG CTGAATGTTA ATCCACCATT TACACTTTTC CAAGAGTGGA GAAAAGACTT 900
CCCGTGTTTC AAGTTCACTA TAAAAAAATA ACTAAAGCCA TTCGCTGTAC AGTCTGTGGG 960
ACGGGGTTTG CAGGTAACAG CATTTGCCAC TGAATCTCCA CACTTTAAGC GTGAGAGGTG 1020
CTGTATAATC CTTCATTTAA TTCTCACCAT GCTGTCAGCC AAACAAGCGG CAGCTATATG 1080
TAACATTTAA CACAGCTCAT GA 1102