EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-00639 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr1:20387046-20389331 
TF binding sites/motifs
Number: 22             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr1:20387301-20387320TTGTCAGCAGGTGGCGCTA+6.75
CTCFMA0139.1chr1:20387565-20387584CTGCCAGCAGGTGGCGTTA+6.79
CTCFMA0139.1chr1:20387432-20387451CTGCCAGCAGGTGGCGCTA+8.36
CTCFMA0139.1chr1:20388660-20388679TGGCCAGTAGGTGGCGCTA+9.39
CTCFMA0139.1chr1:20387872-20387891TGGCCAGCAGGTGGCGCTA+9.81
IKZF1MA1508.1chr1:20387685-20387697ACTTCCTGTTCC-6.44
IKZF1MA1508.1chr1:20388782-20388794ACTTCCTGTTTT-6.74
KLF13MA0657.1chr1:20388367-20388385TTGCCACGCCCACTTCAA+6.21
KLF13MA0657.1chr1:20389155-20389173TTGCCACGCCCACTTCCG+6.46
KLF14MA0740.1chr1:20387730-20387744GGACACGCCCCTCT+6.17
KLF14MA0740.1chr1:20388519-20388533GGACACGCCCCTCT+6.17
KLF14MA0740.1chr1:20388368-20388382TGCCACGCCCACTT+7.73
KLF14MA0740.1chr1:20389156-20389170TGCCACGCCCACTT+7.73
SP1MA0079.4chr1:20388366-20388381TTTGCCACGCCCACT+6.18
SP1MA0079.4chr1:20389154-20389169TTTGCCACGCCCACT+6.18
SP3MA0746.2chr1:20388368-20388381TGCCACGCCCACT+6.71
SP3MA0746.2chr1:20389156-20389169TGCCACGCCCACT+6.71
SP4MA0685.1chr1:20388366-20388383TTTGCCACGCCCACTTC+6.99
SP4MA0685.1chr1:20389154-20389171TTTGCCACGCCCACTTC+6.99
SP8MA0747.1chr1:20388369-20388381GCCACGCCCACT+7.22
SP8MA0747.1chr1:20389157-20389169GCCACGCCCACT+7.22
SPICMA0687.1chr1:20388781-20388795GACTTCCTGTTTTG-6.22
Enhancer Sequence
CTCGCACCCG GGCTCACCGC CACCCGGTAG CCTCAGGATG ACAGAGAATA GCGAACAGTA 60
ATAATTTAAG CCAATATGTT TAAAAAATCG GAGAAAATCA CCGATTTATG CCAAACCTCC 120
TCCTCTCAGC AGGTGGCGCT ATGACTGTGA CTCAAGATTG GCATGTAGAT GTCACCAGGA 180
GAGGAATCTT ATCAACCATG TGGAGTTTCA GGCAGATCGA ACATTGTTTA GCTGAGTTTT 240
TAGCCAAACT GCCTTTTGTC AGCAGGTGGC GCTACGACAG ACTCAATGTT GTTATGTAGA 300
TGTGTTCAGG AGAGGATTTT TATCAACCAT GTGAACTTTC AGGCAGATCG GACTTTGTGT 360
GGTTGAGTTA TAATGCAAAC TACCATCTGC CAGCAGGTGG CGCTATAACT GTGACTTAAG 420
ATTGGCATGT AGATGCCTTC AGTAATGGAA TTTAATCAAC CATGTGAAGT TTCAGGCAGA 480
TCGGATGTTG TTTGGCTGAG TTATAAGCCT ATCTACCTTC TGCCAGCAGG TGGCGTTATG 540
