EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-53478 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr8:1941828-1943684 
TF binding sites/motifs
Number: 30             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr8:1943588-1943605TGAATTAATTAATTAAT+7.27
Alx4MA0853.1chr8:1942321-1942338AGCATTAATTAATTGTT+6.1
ArxMA0874.1chr8:1943587-1943604ATGAATTAATTAATTAA+6.04
ArxMA0874.1chr8:1942321-1942338AGCATTAATTAATTGTT-6.1
ArxMA0874.1chr8:1942320-1942337AAGCATTAATTAATTGT+6.27
ArxMA0874.1chr8:1943588-1943605TGAATTAATTAATTAAT-6.7
DUX4MA0468.1chr8:1942307-1942318TGATTAAATTA-6.62
DUXAMA0884.1chr8:1942306-1942319ATGATTAAATTAT-6.16
FOXC2MA0846.1chr8:1943337-1943349TAAGTAAATAAA+6.07
FOXC2MA0846.1chr8:1943210-1943222TAAATAAACAAA+6.18
FOXC2MA0846.1chr8:1943298-1943310TAAATAAACAAA+6.18
FOXK2MA1103.1chr8:1942147-1942158TTTGTTTACAT-6.32
FOXP2MA0593.1chr8:1942147-1942158TTTGTTTACAT-6.14
Foxj3MA0851.1chr8:1942898-1942915CAATAGTAAACAAAACT+6.19
Foxj3MA0851.1chr8:1942144-1942161GACTTTGTTTACATGTT-6.39
Hmx2MA0897.1chr8:1942324-1942341ATTAATTAATTGTTTTT-6.8
Hmx3MA0898.1chr8:1942324-1942341ATTAATTAATTGTTTTT-6.62
LMX1BMA0703.2chr8:1942916-1942927AATTTAATTAA+6.32
Lhx3MA0135.1chr8:1943593-1943606TAATTAATTAATA+6.25
Lhx3MA0135.1chr8:1943589-1943602GAATTAATTAATT+6.29
Lhx3MA0135.1chr8:1943590-1943603AATTAATTAATTA-6.78
POU2F1MA0785.1chr8:1942430-1942442TATTTGCATAAT-6.32
POU2F2MA0507.1chr8:1942075-1942088AAATGCAAATGTA-6.03
POU6F1MA0628.1chr8:1942324-1942334ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr8:1943591-1943601ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr8:1943595-1943605ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr8:1942324-1942334ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr8:1943591-1943601ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr8:1943595-1943605ATTAATTAAT-6.02
RREB1MA0073.1chr8:1941911-1941931ACCCCACACACACACACACA+6.41
Enhancer Sequence
CCTCATAGAT GATGAAGACG ATGGCCACAT CCAGACACAC TCGACCCAAA CGCGGCACGG 60
TGCCTTTATA AAACCTGCAC CAGACCCCAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 120
ACACACACAC ACACTTTAAC ACTGAAGTAC AGATACAGCT GTGATTCCCA ACATCAGACG 180
ACCCATTGTG AGTTCAAATA TGTACTTGGA GTCACTGCAC AATTGTTAAA GCGTCTGCTA 240
AATGACTAAA TGCAAATGTA TTATAATTCC ATTAAACATA ACTATATCTC AAATATTTTA 300
ATAAGCATTC GGGATGGACT TTGTTTACAT GTTTGAATGA AACGTATTCA TTTATAATTG 360
TTTTTTAATG ACCCCTTTGA GCTTAATTAT TAACATCAAG TCTCTGTGAG AGTTAAAGAC 420
ATTTCAGTAA TTTATCATCA TGATAATTAT TATACAAGTG AAGACATTTG ATATTATTAT 480
GATTAAATTA TTAAGCATTA ATTAATTGTT TTTAAAAGCA ACAAATATGT GAGATATTGA 540
AGTGAAATGC GTCTGAAATG TCAATATATT TTAATAATTT ATTATTAAGA AACTGTTTTA 600
TGTATTTGCA TAATTACTTG AAGCAAAAAC ACAGAACAAA TATGTTTAAC ATATTTTTTT 660
TATTAGTTTA AGATTTAATT GTTAGCTTAT TAATAGGCTT AAACCTTTTT TTTATGAAAT 720
TTAATATCTC AGTTCGGGTT GAGTTAGATT TGTTGTTATT GTCCTGTCAG GTTCATTTAA 780
ATGTTTCCCT GGGTTTTTGT CAACTTTTTT CTTATTATTA GTTTCAATAA GAACTATTTT 840
AATACTTAAA CTTACACACA GACAGACACA CTTACGCTGC TGGTCCCTCG TGCCGCATGA 900
TTTTCATGGC ACAATCCATC GTGTTTTTAT ACTTGTGAGC TTCCAAACCC TACAAACAAA 960
TGTAATTTTC ATTAAAACTT CAAATATTAC ATATTGACAA TTTTAATAAA GGAAAACATA 1020
GAATATAAAA TAAAATAAAC CTTAAACAAT AAAAATAATA ATAACAATAA CAATAGTAAA 1080
CAAAACTAAA TTTAATTAAA TAAAAATTAC ACTTCCGAAT CCCCACAACT TAAATAAAAT 1140
TTAACTTAAA ATAGCTGAAA TAAAATAAAA TAAAATAAAA CAACTATTCA GCAAGTGGCA 1200
GCAAGGCCAA GCGATTTAGA ACAAAATTAT AATTTATATT TGATTTATAT TTGATTATAA 1260
ATGTATAATC AAAATTATTA AAATAAAAAT TAAATAAATA AAATAGTCTG TCCAAAAAAC 1320
AAACTAAAAA CTAAATAAAT AAAAAACTCC AGTAAGGGTC AAATGGCTCA GAAATAAATA 1380
AATAAATAAA CAAATAAATA CATAAAGTAT AAAATAATAC AATCTATAAA ATAATCTAAG 1440
TGGTTTAAAA AAAACGGGAT AAAATTTGAA TAAATAAACA AATGAGAAAT AAATAAGTAA 1500
CTAACAAAGT AAGTAAATAA ATAAATAAAA AAATTTAAAA TAATTTATCC AAGTGGTTTA 1560
GAAAAAAAAA CGGAATACAA TTTAAATAAA TAAATAAATG CTAAATAAAT AAATAAAATA 1620
AATCTGTCCA AGTGGTTTAA AAAATAAAAC GGAATACAAT TTAAATAATT AAATGAGAAA 1680
TAAATAATAA ATAAATAAAA TAAATCTGTC CAAGTGGTTT AGAAAAAAAC TGAATAAATT 1740
GTAAATAAAT CAGTAATAAA TGAATTAATT AATTAATAAG TTAAAAAATT GTAAAAAATC 1800
TGTCTGGAGG GGTTTGGAAA AAAACTTAAT AAAATTTTAA TAAATAAATG AGAAAC 1856