EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-00234 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr1:7232256-7233510 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ELF4MA0641.1chr1:7233124-7233136AATCCGGAAGTG+6.04
GabpaMA0062.2chr1:7233127-7233138CCGGAAGTGGA+6.32
HOXD9MA0913.2chr1:7232961-7232971GCAATAAAAC+6.02
Enhancer Sequence
ACAAACATTG TATTCACATT CTATTTTAAC ACAAACACAA TCTAAACCTT TTAGAAATTG 60
AAGTTTACAC AATATACAAA TTTAATTGCA ACCATAAACC AATGTTTATA GAATTTAAAT 120
CAAATATTCA GATAAAAAAG GCCAAAGAAG CATAACGATG TTAACTTAAA AGCCTAATAA 180
GAGGCAGCCA GACATCAGCA TCACTCAGAA TGTCTCTTCC CATTAGCACT TGCTATCAAG 240
CACATCCGCA CGGATCCATG GATAACCCAA TCTGATCCAG ATGTCAGCTG TTCGTGCGTT 300
AATGCATCTA CCGAGCCCCT GAGATATCTA CAGCATGTTC CCAGTGTAGA TTTCAATCGA 360
ATTCGAGCAA TAAATTCAGC TTTTACAAAA ACACCACCAC TCCCATCAAC ATCAGTCAGC 420
CAGCGCGTAA ATCCGTCAAG GAAACATCGC GGTTTTTATA ACGAACACTC GTTTATAAAG 480
GAAAATCCCC CTCATAAACA CTGAATAGAG TTGACAGTTT GAACATTAAA GATTTAAATG 540
CACGACGCAA ACACATTAAC GCCATTCTGT GTTGCGTGGG TGTCACAAAA GCGACATTGT 600
TTATAACGCC TTACTGGCTC CATTCAAAAC TCAATTTACA TCAACACATC TCCCCCCGGT 660
TTATCTCCCA CATTTACTTA CCTTACAAGT TTCATTTAAA CGCGTGCAAT AAAACAGTTC 720
GACGAGTCTA GATGAAAACG TCGGGAAAAT GCAGCTTTTG GAGCTTATTG TAGTCGTCTA 780
TGAGCGACTG ACTGATGTAT TAAATGCACA AGCTCTGGAA CATCATCCGA GTGATGAACC 840
ACACAGCGGA GCGATCATTA CGAGCAATAA TCCGGAAGTG GAGCGCATGT AACGGGTCTC 900
CCTGCAGTCA GAAACGTCTG GAGTGGATCA TCCGTGTAGG ATGGAGGACG GTTTATATTA 960
TGCTTTAAAA ACAGCAGGCA CTAGACATAT GCAAACTGAG GTATTAAATA AGACTTCTAC 1020
TAAACTAGAC TTAACTCCAA TTCTGAAATC AGGACAAACG CGGATTCAAT TTGCTAGAGC 1080
TTCCATTTTA AAAATCGACT GCTTAACACT ATAGAAAAAT GAATTTGTAA TGATATTAAA 1140
CCACCAGTTA TCACTTGGGC ACAAACTAGT GATATTTTCA GGTTTACTTG CCACCAACCT 1200
GATTTCAACA AGTAGGACAT ATTCCTAGAG TAGCATCCAT GTTCATACTT TAAC 1254