EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-55456 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr9:650026-651095 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr9:650436-650455TGGTCAGCAGGGGGCAGCA+6.86
CTCFLMA1102.1chr9:650440-650454CAGCAGGGGGCAGC+7.25
IRF1MA0050.2chr9:650586-650607CTGCACTTTCACTTTCTCATC+7.34
NFYAMA0060.3chr9:650616-650627GACCAATCAGA+6.14
Enhancer Sequence
TCATGTGTGT GTGCATATGT GTGTATGTTT GTGTGTGTGT GTGCACGCAT GTGTGTATGC 60
TTGTATGTGT GTGTGCGTAT GTGTGTTTGT GCATGTGTAT ATGTGTGTTT GTGTGTGTGC 120
GCGTGCATTT GTGTGTGTGT ATATAAGCTC ATTAAGAGCT GATCTTCATG TCACACAGCT 180
GTTTCATAAA CCTTGATACC CTGCTGAGAC AGACCAGCCT ATACTGCTAA TGACTCAACA 240
CACACACACA CACACACATT CATGTGGGAG GTCTAGCCTG TGTGCATGTG TGTGTGTGGG 300
AGAATTAAAG CACATGTCCG CCAGTAGCTC CGTCTGATGG TGTCTGATGA ACTGATCTGA 360
GCTCAGTGTG TGTCATCTGC TGTGTGTGTG TGTGTGTGCT AAGCTGCTGG TGGTCAGCAG 420
GGGGCAGCAA AGCACCACAC AGCCCATAAT GCACCACACC TCTGTCTGTC TGCTGTCACA 480
CACTCATTCA CAAACACACC TCAATGAGCC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 540
ACACACTCAG CCAGTGTTTC CTGCACTTTC ACTTTCTCAT CTGATCTTCT GACCAATCAG 600
ACGCTCTCTA GTATCTGCAG AGCTCCGCCC ACTGCTCTAT AAGGACACTG GAGAGAGGGC 660
TGTAATCACA CATCTGCTGT GTAGAGGTCT TGTGTCTCAT CATCGTCACA CTGTATCGTC 720
TCTACTGCAG TGTGTGTGTG GTTGTGCTGA AATGAGCATT AGAGAAACCA GCTGAAGCAT 780
TTCTGTATGA TCTGTCACAT ATGTGGGAAT AATCTTTAAT CTAATGTTTA ATATCAAAGT 840
ATCACAGTCA GGAACACGCT GAACAGATGA TTTATTAATG TTACTAAAGA ACATTGGCTA 900
AAAATGGGGT GGAGCCAACA TGAATGCAGC ACTATTTGCT GTTTTAGAAT GGGGTGGAGC 960
CAATTTGAAA GCAAAACGAT TGGCTGTTTG TAAAACAGGG TGGAGCCAAT ATAAACAACA 1020
CTATTATCTG TTTAAAAATT GGGTGGAGCC AATATGAACA GCAATATTG 1069