EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-00672 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr1:21026735-21027710 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr1:21026884-21026895GTTTTATGGCC-6.62
CDX4MA1473.1chr1:21026884-21026895GTTTTATGGCC-6.32
FOXC2MA0846.1chr1:21026980-21026992TTTGTTTACTTT-6.62
FOXP2MA0593.1chr1:21026980-21026991TTTGTTTACTT-6.62
Foxj3MA0851.1chr1:21026977-21026994GTATTTGTTTACTTTTT-7.95
LMX1BMA0703.2chr1:21027111-21027122TTAATTAAATT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr1:21027112-21027123TAATTAAATTA-6.62
POU4F1MA0790.1chr1:21026789-21026803ATGCATTTTTAATG+6.43
POU4F3MA0791.1chr1:21026789-21026805ATGCATTTTTAATGTT+6
PROP1MA0715.1chr1:21027112-21027123TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr1:21027112-21027123TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr1:21027112-21027123TAATTAAATTA-6.62
Enhancer Sequence
AATGTACTTC AGTAAATATT GAGGGTCAGA GACAGACTGT ATAAATATCT TCTGATGCAT 60
TTTTAATGTT TGCTGATGAG GCAATTTCGG ATTAGCCTAT ATGTAGATTG TTTCATGGAA 120
GTTTGCGTGT ATTGAAGAAA GCATTATTAG TTTTATGGCC CACTTTTCAT CATAATACCA 180
TTCAGAGACC AAATGAGATG AATAAAAAAA GAGGCGTTGT TAACCTTGTT GATTTGCTCT 240
GTGTATTTGT TTACTTTTTA TTGTTTTAAT TGTCCGCTTT GACTTGTGCG TCTCGGTCAA 300
AAGCGATTAT TTCCGCTTCC AGGAGGGCAT CCAAAATTTC CCCTTACCAA AAACTATCCG 360
CGCTTTAATT ACTTTATTAA TTAAATTAAA GAGGAGACTG AAACGCCACG TTTTGTAATC 420
CTATCACGTA AAGGAGGCAT GGGTGGAGCA ATGGTGGTAA CCGAAAAATG GAAACCTCTT 480
TAAACAATTG TTTGCTCTTT AATGGGCTCT ATGCACGGCG GCGCGTGACG CATTTCCGGT 540
AAAATTTAAG ACCCCGAGCC TACTTCCGCC GATCGTACAG TACAGTACTA CAACAGGACC 600
GCTACTGATA AAAACGAGTA ATGTTTTGGA CAGTTGTCTT AATGTTTTAT GCCATTATAG 660
CCCACTTATA TGTTTATGTC AGCTACATAA ATATGACATC TAAACGTTTA CAAGTGTCAT 720
TTCAAAGACG TGAGAACAGT ACTTGTAGAT ACCACTGCTG TGTTCAGCAA TGCACAGCGT 780
CAAAAATTGA ACTCTTACCT TAGTTTCCAC TCGTTTCCAA AAGACAAAGT CGTGCAGAAG 840
AGGTGGGTTG TTGATATTAA ACGTGAGAAT TTTACAGAAA CAGAAAAAAA CAAGAGTGTA 900
GTTGACAATT TCAGTCTAGC AAACTGATCG AGGCTTGAGT GCCAACCGGA TGCAGACATT 960
TAAAGAAAGG AGCTT 975