EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-02140 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr1:53158811-53159812 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PHOX2AMA0713.1chr1:53159174-53159185TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr1:53159174-53159185TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr1:53159174-53159185TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr1:53159174-53159185TAATTTAATTA+6.62
TCF7L2MA0523.1chr1:53159254-53159268GGAGATCAAAGAAA+6.21
Enhancer Sequence
GGTGTTTGTT GTCTCATCTG TCATCAGATT AATTATTCTG TTCTATGTGT GTGAGGCTAA 60
TGTGTTTTGT TTGTATAAAT ATGGACAAAC GATAGATTTG ACTCCTGGGT CTTTGAAGAC 120
TGAGGTGTTA TCTATGTGCC TGGGTTTACC TGTGGCTATG TGTCAGTGTA ATGCTCCGAA 180
CAATGGTAAT CAACTTTTAT AATTGTGTTG CAAAATTTTA GTCCTGTCTT AGCAGGGAGC 240
CAGCATAAGA ATGTGAACAT GAGGTGTGTT CCGGCTCAAA TTGATTCCAT ATAATATCTT 300
TTACGGAGCA TGTTAAGGTG CAATGTTCAA AGCTGGATCC TGTAAAAAAT GCATTTTCAT 360
GGTTAATTTA ATTATCACAC TCTATACTCC TGTTTGTAGT TCAAACTGCA GCTATACAGG 420
GGATAGCAGA GTTTTCTACT TTTGGAGATC AAAGAAACAA ATATCATGAA TTTCAACATA 480
GTTAATTCCA TTTTCATACA GGACATGTGG TTTAACATGT GTATAGTATA AAAACAAATT 540
TAAAAATGCC ACCAGGATTC TTAACAATAG AGTCTTTTGC TATTGTTCTT GCAAGGATAA 600
TGCAGTGACG TTTATTTTTG CCTCTAGGTA ACCAGGCTTT TAGTCCCATT GCTATTAAAC 660
AATTTGGGAA GATTTTAACT ATGAGATCTT TTTGTGTCTC TGTTTCATTT GACATGTAAA 720
TTTACATCTT TGTTGAAGAA AGATGTTTTG TGAAATCACA TAGCCTCCTA GAATGCTGAA 780
TCCATTGATA AGATCAGCTG TGGATAATTG TTATTCTGAT GACTGATCAA AGACTTTTTC 840
AGAAGACTCA CTGCAGGAGG TGAGGGATTT GCCTCACAGG GGTTCTTGCT TTGAGATGCA 900
AGATGGGAGA CTTTTGGCCT CCTAGGTTAT GGCCTAACCT TTTGTCGCCC TCATTTGTAT 960
TTGTTTGATG TGGACCGGAT CTTGAGTGTT CTTTGTTATT C 1001