EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-52614 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr7:53552991-53554024 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
POU2F2MA0507.1chr7:53553827-53553840TGCATTTGCATGT+6.37
RFX1MA0509.2chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG-6.76
RFX1MA0509.2chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG+6.77
RFX2MA0600.2chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG+6.79
RFX2MA0600.2chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG-6.92
RFX3MA0798.1chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG+6.98
RFX3MA0798.1chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG-6.99
RFX4MA0799.1chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG-6.72
RFX4MA0799.1chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG+6.88
RFX5MA0510.2chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG+6.59
RFX5MA0510.2chr7:53553603-53553619GGTCACCATGGTAACG-6.85
SOX15MA1152.1chr7:53553164-53553174CTATTGTTTT+6.02
Enhancer Sequence
GAAGAGTGAA GAATCTAAGA ATCCAAAAGC TATAGTAGTA TTTGTTCGTG TAATCTGTGA 60
GAGAATTGCT CAGTGGCTTC AACATATTTC AACAGAAGCC CACTGACATC TCCTGACCAT 120
TTGTTTTTCT GTGAAAAATG GCCTGCAAGT GTTTTCAAAA GCGTTTCGGG GGTCTATTGT 180
TTTGTTTTGA ATGCAGTGTG TACTAAAACA GTCTGGTTAT TGGCAGTTTG AGAGCTTTTC 240
TGAAAATGGC TTTGTTTGTC AGTGGGGGCT GCCAACATTA CCGCTACAGC CCACCTTAGC 300
GAGAGTGTAT CTGGCAGACT ACCAAGCTCC GCCTACGAAC GTTACCCACC TGTGTGAGCA 360
AGGGGGGCGC AGCCTGTAGG TCATGGCGCA CGTCTTTGTT CATTCATGCC TCAAGGTTTT 420
AAAACCATTA AAACTATGCA CTCTAAATTT GGAAAATGCT GCATGAGGTA CTGATTTGTG 480
CCCATTTGGA GCTAAGCCCT GGGTCTGCCG GAGGCAGGAG GCGATGGGGG ATGTAGTGTT 540
AAGGGGTTAG GCAGAGGGGT CTCTCTGGGA CCCAGCACGC TCATTACTGC GAGGAGTCCA 600
TCACTGACAG CAGGTCACCA TGGTAACGGT TGGTATGTGA TTCCCACAAC AATGCCAAAC 660
CTTCCCCCAA CCTCCCTCAC CATTTTCCCC AATCAGCACA TGGAATTTTC TCTCTCATTC 720
TCTCTCTGTC CATCTCTCCT CTCGCTGTCT TGCACTATTA CAGTATTGTT GGCCAAGGAC 780
AGAGCGAAGG TGTTTTTGAC AGCTTGTATA GTGGTGGTGG TGTTGGTATG ACTGCATGCA 840
TTTGCATGTA TGGGTTGCAT GGAAGTGTTC ACTGCAAAAC TACAGGGCAG TAATTGTGTG 900
TGTGTGCTAG ATTGTTCCGG TATAATTGTG TAATGATGGA TGGTGCTTCT CTGGATTGAA 960
GCCACGCCTG CCCTCATAAG GGAGCGCTCT GGAGACGGTT GTACGTTTGA AGATGAAGAG 1020
AGATTGTGTT TAT 1033