EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-01090 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr1:27791755-27792697 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:27792529-27792541AAACAAACATTT-6.27
LMX1BMA0703.2chr1:27791790-27791801TTAATTAAATC-6.02
POU4F1MA0790.1chr1:27792558-27792572GTGCATAATTTATG+6.74
POU4F2MA0683.1chr1:27792558-27792574GTGCATAATTTATGAC+6.55
POU4F3MA0791.1chr1:27792558-27792574GTGCATAATTTATGAC+7
SOX10MA0442.2chr1:27792034-27792045TGCTTTGTTTT-6.02
Enhancer Sequence
ACGTATAACT GAAAAGTTAT TTTCTTTGGT TTTTTTTAAT TAAATCATTG CATGGACGTG 60
CCATATAGGA GGGACATTTA ACCTTGCCTT GCTGACTACA GACTTCATTT GTATGCTAAA 120
GTGATGTAAT TAATGGTTTC ACAGCATGGC TGTATCTATT GTATTCCCTG TCTCCAGAAC 180
ATCATTTGCA AATTGTTGTA ATGATGTACT TATCTATTGA TGAGATCAGC ATGGCACCCA 240
GACTTCATTT GCAACCATGG CACCCAGACT TCATTTGCAT GCTTTGTTTT ACTGTCCCCC 300
ATGACTGACC CCACCTACAT GCTGTAAGAT GTATAAAATG TATTATGTTT TGCTGTGGAG 360
TTGAGAGTTT GCTTTCGATG ACGCCACAGC CACGCTGAGT TTCCTCTTAT TAAAAAGGAT 420
TCTGCTTTGA AGACAACCGA AAGATTCTCC CTGGTTTTTT GTGGGCTCTT AGAAGTTTAC 480
AACAACGCCA AAGATAAACT TTTTGAGGTT TGGGGAGATT CATCACTGTG GATTCTCTTG 540
TATTGCAAAA AAGAGAGGAG AGCATTGGAT CCTGGTGAGA AAATCTTGCA TAATTTCACC 600
TTTGATATAA GGGGCTTGTT TTGAGTTTAA TTATTGTGTT TTTTCTGTTT GATTTAAAGA 660
GAGCCTTGGA GATCCCACTT TGGAGATGGT GTTTAAACAA CTCAGCCAGC TATCCGTTCT 720
CCACTGCTAT ACAGATTGTG CAGCAAGATG GTTCGGCCCT CATACCAGGA GGCAAAACAA 780
ACATTTGTTG ATTTGCGACC TAGGTGCATA ATTTATGACA ATAAATGTTG GACATTATTT 840
CATTCATGTG TGTATACTTG GAGGAGCAAC AGATACAGAA CCCTTTTGTC CTGCTGCTTG 900
GGGATGAACT AAACTGGTCT CAGACATTTG TTATTGTTGG AG 942