EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-00004 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr1:21343-23583 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GFI1MA0038.2chr1:22991-23003CCAATCACAGCA+6.02
PBX2MA1113.1chr1:21671-21683GCTGTCAATCAT-6.44
POU1F1MA0784.1chr1:21504-21518CTCATTTGCATAAA-6.95
POU2F2MA0507.1chr1:21504-21517CTCATTTGCATAA+6.44
POU3F1MA0786.1chr1:21505-21517TCATTTGCATAA-6.52
POU3F2MA0787.1chr1:21505-21517TCATTTGCATAA-6.52
Pou2f3MA0627.1chr1:21503-21519GCTCATTTGCATAAAC-6.85
RREB1MA0073.1chr1:21808-21828CCCGAAAACACACACACACA+6.11
SCRT1MA0743.1chr1:23525-23540CTCCACCTGTTGCTC-6.57
SCRT2MA0744.1chr1:23527-23540CCACCTGTTGCTC-7.22
Enhancer Sequence
GCTGTGTCCA ATAGTCCAGA AGCTGAAGGC CTGTATGGGC ATCTGAAATA CACTCTGCTT 60
TATACACACA CACTCACACA CACTCACACA CACACACACA CACACACACA CTCACACACA 120
TACACTCACA TAAGATCATT GTGCGCTAAC GAGTAACCCA GCTCATTTGC ATAAACATGC 180
GGACGTTGGT GAATGGAACC TTGACTAATG CAGTTTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 240
GTCTGTCTCT GTCTCTGGTG TTCAGAGTAT GCAGATCTCC GCATTCCGGT TGGCTCTCTG 300
CTTTTCCTTC TGTAGTTATC ATTCATCAGC TGTCAATCAT TCACTCGTGT GTGTGTGTGT 360
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTTTTT AACAGTCCGA CGCTGACTTC CTCATAGCTC 420
ATCTGAATTT CCTCAAACAC AGTCACGCAA CGCACTCAGA AAATCCCCGA AAACACACAC 480
ACACACACAG TAACACACAG TAACACACAC ACACACACAG GCTGCTTTAT GAGCAGATCC 540
AGACACGCTG GAACACACCC TGCTCATCTG CTGCTCTGGG GGGGCTGCGT AGGTGTGTTG 600
TGTGATTAAG GTGTGTTTGC GTAAGTGAGG TGTGTAGTAA AAGCGTGTGG TGCAAGTGGG 660
TATTCTGTGT GTGTGTGCGT GTGTGTACGT GTTTTTGTGA CATATCAGGA CACAAATCTG 720
TATAATGACG TGTGTATGAC TCAGATATTA CAGAAAGCAG GTGAAATATG AGGTGAGGGC 780
AGAACAGTAC ACGACTTGAA CAGGATACAA CAAATTAACT TTAATGTCCC CACTTTTCAC 840
AAAAACAAAC GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTCTCCTC AGGCCATCCA GCGGTGTGTG 900
CAGCAGAGCG GCCGGAGCCT CAGCCTGGAG ATGGTCAACT ATGAGGGTCA GTTTCTACAG 960
TAGAGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGAGTCTGT GTAACCCTCT GTGTGCTGCA 1020
GGACTGACTC CGCTGCACAC TGCAGTGCTG GCCCATAATG CAGTGCTGCA GGAACTGAGT 1080
GGTCATGTGA CACAGGATGT GACGCTGCTG CAGAAGAGGA AGAAGCTGGC GGAGTGTATC 1140
GCCACACTGC TGCAGATGGG GGCAGCGCTG GGCACACAGG TGAGCACACA CACACACTCA 1200
CACACACTCA CACACACTCT CTGCAGTTCA GTGTCCTGTA TGGCGCTCTC TCTCTCTCTG 1260
CTGTTCTCAG GACTGTAAGA GCGGCCGCAC GGCTCTGCAT ATGGCAGCTG AGCAGGTGAA 1320
TGTGGAGCTG CTGCGCCTGT TCCTGGATCA GCCGGACTGC TGCAGCGTCA TCAACACTCG 1380
GGTCAGTGGC GTGTTAGTGA GCTGTCCTCA TGTGCTGCTG TGGTGCTGTG CTGATGGTGA 1440
TCTTGTGTCC GTCAGGCGTT CAGCGGGAAC ACGGCGCTCC ACATGGCGAG CGCGCTGCAG 1500
GGTCGGGATG CGCAGCTGGA GGCGGTGCGG CTGCTGCTGC GGAGAGGAGC CGACCCCAGC 1560
GCCCGCAACC TGGAGAACGA GCAGCCCGCA CAACTGGTGA ACGAGGGCCC GCTGGGAGAC 1620
CAGGTCAGAA CCACAACCAC TGCATTGACC AATCACAGCA CACCATCAGC TGACACTCCT 1680
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGGGTGTGT GTGTGTGTGT GCAGGTGCGG CGTGTCCTGA 1740
AGGGTAAATC GGCCCCGCTG CGCCCCTGAG CTCCTCCACA CCCGCTGTCA GTCAGGCAGC 1800
CGTCGCTCTA CTCATTTGCT CTGCAGATGT CGGTTGTTTC CATGAAACAG ATTAAAGTTC 1860
TCTACTGTGT AGAAGAGGAA CCGGAAGATG AGCAGCACAC ACACACACTC TGCCGGACTG 1920
AGGAGAGTCC CGACTCTGAC CCAGTCCAGC AGCAGATCCG TGTGCTGCTC CTGTGTGTAA 1980
AGGCCTGAAA ACTATACTCA TACTGTAATG ATGATTATCT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 2040
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 2100
GTGTGGTTAA TCTTCTGAGA TGTGTATCAG TGAGTGTAAA CCTGTTGAAC CGGATGGTCC 2160
CGCTGGAGCG CTCCGGGCGT GTCTCCACCT GTTGCTCTGG GACTTTCACC TGATGATGAC 2220
TGAGCTGCTG AGCTCGACAT 2240