EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-02551 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr10:3171955-3173353 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr10:3173187-3173198AACCACTCAAG-6.32
RARAMA0729.1chr10:3171956-3171974CACTGACTTTCTGACCTC+6.36
ZNF24MA1124.1chr10:3172737-3172750AAATGAATGAATT+6.32
Enhancer Sequence
TCACTGACTT TCTGACCTCT CCTCAAAAAC CAGAAGTCCC ATCCCAGAGA TGAAACAACT 60
CTAATCAGAG AGATTGCTGA AAAACAGCCA AAGTGCAAAA CCGACCAGTA ACAACACAGG 120
TAAACAAGTC TAGCAAGGAC TGCGCTTAAC CTCATAAACA AGCTTATCCG GTGGCATGAA 180
CCCCCGAGGC CACACATTTT ATTGTCTTAA TGCCATAAAA ACACAGAGAG CACCTTTGCT 240
GTTATGAGAG AGAGCATTGG CCAAACAAAA CATTATTCAT GAGATGCAGG ATAGTATATC 300
TTCCCTACGG CGATTTTACA AATGTTTCAG TGAGCGGTGA AGACTATTAA AACTTCCACA 360
TTAGCCAAAT ATTGATTGGA GTTTAATAAG AGGCTGGTTA ACACTTCTTT AGATAATGCC 420
TGCAGACATT AGGATCTAAG TGCTTACTGT AACCAACCAC CAGCCTCCAG AGACACAGGC 480
CAAGCAAACC TGATCCAAAT AATCTGATGA GCGACCTTAG CTAAGGGATA ACACAATATC 540
ACTTATCTGA AGAATTCAAA GCCTTGGTCC ACTGGCTATC CTCACTTAAT TCAATATTGT 600
GCCCTATTTG TCCTATAAAG AAATTTGGGC TTTTTATTCC CAGTAAAAAC GAGTGTAAAT 660
ATCTTTATGT TGTTGATGAA AACTGCTGAA TAGCGATGAA ACCATTCTCA GATAAGGGTT 720
TATTGTATTG TACAGTATTT AGTTTTATGA ACTGTGACAT GTCCTTTCAA CAACCCAAAA 780
ATAAATGAAT GAATTCAAAG GACAGATGAA GGAATACCTA AGATTTTAGT TTGGATTAAC 840
ATGCAGGAAA GAAATCGCAC ACCATAATCA TGCACTAAAT CAATCGTGCC AAAAAGTCAA 900
CTAGCATTGT GTTTACGTTA TTGATCATTT GACATGCAGT CGTACTGATT TTAAACCAGC 960
AGGGCACTTA TTGCATCTGT TCAGGCGCTC GCTGCAGTAT TTTGCAGATA AATCGAAAGT 1020
AAATCAGGGT TCATATTCAT GTCATCCATG GGCTGGGCTA AAAGTCGCAG AATACCTGAG 1080
AAACTAGATA TCAAACTCAT CTGTGAAACC AAGTAGCGCT TCTACTTTAA ACAAAATGTA 1140
ACCGAAGATC ATAACACAAA CAACATTCAG TGTAAGAGAG ACGCTATTTC TCTGTGATAG 1200
TAATCAACGA TTAGAGAATC TGGGACAAAA ACAACCACTC AAGCAGATTG GGCAACCCTG 1260
GAATAACCCT CAATAAATAA CTCGCATTCG TATTAGTCAA CATCTCCGCA CACCCATGCG 1320
ATGTAGGTTT TTAGCCCATG AAGTGGTTAA AAGGTTCCAG GTTGAAAGGA TCTAGTCAAT 1380
AAACATGCCA AGCATGTT 1398