EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-02252 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr1:56266675-56268919 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NFYAMA0060.3chr1:56266695-56266706AGCCAATCAGA+6.32
RORA(var.2)MA0072.1chr1:56267683-56267697CTGACCTAATTTTC-6.31
RORCMA1151.1chr1:56267684-56267696TGACCTAATTTT-6.02
Enhancer Sequence
CCTATCTACA CTCATTAGTT AGCCAATCAG ATCTATCCTA ACCCACTATA AGTAGCCTAG 60
CTAGACATTA CTCCCTTATC TTCGTTTTCC GAAGAAACAA ACGACAGGTC CGCTCTAGCT 120
CCTCCAAAAG TTACTCACGG ACAAAACGGA TCCTCCACAT CTCCTACTAT TCTTCAACTA 180
CAATACCACA CCACCTTTAA TACCATCGTC AGCAAATACA AAAAATGACA AAAACAACAA 240
CAACAGCGAC GGCGGCTGAG ATCACAACAG CATCAGCGCA GCTACATACA AGAAAGAAAG 300
CTCCGGGCTC CCTGAAACAC CAGCCCCGTC TTAACAACAA CCAGCCCAGC ATGAAAGTCA 360
GCTCGAGACC GAGGCTCCAA CGAGAGGCCG TAGGCCTATC CACTCCAGCC AGATCACAAT 420
GCAATCCCCA GCTCCGCTAC GTACCTTCTC CAGCATCATC ATGTGTCACT TATATCCAAC 480
AACGACTGTC ACTGAACTCC TCCAAACTCC TAGACGCCGG GACCATAATT CAAAGCCGCT 540
GCATTAAACC CAAAACACTT GCGAATCCAC GTCTTCACCG CCACCCCCAG GACATAACAC 600
GCTCCTGCCA CACCCCCTAT CCTAAACAGA CATTAAACCC GCAATCTCTC CGCCTCCCCG 660
GAGAATCAAG GAAAGGATTA AAAAGCAATA TTGGATTTGG ACATATTGCA GCAATCATAA 720
TTCTAAACAC GGATAAAACC TATCTCCCGG ACAATAAAGC AAATCTTGGG AATCCCACCT 780
CACCTCTTCC ATCCTGCAGC TCCCGATTCC AGTGCACACT CCAGTCCTCC TCTTTCAGCG 840
ATCCTTACCA CCTACGCACC CCGCCCCTCT ACCTTGCGTA TCATTGCTTT TTCCCCCTCT 900
CATTTTTACA AGCTCGCAGC TACTGCTGAT TATTTTCTAT TATAAAATAG AAATTACTTG 960
TCGACTTTTG TCAATATGTT TATGCTTTTT ACTGAATTAC GTTTGTAACT GACCTAATTT 1020
TCTGAATTTC TCATTCCAGG TTTCGTCTAC TGAAGCACAG CCGATCTCGG CGCTCCCTTC 1080
CCACAACCTC ACTAGCCGTC CACCAACACT ACACCAGAAA TCACAGAGCA ATTCCCTGTT 1140
AAGCACATCC ATACCAGCCC TACTGAAATG GACATTAGAA CGTTTCTAAA AACGTCTAAT 1200
AACGGCTCTT TCATCTCCTC ATAATTCTGC CTTTTTCAGC TTTAACAGCA TGATTCTACC 1260
TGATGAATAT GCTTAAATTA TCACGTTATA AACCAAGCAA TCTCTCTAAT CTAGACGGCT 1320
GCAGCGCTCG GTTGCAATCA ACATTACACC CGCCACCCGA TTTCTGGCAA TCGGAGGTCA 1380
CAATTACATT TCGTAGTCCG TTTAACATTC GGATGCAAAA GTAGCCCACA CATTTATGCT 1440
TAAAAACGAT CCGCTGGATT TCGCCAATAA CTACGGTGTT TGCACGTAAT TCACCTACAA 1500
GTTCCCGTTT CTCTCTCCCT AATATCCCCC AGCTAAACTA GTGACCGGTT TTCTAATATT 1560
TGCATTCTCA TTGCGGAAGA ACCTCCGGCT AAGCACTTCT ATAGAATTCT TAAGCATCAA 1620
TTTGGAGTGA TAGAATTTCA AGCATTAATA AGCTACTTGA ATAAATCGAC AATCAGTCCC 1680
CTTTTATATT CTGGAAGAAA AATATCACGC TAAGCATAAA CTGCTCTCCA TCTAGCACAT 1740
CAAACACACA TGCGCATTAT CCCGCAGGGA TGCCTTTTCG TCACTCACCT ATTTCATCTC 1800
GCAGCAGCAA TCTCCGGAAT AGAAGAGAAA TGATCTAAAT CCGATCTTGG CCGTAACAAA 1860
CTCTGCCCGA AGGGCGTCGC GCACCAGAGG CGCCGACGGC GCGGTGACGC GACGCACTTA 1920
CGACAGAGAA TAGTAGATTA ATGCACACCA GACTCACGCA TTCATACTTT ATCAAATAAA 1980
CTAATCAATT ATACAAATAG CGCTCCGCGG CGCGGCAGAA TACGAAGTGT CATGAATTGT 2040
GGCTGGGCAC TACGGACAGC CGCATTGACT TCCTTATTTA TTTCTTTCCT GTGAAAGTCA 2100
ATGGTTACAG GTTTTCAGCT TCTTCAAAAT GTTGTCTTTA GCGTTTAACA CGGGAGTCAC 2160
TAACCTCTAA AACTAAGAGC TACTTTCGGG CACCGATTAA CGTGGAGGGC TACCAGTTGG 2220
ATAAACACTT CTCAAATAAC AAAT 2244