EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-56666 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr9:26546697-26547579 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid5aMA0602.1chr9:26546822-26546836TTTATCAATATTAT-6.24
Gfi1bMA0483.1chr9:26546846-26546857GGCTGTGATTT-6.02
HOXA13MA0650.2chr9:26547545-26547556GTTTTATTGGT-6.32
HOXB13MA0901.2chr9:26547545-26547556GTTTTATTGGT-6.32
ONECUT1MA0679.1chr9:26547069-26547083AAAAAATCAATAAC+7.1
ONECUT2MA0756.1chr9:26547069-26547083AAAAAATCAATAAC+7.28
ONECUT3MA0757.1chr9:26547069-26547083AAAAAATCAATAAC+7.95
Enhancer Sequence
GATTAATCAC AATTAATTTT TGACCTGCAC TAATAATTTA ATAATTGTAA CTTACTTTTA 60
ACCGGGTAAC CTTAGTGTTG AAATCACAGA CGTCTTTGAC AAAAGAGCTG AGCTTTTTTT 120
ATTTTTTTAT CAATATTATT GAGATTGTAG GCTGTGATTT GATGTATTAT TTTTAAACAC 180
TTACCAGCTG TTTGATTTCT TTTTCTTAGA AAATTTTCTA AGAAAACTTT TTTTGTAACT 240
ACTCACTGTA TATTTCTGTC GAAACTGCCA CAAAACATGA AATAATCGAT GTAATTTAAT 300
TTGTAGGCAT TCACAAATTT TTCATGAGCC TAGGTTGGAA GAACGGCGAC TGTAAGATAT 360
TAAAACTGAA AAAAAAAATC AATAACTGAC GTCATACTGC ACAGTATATC GTGAGTTGAT 420
GTTTTAAAGC ACACAAATCT CATTTTCAAT AGTTGTCTAT GATTGTCCTT GATATATTAA 480
TCAATGCTCT TGTACATATA GATTTTTCCC ACAGTTTCAT ATTTATTTTA TTATAGAGTC 540
ATAATGCAAG TCCCATTCAT CTGTCTGTTA TAAGGATCAC ATTTAAGCCA AGAGAAAGAG 600
AGAGAGATGA TGGATATCTT ATTATATCTG CCGGCCTGCA TCGATTAATC TGTCACCATC 660
GTTTGCTCTG TACATGCACA TTGTTAGCAT GGATATATGG CAAGGTGGTT TCTACTCTAA 720
ACACACACAG ATGATTTGTG GACTGGATTA TGGTATATCT CTGAACTGCT CCCCTGTTGT 780
TCTGTGGTTC GAGGCTCCAC ACCAACACAC ACATGGAGCC AGTTTTGGAG GGGGAAGCAT 840
CCTGTCCAGT TTTATTGGTT GATCAGTGTG CCAAAAACAC AG 882