EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-57026 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr9:34140215-34141461 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr9:34140459-34140469TCTAATTAAA+6.02
ARGFXMA1463.1chr9:34140459-34140469TCTAATTAAA+6.02
POU4F1MA0790.1chr9:34140483-34140497CATTAAATATGCAA-6.3
POU4F2MA0683.1chr9:34140481-34140497CTCATTAAATATGCAA-8.17
POU4F3MA0791.1chr9:34140481-34140497CTCATTAAATATGCAA-7.19
TFAP2A(var.3)MA0872.1chr9:34140842-34140855TCCCCCCGGGGCA+6.01
TFAP2A(var.3)MA0872.1chr9:34140842-34140855TCCCCCCGGGGCA-6.16
TFAP2C(var.3)MA0815.1chr9:34140842-34140855TCCCCCCGGGGCA+6.03
ZNF384MA1125.1chr9:34140279-34140291TTTTTTTTTACA-6.07
ZNF384MA1125.1chr9:34140277-34140289TTTTTTTTTTTA-6.37
Enhancer Sequence
CTAAACTGCG GCCATATTTT ACAATATTAG CAACAAACAA ATTAAGATGG GAAATAGGAC 60
CGTTTTTTTT TTTACATCTT CCACATGAGG TTTACTCTCA TCAACCTCAG CACAAAGAGC 120
GTCTCATGTG TGCCCCCTGA TGGAAAATAT TTGAAACAAA AAAGTACAAA TTCACACTAA 180
ACAGGTATTT AAAAAAATAC TAGGCTAATG ATTTGTGGGT GCAGGAGCAC AGATTGGAAA 240
AATATCTAAT TAAATAAGCC TAATTACTCA TTAAATATGC AAGCACAATT TTAATTGCTT 300
ATTCAGAGCA TTGTGGCTTA ATAATTGCTT TAGCAACACT ATTACCTCTA ATTTAAGCTA 360
ATCTAACAAT GAATTCAAAG TTTTTACACC CAATTGCTCC AATTGTAATG ATGGGTGTTG 420
GGGTGAGGAG GTTCGTTGAA TCTTTATACA CATAATGTGT CCGTTCAGTC CACTTGCAGG 480
CGTCTGGCCA CTGCACTTCA TCTTCCTAGG CTGTGCTGTT ATCCTTGTCA TTTAGGGGGG 540
AGAAAAAGAG GAAAGGGGAA ATGTGTCCCC CCTTGTTTCC CCTCTCTAAA CTCGCCTCTC 600
TCTTATTCCC CAACTCAATT CTTTCGGTCC CCCCGGGGCA ACAGCATTCC AAAACACACA 660
CAAGAATTTC CTTTTCTTCA GTTCACAAAC CCTCCCCTCC AACCTCACTT CAAGAAGAGG 720
AAAAAAGGAT ACATCACCCT CTACCAAATG GTCCTTACAT TAAATAACAT GAATAAGGAA 780
ATAAAACGTC CGTGACAAAT GGTTAAATCA CTTTTTCACA GTCTCCCTGT CTCTCTATAA 840
AATACCACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACTGCATG CTCTAAGTGT 900
GTCTCGTGCA TGCGGCATTG TAAGTTCTCG GTTTAAAACA CAAAGCAACA CAAATGCAGG 960
AAGAAGCGAG AACAAGAAAT TATTCTTCAT ATACAGCATG TTTTATATTT GTAGCGTATT 1020
ACCGCTATAG TTTTGTGTAC ATGCAATTTA AACGATACAG GGATTAAGCA AACGCTAAAC 1080
AAAGCATGTA CAATCCGCAG CTTATGGTAC AATAAAATCA TAAAACACAC AGGACGCACC 1140
TTTTGTTTGA GTTTGCTGCA TGCGTTCGCG TTCTTCCTCC GCGCACCATC ACCGCTGATA 1200
GCGGACAATC TGTTTCTCTG TGTCCAGGAA AGGAAAAAAA GAAAAG 1246