EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-52066 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr7:42575385-42576952 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr7:42576037-42576049TAAATAAACAAA+6.18
Foxj3MA0851.1chr7:42576035-42576052AATAAATAAACAAACAA+6.03
IRF1MA0050.2chr7:42576555-42576576AAAATGAAACGGAAAGGAAAG-6.57
IRF2MA0051.1chr7:42576553-42576571GGAAAATGAAACGGAAAG+6.22
IRF3MA1418.1chr7:42576552-42576573GGGAAAATGAAACGGAAAGGA+7.36
PHOX2AMA0713.1chr7:42575809-42575820TAATTAAATTA-6.62
POU4F1MA0790.1chr7:42575815-42575829AATTAATTATGTAT-6.59
POU4F3MA0791.1chr7:42575813-42575829TAAATTAATTATGTAT-6.14
PROP1MA0715.1chr7:42575809-42575820TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr7:42575809-42575820TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr7:42575809-42575820TAATTAAATTA-6.62
STAT1MA0137.3chr7:42576547-42576558TTTCCGGGAAA+6.32
ZNF263MA0528.1chr7:42576273-42576294TCCCACCCCTCCTCTTCCCCC-6.47
ZNF263MA0528.1chr7:42576279-42576300CCCTCCTCTTCCCCCTCACTC-6.91
Enhancer Sequence
GTGCCAAAAA GATTCAAATG ACAGCGCCCG CTCGTCCGCG GAGAATAAGG TCAATAGTAC 60
AGTGCAGAGT TCGTTATTTG TGCGCCTCGC TTACACATTG CTTAATATAC ACTGGATGTA 120
CAGCAATACG CAAATTTCTT TACATATATA AAAAATAAAA GATTAACATA TTACAAAAAT 180
TAGGATTTTC TAGCCTACAT GAATATAAAA ACCATACTTA CCATACCAAT CTTTTTCAGT 240
TTATTAATTA CAATTTGCTT TTGTATATTG TTATCATTAT TAGCAGTATT ATTTATTATA 300
TGCATATTTA TATTTGTTTT ATTAAAGATT TGTCCACCAG TCAGGTTTTA GACCATATGG 360
GGCATAGCAT GTGCATTTGG ATAAAACTGT GAATTTAGTT TTGTAACAAA TTTTTGGCCT 420
TAGCTAATTA AATTAATTAT GTATAGGCTA ATGGATGTCC TTGTGTACAA CACGTTTCCC 480
TATCCATGAG AGTTAAAGTG AAAGAATGAG GAGGCTCTTC TCATATACTT CGTTCCATCC 540
TTGAAATAGC AAAAATGGAT TATGACGTGC CCTGAAGGCT TTTAACCCCT GCACTTTGGA 600
CTTGACTCGC ATGGATCAAA TAAATAAACA AGCAAATAAA TAAATAAGGT AATAAATAAA 660
CAAACAAGCC TATAAATAAA TTAATAAACA AGCAAATAAA TGAATAAGTT AATAAATTAA 720
TAAACAAGCA AATAAATAAA TAATTAAGCA AATAAATGAG TAAATAAGTA ATTAAATAAA 780
TAAACAAGCA AATACGTAAA TAAAGAAACA AGCAAATAAA TAAATAAATA AATAAGTGCA 840
AGAAGAGCAA TTTGCTTTCC ACAGTCTGTG TAAAAGGTTT TCATCTGATC CCACCCCTCC 900
TCTTCCCCCT CACTCTTCCA GTAAGACACA AAAAAGGGAG GAAACATAAC GCTTCAGTCA 960
GTGGATCTAT TACATTAACG AAGAGAAAGG ATTACATTTA CCACTCCACA TCTACAGAGT 1020
ACACACACAT ACACACACAC ACTTGTATGC CGCAACCGGA GCTCACGAAG TTGTCATCGT 1080
CAATGTAATA CTGTGTTTTT AAGCTGTCAC CTTCAGATAA AAATAGCCAT TTTTCACAAC 1140
TTAAACCTGC AGTTGTTAAG TGTTTCCGGG AAAATGAAAC GGAAAGGAAA GCCTCTATGG 1200
GTTTTCTGAG CGTGGACTTG ACAGATGCCA ACGAATTAAC AGTGCTAATG TTCTTGTTCA 1260
ATAGCCTCCA CCGCAGGATT TCAAAGACGA GAGAACATTT AACTTGAGAC CTGGAGCAGC 1320
AGGAGCACAA ACGGGGCTTG AAGAGGAGCA GGACTTCAGA GTGATATGTA AATAGAAGAT 1380
TACCCTTGGA GACAAGGAGC GACTCTGTGG TAATTGCTCA AAAAGTCCTT CAGCTCTCCA 1440
GGGAGCCTGA GATGGTGGTA GAGGCCTACA GGATTACAGA GGCAGAGGTG CAGTTCAGAG 1500
GGTGTCAGTG GGAAACTGAT GGCAAGAAGG TGTAATTGGC ATTGGTGGCA GAGAAGATTT 1560
CGCTCAG 1567