EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-00041 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr1:668491-669177 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NR2C2MA0504.1chr1:668796-668811GAGGGTCAGAGGTCA+7.34
NR2C2MA0504.1chr1:668811-668826AGAGGTCAGAGGTCA+8.73
NR2F1MA0017.2chr1:668802-668815CAGAGGTCAAGAG+7.04
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:668804-668819GAGGTCAAGAGGTCA+8.55
Nr2f6MA0677.1chr1:668797-668811AGGGTCAGAGGTCA+6.93
Nr2f6MA0677.1chr1:668812-668826GAGGTCAGAGGTCA+7.42
RARAMA0729.1chr1:668804-668822GAGGTCAAGAGGTCAGAG+6.31
RXRBMA0855.1chr1:668812-668826GAGGTCAGAGGTCA+6.84
RXRBMA0855.1chr1:668797-668811AGGGTCAGAGGTCA+6.87
RXRGMA0856.1chr1:668797-668811AGGGTCAGAGGTCA+6.68
RXRGMA0856.1chr1:668812-668826GAGGTCAGAGGTCA+6.91
RarbMA0857.1chr1:668803-668819AGAGGTCAAGAGGTCA+8.14
RargMA0859.1chr1:668804-668820GAGGTCAAGAGGTCAG+7.58
RxraMA0512.2chr1:668797-668811AGGGTCAGAGGTCA+6.73
RxraMA0512.2chr1:668812-668826GAGGTCAGAGGTCA+6.88
Enhancer Sequence
GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GCGAGATGAA 60
CGTTTTTTTG GACAAAAATT GAGCAAAACA CATTATTAAA ATGAGTTTGA ATGATTTAAA 120
AGGCGTTTCT GCAGTAATAA ATGGTGAAAT ATCAGGATTA ATGAGGCAAA TTTAAAACAG 180
GGCAGCTCTC TCTCTCATTA TTCAGCTCAG TTAGAGAACA CTGCTTTATT CCTCTGTGAT 240
TGGACGTGAA GTGTGATTAT GTTCTCAGAC TCAAGTGAAA AAGAAAACAG CTGTGAGTAA 300
GGAGAGAGGG TCAGAGGTCA AGAGGTCAGA GGTCAGCTCA GTGCTGATGT TGTACATGAC 360
TAACATACCA GCAGTCAGGA AGAGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGGG 420
TGCTTGAAAT GTGATACACG TGTGTGTGTC TATATGTGCA TGTGTAATAT GTAATATTGT 480
GTGTGTGTGA GAGGGAGGGA GAGTATGCAT GTGTGTTTGT AATATGTCTG TGAAATGTGA 540
TACACGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGCA TGCCCATGTG TAATATGTAA 600
CATTAGTGTG TTTGTTATAT AATGTGTGTG TGTGTGTGTG GGACAGAGAG TTTGCATGTG 660
TGTTTGTAAT ATTTGTGTAA AATGTG 686