EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-55866 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr9:8466359-8468129 
TF binding sites/motifs
Number: 21             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxq1MA0040.1chr9:8467999-8468010AATAAACAATA-6.62
HNF1AMA0046.2chr9:8468044-8468059AATTAATAATTAAAA+6.51
Lhx3MA0135.1chr9:8466519-8466532AAATAATTAATTC-6.22
Lhx3MA0135.1chr9:8468039-8468052TAATTAATTAATA+6.25
Lhx3MA0135.1chr9:8468036-8468049AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr9:8468035-8468048AAATTAATTAATT+6.92
POU2F1MA0785.1chr9:8467306-8467318CTTATGCAAATT+6.04
POU3F1MA0786.1chr9:8467307-8467319TTATGCAAATTT+6.62
POU3F2MA0787.1chr9:8467307-8467319TTATGCAAATTT+6.32
POU5F1MA1115.1chr9:8467307-8467318TTATGCAAATT+6.14
POU6F1MA0628.1chr9:8468037-8468047ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr9:8468041-8468051ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr9:8468037-8468047ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr9:8468041-8468051ATTAATTAAT-6.02
Pou2f3MA0627.1chr9:8467305-8467321TCTTATGCAAATTTCA+6.36
ZNF384MA1125.1chr9:8467106-8467118TCAAAAAAAAAA+6.11
ZNF384MA1125.1chr9:8467108-8467120AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr9:8467109-8467121AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr9:8467110-8467122AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr9:8467111-8467123AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr9:8467112-8467124AAAAAAAAAAAA+6.22
Enhancer Sequence
AGTAAATAAA ATAAATAAAA CTAAATCAAA TAAATAGAAT AAAAATAAAT AAAATGAAAT 60
GTAAATAAAT AAATAGAAAA TAAAATAGAA AATATATTTT AAAAATAAAA TAAAATATAA 120
ATGGAATAAA AATAAATAGA ATAAGATAAT TAGTTTATAC AAATAATTAA TTCATTCTTT 180
CATTAAAAAT AATTAATAAA TAAAATAAAT AAATAAATAG AATAAAATCT ATAGTAAATC 240
AAATAAAATA TTGAAAAATG TAAAAAATAA TAACATATAC AGTAAATAAA ATAAATAAAA 300
CAGAATAATA AATAAATAAT CAAATAAATA AATAAATAGA AAGTAAAATA AATACATAAA 360
CAAATAAATA GGATAATTAC TAAATAATAA ATAAGGATAA ATCACTATTT GAAAGCACTT 420
TTAACAGCTA TTGTATCAGT GAAGGATGTT TACACAGCTT TTGGCTCAAT AGCAAATGGT 480
ACCCTAACTT TACAATGACA GACAGTCTGG ACATCATTAG CAATGGGAAG AGAGGCTGAG 540
AGATGTCTGG GCGAAAGGTT ATACTGTATG CGTGGTGTGA TGATCTTCAT GTGCAAATGT 600
CATGGTCTAA TCTCATAACA CTAGAGCCAA CTAAGCCAAC AGAGCTCAGC AGTCATATGG 660
AAATAAACGC CAGTCCATGA ATAAGAAAAT GTGTGCATAA GAGTGTGTGA GCTCAGCAGA 720
TCCCACAGTC TTCCTGTGTT TAACAAATCA AAAAAAAAAA AAAAAGCTGC AGCAAAGGAG 780
CCTTTTAAAT TCATTTGATG ACTTTAAAGT ATCGCATATT CTGCTCCCCC TGCCACACAT 840
GCATTCAGAT CACTTAGCTC AGCAGGGGAG AAAAGGAGCA TTCATTCAGA ATCAGGCCAC 900
ATGCCATGCA ATTATTCCCA CACACGGCAC GTGCTCTTAA AGAGCGTCTT ATGCAAATTT 960
CAGATGATGT TTTCGAGCCA CATCCCACTC TTTCATTGCC ACATGTTAAA AACACACACA 1020
CACACACACA CACACACAAA CACATAAAAG TTAGATGTTT TATAAATACA CTTGAAATCA 1080
GAATTATTAA ACCCCTTTGA TTTTTTTTTT CTTTTTCAAA TATTTTGTAA ATTATGCTTA 1140
ATAGGGCAAG GAAATTTTCA CATTATGTCT GATAATATTT TTTCTTCTGA AGATTTTCTT 1200
CTGGCTAATT TGTTTTATTT TGGCTGGAAT AAAGGTAGTT TATAAATCAG TTATTAGAAC 1260
TGAACTACTA ACTATTATGT TTAGAAATTT GTTGAAAAAA TCAGTTCTCT CTTAAACGAA 1320
AATTGGGGAA AAAATAAACA GGGGGGCTAA TAATTCTGAC TTGTATGATG TTAACATATG 1380
ATGCAAAGTT AAGTACAGTT TAAGACTTTA CACTGAAATA ATCTAGAGTA ATGAAAAACT 1440
GTTTGTATGT GTGGGAAAAA AGAAAAAGAA AAATATGAGC AAATGACAAT AATTGAATGT 1500
TTAAAATGTT TTTGGGCCAA ACTGATGTTG TCACTGTGAT TTTTAAATAA CAATTGAATA 1560
AAATATAAAA TAAATAGAAA AAAATAGTAA ATTAAATAAA ATAAATAAAT AAATAAATAA 1620
ACACATAAAA TTATAAATAG AATAAACAAT AAATTGAATA AAATATTTAG TAACTAAAAT 1680
TAATTAATTA ATAATTAAAA AAATAAAGAA ATTTAAATAA TTAGTAAATA AAATAAATAA 1740
ATATAAGAAA ATAAATAGTA AATAAAATAA 1770