EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-56613 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr9:25999764-26001030 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE23MA0817.1chr9:26000223-26000235AAACATATGCTG+6.04
GRHL2MA1105.1chr9:26000367-26000382TCAAAACCAGTTTTT+6.5
Lhx3MA0135.1chr9:26000615-26000628GATTAATTAATGT-6.03
NR4A1MA1112.2chr9:25999772-25999782GTGACCTTTA-6.02
POU2F2MA0507.1chr9:26000675-26000688TGAATTTGCATGT+6.05
POU6F1MA0628.1chr9:26000616-26000626ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr9:26000616-26000626ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
GTGGGTCAGT GACCTTTAAA TGGTAGTTAT GAGGAAAGGG CATGGAAAAG GTTCGAGGGA 60
GGGCGGAGAA TGACCACATA AAGGGTCGAA TCCTTCCCTT GTGTGCTACC TGCTGGGGAA 120
GCTATTCAGG TGACAGAACT CCTCACACAA GTGTGTATGT GTGTGTTAGG ATGTGTGTAC 180
GGGAGGTGGG GGGGTGCTGA ACAGATGTGT TTTACTCCCT CATTAACATC AGAAAGAGCT 240
GCTCTGATTG AAGGTCCTGG ACCAAGGGGG CTCTATTTCT CATTGGATGT GGACTGTCCC 300
CATTCACTCA CACACACACT CACTCACACT GACCTCTTTA AAAGGCTCCC ACCTACACTG 360
CCAGCTGGCA ACTGGTGAGG TTTTTGCTGT GGTCTCCACA GTCCACACCG CAGATCCAAG 420
CACATGAGCT CTCCGAACAC CTCAATCGCA CACACCCTTA AACATATGCT GGCAGACGCA 480
CACAGGCACG CACTGGCCAC AAATGGACTT CCCAGTGTAA CGTTTCCGCA GGGTCAAACG 540
ATCCATTTGA ATCCATTTCG AAAGTATCTT TGAATGTGGA ATAAGCTCTA GAGCAACCTA 600
AATTCAAAAC CAGTTTTTGA ACTGAATACC TTTAAATCCC CGCTAACTGT TAGCTAGTTA 660
AGAAGACGGC ACCCACAATA ATTCTTAAGC GGCGAGTCGC ACGGCGATTC AGGTTTCGCC 720
CGGCTCTTTT TCAAGTCAAA GGAATAAGGC TTACTGTAAT CTGCACTGGC AGCGCCGTAT 780
GTTATTATCG TGTCCTAATT AATCTTACAG GAGGTGTAAT TCAACTTCAG ATTAGGCCCG 840
CACCTCACAC AGATTAATTA ATGTCTCTAA TCAGCAACAG CAAAATTAAT TTTGCCCTGA 900
TTACGCACGT TTGAATTTGC ATGTGCTTAA AGCCGGCTCT TTATTTCATT ATGATATTGA 960
GCGCAGATAC TTGCACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACATGAAA CAGGTTAGAC 1020
TGTCGTAAAT GGATATGCAC ACGTAGACAC ACAACTGGAT GTGGGCATAA TCTGTGTTAT 1080
TCACTCGTGT TTTGGCACAC ACGGCACACG AGGCGCATGT ACACACACGC TCGCGGCCGT 1140
AGCCAGGAGC TGTTTGCAGT AGAGTGTTAT TGATGGGGCT GTGGGAGTGA TGGAGGGAGA 1200
GAGGCTAAAA AACAACACAG CAGATGCGCT GACAGTTGTT CACAGGCAAC CTTGTGCATG 1260
TTTAAT 1266