EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-52705 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr7:54657904-54659393 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr7:54658169-54658190AAAGGGAATGTGAAAGTAGTT-6.38
Lhx3MA0135.1chr7:54658115-54658128AAATTAATTATTT+6.78
POU4F1MA0790.1chr7:54658116-54658130AATTAATTATTTAT-6.63
Enhancer Sequence
TAATATATCT ATATTTATAT TTGTTTTATT AAAAACAAGC TTAGATTTGT CCACCTGTCA 60
GGTTTTAGAC CATATGGGGC ATGGCAGGTT TATTTGGAAA TAACTCAGTA TTTTGACCAA 120
ACTTTGTTAT TATTAATCAT TTATTCGTTT GCTGGAAATA AGAACTGAAT TTAGAAAAAG 180
TTTGGAAACA AATCTTTTCG CTTAACAAAC AAAATTAATT ATTTATAGGC TAATTGATGT 240
CTGTGCGTAA AGGTTTCCCT ATCCAAAAGG GAATGTGAAA GTAGTTCCAT TATCTCTCAT 300
TCTTACGTAG TAGATGCTCT GTTTAACAGT TTTCTGTTAA AAAAACTGTC AACTGTTAAC 360
TGTTTACTTT ACTTGTGAAA TGCTCATTTT TTCCACTTAG ACTTACTTTG CGTCCTGTAA 420
ATAGCGAATG CGCTCTTGGC GCGACGCAGC TGGGTCTTAA AGGGAATGGG AGATGAGATT 480
CTAATTGGTT TATTCTCAAA ACACACCTAT GACTCATTAA GAAAATAAAC TCAACCCTTT 540
TAGACCATGC GCCATAGCGC AAGGCAGATT TCCCGTCCTT AAATTAGCAA AAATGCGTTC 600
TGACACGCCC TGAAAGCGTT TGCGCCCTGC GTTTTGCGCT CTGCGCATGG ACCATCAAAA 660
TAGAGCCCTC TGTGTTTGAT TTTCTTTTTT ATATACAAGA TTGTGCCGTC AAACTGTTGT 720
ATAAATGTGC CTTACAAGTG CTGATATACA GCCATATCGC ACTGCTACTC GTGTGATATT 780
GCTCAACAAC CCGACTATAT CCTCAGATAA GTCAATAAGC TATCAAATAA GGTCACAATT 840
TATTTTGATG GTCCATTTGT TGAATTTAAG TTGCATTCCA TCTACTTGCC AACTAATTCT 900
TATTAGATTA TAAGTAGACT TTTAGGTTGG GGTTATGGTT AGGGTTAGTC TAGGTTTCGT 960
ATAGTCAGAT AAATGCCTGT TGAAGGAGCA GTATCAACAG ATATTAAGAG GACAGTCGAC 1020
TAATATTCAA ACAGACCATC AAAATAAAGT GTTACCTCAA ATAAATATCT GTTTAAACAC 1080
AGCTATATTC ATTTATTTTA ATATACACTT TTGTACGATA TCCCAATAAG AGCGTTTGAG 1140
GAATATCAAA AGAGCACTGC CCAGAACACA GTATAATTAT TTAAGGAATG TCTTGTTTTG 1200
GTGTCTTCTT AATAGGTGCT TTTCACATAC TCTGCCTAAA TGCACTTTTT ATGCAAGCAG 1260
GAGTGTCAGG TCTAGCCTTG TTGTTGGCTA TAACCAAATA TATTTTAAAT GTCATACCTT 1320
TAGCCCCAGA GGTATTTACC GGTAGTCAAA TGAAATAATA TTGCATTCCA GGGTACAGTC 1380
AGCTTTCAGG TGAAGCACAA AGCAGGGTGA GGTTGCCTGC AGTGGCTTGT TGCATTATCA 1440
GTCACGGATC TTCACACACC CAGCCTATTC AGGAGCTCCA TATCCTCCT 1489