EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-55915 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr9:9672028-9673576 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ONECUT3MA0757.1chr9:9673035-9673049TTTATTGATTTACT-6.09
RARA(var.2)MA0730.1chr9:9672870-9672887GGGTCAACCAGTGGTCA+6.05
Rarb(var.2)MA0858.1chr9:9672870-9672887GGGTCAACCAGTGGTCA+6.18
Rhox11MA0629.1chr9:9673523-9673540ATTATGCTGTAAAAAGA+6.19
Enhancer Sequence
GCTGCGTAAG ACATATGCTG GAATAGTTGG CGGTTCATTC TGGTGTGGTC ACCTCTGAAA 60
TGGAGACTAA GCCACAGGAA AATGAAATGG AGGATGAGTA AATGACTGAG AAAGTTATTT 120
TTGGGGAGAA CTATCTCTTT AAATCCCAAA ATATGTTCCC TATTTACTGC TACAGTAAGA 180
GTTGGAATGA AAACATTGCT GAAATAACTT AGTGTATGAC ATTTAGCAGT TCAAAGTGGT 240
ATCCTTATTT GTATTCAAGG ACATTTTATT AGTTCAGGCA TTCACTAGGA ACTAAACCCA 300
TGATCTTGGA GCAGTAAGCA CTGTTTGAGC TACACTTTTC TTAATCTTAA TCTTAAAAGC 360
AACACATTCT TCCATTTATT TTACTGAAAA TCTCTAACTC TCATTGAGGA AAAAAAAAAA 420
TCAATGACTT CCGCTTGCGA CAGAGCTCTA TATGGGTTAT AGCCCCATCC TGGTTCTGGT 480
GTGATGTGAG ATTTTTTGGT TGATGTTTAA CAGACAGCCG GTGTCTAACT GCAGGGCAAT 540
GACATGCAGA GAACCAGCGG TACACAGGAC AAACATACAC ACATAAGCGC ACGCAAAACT 600
TTGATCTGCA TCCACACACT ACTCCCCTTC TCCAGACTGT GCGTGACAAC TATTTTCATG 660
CAACACACGT TCGGTATTCA AAGCTCTGGC CACCCCGTCT ACACTGACAC TAGAAGATCG 720
TGCTTCAATC CAATCATCCA ATCTCTTTCT TTCTCTCTCA TGTAAAACCC ACACACACAC 780
ACACACACAC ACACACACAC ACAAACACTA CATTATTCAA ACTGGCTGAT GTTGGCTTGT 840
GGGGGTCAAC CAGTGGTCAC ATATCAACAC GTGACACAAG ACAAAGGCAA GTAAGAATGA 900
AATGGAAAAC TGCAGTGGTT GAGGGAAGAG ATCCAGAAGA GATTCCAATA ACTCAACAGG 960
CTAAAATAAC CTGTAAAATT ATATAATTAA CAGTTGTAAT TTAGGCTTTT ATTGATTTAC 1020
TAATAAAAAT TGATAAATGC ACAAGCACAA AAACTCCAAA TGTACCAGAT TGACTCAAGA 1080
AAAAAAGCTA ACTTGCCTGA CACATCACCA CTCTGGTTCC AAGTCTTACT CAACATGACT 1140
GTATTAAATA AAATATATAG AACTGTACTC ACAGCTACTT ATGTTGCATA AAAAGCGCAC 1200
ATTTTTAATA GTCAACACAT GCTCGGGAGT TAAACCCATG ACAGTGGTGT TGCTAGTCTC 1260
ATGCACTACT ATTTGAGCTA TCAGGAATGC TACTCAAATG CCTGTAATGA TTCTGTCACA 1320
CATTGTCTAA TTCAGTATGA ACGTGCAGAT CACTCGAACG CTAGAATCAT TTCAAGGAAT 1380
CTACTGTTGT ATTATCTTCA CATCTTTAAA ATGCAAAACT AGAAAATATT ATTATTGCAA 1440
ATGTAACAGT GGTATTTTGC TTGCTACTGA ATTATATATT CCAGAAACAG AAAAAATTAT 1500
GCTGTAAAAA GAAATCCAGC ATACAAAAAA ACGTAATATT TTGCACGT 1548