EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-56107 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr9:13914730-13916726 
TF binding sites/motifs
Number: 23             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr9:13915682-13915699GGTCATTAATTAATTAA+6.06
EWSR1-FLI1MA0149.1chr9:13915306-13915324CCCTCCTTCCTCTCTACC-6.09
KLF13MA0657.1chr9:13914895-13914913CTGCCACGCCCCCATGTC+6.01
KLF14MA0740.1chr9:13914896-13914910TGCCACGCCCCCAT+6.72
KLF16MA0741.1chr9:13914897-13914908GCCACGCCCCC+6.62
Lhx3MA0135.1chr9:13915685-13915698CATTAATTAATTA-6.46
Lhx3MA0135.1chr9:13915688-13915701TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr9:13915689-13915702AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr9:13915692-13915705TAATTAATTATTC+7.12
PBX2MA1113.1chr9:13915557-13915569GTGATTGACAGG+7.22
PBX3MA1114.1chr9:13915555-13915572AAGTGATTGACAGGTGG+6.14
POU4F1MA0790.1chr9:13915693-13915707AATTAATTATTCAT-7.82
POU4F2MA0683.1chr9:13915691-13915707TTAATTAATTATTCAT-7.91
POU4F3MA0791.1chr9:13915691-13915707TTAATTAATTATTCAT-8
POU6F1MA0628.1chr9:13915686-13915696ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr9:13915690-13915700ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr9:13915686-13915696ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr9:13915690-13915700ATTAATTAAT-6.02
SOX10MA0442.2chr9:13915626-13915637AAAACAAAGAC+6.14
SOX10MA0442.2chr9:13915232-13915243GTCTTTGTTTT-6.14
SP3MA0746.2chr9:13914896-13914909TGCCACGCCCCCA+6.41
SP8MA0747.1chr9:13914897-13914909GCCACGCCCCCA+6.11
ZNF384MA1125.1chr9:13916070-13916082TTTTTTTTTATT-6.62
Enhancer Sequence
TATTCTTATA CAACTGCATT CTGCTTTATG TCGAGCTGCT AAAAACGCTG TCAGGCTTTA 60
TTCTACTATA ACAACTAGGG GTGTCACGAT TTCGATTTTT AATCTAAATC GATCAAAATT 120
TATGCTCAAT TTCTATTATC GAATCAAAAA ATAGAATCGT CAATGCTGCC ACGCCCCCAT 180
GTCACGTCAG CTTGGCTTGC CAAGCGGGAA AATAACAGGC TTGTTGAAGT GCTTGTTTAA 240
CTGCAGAAGC AGGAGACCCG TCGACAGAAC TTAAACCCTC TCCTCTTTCA ATGAAGTCGC 300
CGGTGTGTAA GCATTTTGGA TTTCCAGTGA GTTATGTTGA CAACGTTTGT GTTGTCGACA 360
AAAAAAAACA CAGTTTTGCA AGCTCTGCTA TGTACATATT ACGTACGGTT CGTCCGATAG 420
ACAACGCCGG CATAGCGATC CTCCGCCCGC CCCCATTGCA ATTCCGCTCA CGAAAAGTAC 480
ACACTCAGGC CCTGTTTACA CTGTCTTTGT TTTTAAATGG CATTTTAGAA CGACAACGAT 540
TTGACATCCA CAGTGGCGTG TAGCATTTCT GAGCAGCCCT CCTTCCTCTC TACCTCTGAA 600
AATGCCCATC ACATGACCAC ACAGACACAG AAGCACACAC AGCCTTGCGC TCGAGAGAGC 660
AGGTCCAGGC AGTCAGAGGA CTGCTTCAAT CTTTCACTCA CTTGTACGTA GTCATTTTAG 720
CGAACACCTC AGATATTGTT GGCTGGTTCC TGTTGGTTGT GCGTTTTTTT TACCGAAGCC 780
ATTATAACGA CACAGATCAC TGCCTATTCA CGAGTCCCGC AGAAAAAGTG ATTGACAGGT 840
GGTAATTATG TGTGTATCTT GCCTTTATTC ATTTACTGTA TGTTTTGTTT ATGGGTAAAA 900
CAAAGACCAT GCACGTCAGG TAGTTTAAAC GGTAGGCTAC AAATAATTAA TTGGTCATTA 960
ATTAATTAAT TATTCATAAT CGAAAATCGA ATCGAATCGT GCTTTTAGAA TCGAAAATGT 1020
AATCGAATCG AGAATTTGGA GGATCGTGAC ACCCTTAATA ACAACCATCT GGATGTATAC 1080
TATCCCTTAC TTAAACATGT GTTTAGTTCT AATCAAATCC TATGTACTGT GGGCAATATT 1140
AGCTCCTAAG AGTATGAATG AATACACTTC AAATTTCTAC CAGAAGAGAA GACTATCTAA 1200
TAAATTTTCA ACATATTTCA ACATATTTTC ATTTGGGACA CAATAATTCT ATTTTCTATA 1260
AGTGACCAGT ACTATTCACA AATAAAGCAC TTTGTATAGA AAACAGTCTT TATGATAATT 1320
AAATAAAACC ATTAAGATGA TTTTTTTTTA TTTTGAAATA AGCTTCAAAC TACTGAATGC 1380
AACTTCAAAT ATAAGCAACA CTATTAGTGT TTCTAGCTTA ACAAACACAA TTAGCCTTTG 1440
TAGGAGGAAA AACATCATTA TAATGTTCTG CAGTTCAGAA GCTACACATC ATTTCAAATT 1500
TGACTGATAA CAAATCAGCA AAGAAGAGCA TGTAGCTGTA CGAGTGTGTA GGAGGACAGT 1560
CTAATGTGAA CAGGAAGTGT GCAGGATGTA ATGGATTCCT CATCCCCCTC GCGGCTTGTT 1620
TTGTAAGCCA TTCTCAAGAT GAGATCCACA CACCAATCTC CACCACATCA CAACAAACAC 1680
ACACACACTC CCAAAAGCTG CTTCATCAAG TCATGATTCA CTGTGTGCAA TGACATTTCA 1740
CATTATGCAA GAAAACAGCC CATCAAATCC TAAACTGATC CCAGGTCAGA CAACAGCACA 1800
CATCTCCACC CAATAATGCC ATTTCATAAT CAGCCAACCT GCCAGAGGAA TCCAGCGCAT 1860
ATCTGAGATG TGGACTGCTA AGAGCCCTGA TAAATGAGCA GCTAAAGCCT GAAGGATGAA 1920
TTTAGTGGTG ATAACAGTTG GGCTACTCCT AAAGAAAGGC TCCAAAAATG CCAGTGTATT 1980
TACTCAAAGT TCAGTC 1996