EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-02737 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr10:7637917-7638611 
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr10:7637955-7637972AATAATTAATTAATTCA-7.27
BHLHE40MA0464.2chr10:7638400-7638410GTCACGTGAT-6.02
HNF1AMA0046.2chr10:7637940-7637955ATTTAATTATTAATG-6.07
Lhx3MA0135.1chr10:7637958-7637971AATTAATTAATTC-6.29
Lhx3MA0135.1chr10:7637957-7637970TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr10:7637954-7637967GAATAATTAATTA-7.12
PBX2MA1113.1chr10:7638084-7638096CCTGTCAATCAC-7.22
PBX3MA1114.1chr10:7638081-7638098CCACCTGTCAATCACTT-6.14
POU4F1MA0790.1chr10:7637952-7637966ATGAATAATTAATT+7.82
POU4F2MA0683.1chr10:7637952-7637968ATGAATAATTAATTAA+7.91
POU4F3MA0791.1chr10:7637941-7637957TTTAATTATTAATGAA+6.42
POU4F3MA0791.1chr10:7637952-7637968ATGAATAATTAATTAA+8
POU6F1MA0628.1chr10:7637959-7637969ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr10:7637959-7637969ATTAATTAAT-6.02
PRDM1MA0508.2chr10:7638178-7638188GTGAAAGTGA-6.02
SOX10MA0442.2chr10:7638022-7638033GTCTTTGTTTT-6.14
SREBF2(var.2)MA0828.1chr10:7638400-7638410GTCACGTGAT-6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr10:7638400-7638410GTCACGTGAT-6.02
TFEBMA0692.1chr10:7638400-7638410GTCACGTGAT-6.02
Enhancer Sequence
CATCAACATC AAATGCGGAG GTGATTTAAT TATTAATGAA TAATTAATTA ATTCATAACA 60
AATTCATTAT TTGTAGCCTA CAGTTTCAAC CACCTGACCT GCATGGTCTT TGTTTTACCC 120
ATAAACAAAT CATAAATAAA TAAAGATAAG TTGCACACAA ATTACCACCT GTCAATCACT 180
TTTTCTGCGG GAGGTTGGTC GGTAGAAAAG TTGCACAACC AACAGTATCG GAGGTTTTCA 240
CTAAAATAAT TAAGTACAAG TGTGAAAGTG AAAGACTGAA GCAGTGTACT AATGCTGCGA 300
CACGTTACCT GATAGATTAA AAAAACAAAG AGTCGTTAGA TATAGACAAG ATTAATTAAA 360
TATCTTGTAT AACACCTATA GTAAGACGCG ATTAAGCGAT ACACTCTTGA TAAACTGTCC 420
GACTTGCACA GCTCACTGGA GCTCACATGA GCGCGAGTGT GTTTGGCTGT GTGTGTGTGT 480
ATGGTCACGT GATGTGCATT TTCAGCAGAC GGAGGGCATC TCAAATGCTA GGTAAAACAC 540
TGTGTGGATG TGGATCATTT TCGTTCTAAA ATACCATTTT AACACTTGGT GTAAACGAGG 600
CCTTAGTGTG TATTTTTTGC GAGCTGGTTT GCGATGGGGG TGGGGCGGAG GATCTGCGAT 660
GCCAGCTCAG CATAGTGTTG TTTATTGGCC ATCA 694