ACTGACTCAT TACTGTTTTG GGGATGTGTT CAGAAGAGGA CTTTTATGAG CCATGTGAAG 600
TTTCAGGCTG ATCTGACTTT GTGTGGTTGA GATACAAGGA CTTCCTGTTC CACGGCGAAG 660
TGTTGAGGTT TGTCATGCCG CCACGGACAC GCCCCTCTGC AACAACTCTA GATCTTGACA 720
ATATATCATC ACTTAAGCTT TCAGATAACA ACCCACCAAA CTTGGTGCTG ATACAAAAAA 780
AAATAGTGGG AGGAGTTTAT TACTCTGTAA ATCATGACAT TTCCTGTGGC CAGCAGGTGG 840
CGCTATAACT GTATCTGGAT ATTGGCATGT AAACGTGTTC TGGTCTGGAC TCTTATTAAA 900
CATGTGAATT TTGAGGCAGA TCGGATAATG CATGCCTAAG TTATAATGAC TTCCGGTTTT 960
GTGGCGAATC GTCAAAGTTT GCGGGGCCGC CATGGACACG CCCATCGACA AAAACTATAA 1020
AGCTCCGCAA TTTAACATCG CCAAGGCCTT TAGATGACAA AACCCAATTT TGGTGTCGAT 1080
AGCATAAAAT CCCTAGGAGG AGTTCGTTAA GATACAACGC CAGGAAATGG CAAAAATGCC 1140
ACTTATTTGC AGCAGGAAGT TAAAAATATC CGACTTCCTG TTGGGTTTGA GATATGGCTC 1200
CAAGAGACTT TTTCGTATGT TTTGGCGCGT TTGAGGTGTG TGCCAATTTT CGCGCATGTG 1260
CGTGATTCGT AGATCAGGGG CTCGTCCGTT ATATTTTTCT AGGTGGCGCT GTCGAGTCAT 1320
TTTGCCACGC CCACTTCAAT ATTGTTATGT GGATGTGTTC AAGAGATGAC GTATATCAAC 1380
CATATGAAGT TTCAGGCTGA TCAGACTTTG TGTGGTTGAG TTATGAGGAC TTCCCGTTCC 1440
TTGGCGAAGC GTTGAGGTTT GTCATGCCGC CACGGACACG CCCCTCTGCA AAAACTCTAG 1500
ATCTTTAAAA AAATATCACC GATAGAGCTT TCAGATGACA CCACTCAATT TTGGTGCTGA 1560
TACCATAAAA TTTGTGGGAG GAGTTTGTTA CAGTGTAAAA CATGTCATTT CCTGTGGCCA 1620
GTAGGTGGCG CTATTTCTGT ATCTGGATAT TGGCATGTAA ACGTGTTCAG GTCAGGACTC 1680
TTATCAAACA TGTGAATTTT GAGGCAGATC GGATAATGCA TGCCTGAGTT ATAACGACTT 1740
CCTGTTTTGT GGCGAATCGT CAAACTTTGC GAGGCCGCCA CGGACACGCC CATCGACGAA 1800
AACTCTAAAG CTTCGCAATT TAACATCGCC AAGGCCTTTA GATGACAAAA CCCAATTTTG 1860
GTGTCGATCG GATAAAATCC CTAGGAGGAG TTCGTTAAAA TACAACGCCT GGAAATGGCA 1920
AAAACGCCAC TTTTTCGCCG CAGGAAGTCA AAAATATCCG ACTTCCTGTT GGGTTTGAGA 1980
TATGGCTCCA AGAGACTTTT TCGTATGTTT TGGCATGTTT GAGGTGTGTG CCAATTTTCG 2040
TGCATGTGTG TGATTCGTGG ATCGGGGGCT CGTCCGTTTA ATTTTTCTAG GTGGCGCTGT 2100
CGAGTCATTT TGCCACGCCC ACTTCCGAGA CCCATATCAA CCTGCTATTT ACACCGGGTT 2160
TGGTGTGTGT GCAAATTTTC ATGAGTTTTC GGGCATGTTT AGACCCTCAA AAGTGCCCCG 2220
ATAGGGGGCG GAATAATAAT AATAATTAAA GCTGCAAGCA GCGATGATAG GGACCTCGCA 2280
CCCGG 2285