EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-02842 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr10:9686432-9687990 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr10:9687848-9687867TAGCGCCACCTGCTGACAG-6.51
CTCFMA0139.1chr10:9687715-9687734TAACGCCACCTGCTGGCAG-6.79
CTCFMA0139.1chr10:9687145-9687164TAGCGCCACCTGCTGGGCA-7.69
CTCFMA0139.1chr10:9687450-9687469TAGCGCCACCTGCTGGCAG-8.36
CTCFMA0139.1chr10:9687581-9687600TAGCGCCACCTGCTGGCAG-8.36
IKZF1MA1508.1chr10:9687030-9687042AAAACAGGAAGT+6.74
KLF13MA0657.1chr10:9686651-9686669TTGAAGTGGGCGTGGCAA-6.21
KLF14MA0740.1chr10:9686654-9686668AAGTGGGCGTGGCA-7.73
SP1MA0079.4chr10:9686655-9686670AGTGGGCGTGGCAAA-6.18
SP3MA0746.2chr10:9686655-9686668AGTGGGCGTGGCA-6.71
SP4MA0685.1chr10:9686653-9686670GAAGTGGGCGTGGCAAA-6.99
SP8MA0747.1chr10:9686655-9686667AGTGGGCGTGGC-7.22
SPICMA0687.1chr10:9687029-9687043CAAAACAGGAAGTC+6.22
Enhancer Sequence
CAGCACCAAA TTTGAGTGGT GTTATCTGAA AGCTCTAGCA ATGATATATT GTAGAGATCT 60
AGAGTTTTCG CAGAGGGGTG TGTCTGTGGC GGTATGACAA ACCTCAACGC TTCGCCATGG 120
ATCAGGAAGT CCTTATAACA CAACCACACA ATGTCTGATC TGCCTGAAAC TTCACATGGT 180
TGATAAACGT CATCTCTTGA ACACATCCAC ATAACAATAT TGAAGTGGGC GTGGCAAAAT 240
GACTCGACAG CGCCACCTAG AAAAATTAAA CGGACGAGCC CCCGATCTAC GAATCACGCA 300
CATGCACAAA AATTGGCACA CACCTCAAAC ATGGCAAAAC ATACGAAAAA GTCTCTTGGA 360
GCCATATCTC AAACCCAACA GGAAGTCGGA TATTTTTAAC TTCCTATGGC GAAAAAGTGG 420
CGCTTTTGCC ATTTTCAGGT GTTGTATTTT AACGAACTCC TCCTAGGGAT TTTATCTGAT 480
AAACACCAAA ATTGGGTTTT GTCATCTTAA AGCCTTGGTG ATGTTAAATT GCGAAGCTTT 540
AGAGTTTTCA TCGATGGGCG TGTCCGTGGC GGCCTCGCAA ACTTTGATGA TTCGCCACAA 600
AACAGGAAGT CTTTATAACT CTGGCATGCA ATATTTGATC TGCTTCAAAA TTCACACATT 660
TAATAACAGT CCTGACCTGA TCAGGTTTAC ATGCCGATAT CCAGTTACAA ATATAGCGCC 720
ACCTGCTGGG CACAGGAAAT GACATGTTTG ACACTGTAAC AAACTCCTCC CACAAACTTT 780
CCCGTATCAG CACCAAAATA GAGTGGTGTC ATCTGAAAGC TCTAGCGATG ATATATTGTG 840
AAGATCTAGA GTTTTTGCAG AAGGGCGTGT CTGTGGCGGC ATGACAAACC TCAACGCTTC 900
GCCATGGAAC AGGAATTTCT TATAACTCAA CCACACAATG TCTGATCTGC CTGAAACTTC 960
ACATGATTGA TAAAAGTCCT CTCCTGAACA CATCCACATA ACAATATTGA GTTAGTCATA 1020
GCGCCACCTG CTGGCAGAAG GTAGTTTGGC TTGTAACTCG GCCACACAAT GTCCGATCTG 1080
CCTGAAACTT CACATGGTTG ATGAAAGTCC TCTCCTAAAC ACATGTATAT AATAATATTG 1140
AGTCTTTAAT AGCGCCACCT GCTGGCAGAA TATAGTTTGT CTTTAAACAC AATTTCCACA 1200
CAATCTCTGA TCTGCCTGAA ACTTCAGATG GTTGATAAAA GTCCGCTCCT GAATACATCC 1260
ACATAACAAT ATTGAGTCAT TCATAACGCC ACCTGCTGGC AGAAGGTAGT TTGGCTTATA 1320
CCTCAGCCAC ACAATGTCCC ATGTGCCTGA AACTTCACAT GGTTGATAAG ATTCCTCTCC 1380
GGAAGACATC TACATGCCAA TCTTAAGTCA CAGTTATAGC GCCACCTGCT GACAGGAGGA 1440
AGTTTGGCAT AAATCTGTGA TTTTCTTAGA TCTTTTTTTA TATATTGGCT TAAATTATTA 1500
TTGTTCGCTG TTCTGTGTCA TCGTAAGGTC ACCAGGCAGG GGTGAGCCCG GGTGCGAG 1558