EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-51467 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr7:34184581-34185443 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BACH2(var.2)MA1470.1chr7:34184718-34184738TATCCGTCACGTCATCTTGT-6.07
HOXC11MA0651.1chr7:34184658-34184669GGTCGTAAAAC+6.14
HOXC12MA0906.1chr7:34184658-34184669GGTCGTAAAAC+6.14
HOXD10MA1506.1chr7:34184658-34184669GGTCGTAAAAC+6.62
HOXD12MA0873.1chr7:34184658-34184669GGTCGTAAAAC+6.02
Hoxa11MA0911.1chr7:34184658-34184670GGTCGTAAAACT+6.74
JUN(var.2)MA0489.1chr7:34185254-34185268CTGAGTCACTTTTT-6.02
MIXL1MA0662.1chr7:34184831-34184841TCTAATTAAC+6.02
POU1F1MA0784.1chr7:34184832-34184846CTAATTAACATATT-6.88
POU1F1MA0784.1chr7:34184708-34184722CTAATTTGCATATC-7.19
POU2F2MA0507.1chr7:34184708-34184721CTAATTTGCATAT+7.04
POU3F1MA0786.1chr7:34184709-34184721TAATTTGCATAT-6.74
POU3F2MA0787.1chr7:34184709-34184721TAATTTGCATAT-6.74
POU3F3MA0788.1chr7:34184709-34184722TAATTTGCATATC-6.09
POU3F3MA0788.1chr7:34184833-34184846TAATTAACATATT-6.36
POU5F1MA1115.1chr7:34184710-34184721AATTTGCATAT-6.62
Enhancer Sequence
TTAAAATGTA TTATTTGGCC ATGTATCTTT CATCTCCCTA CCGGACGCAT TAGGAACAAC 60
AGGGCCGTAA AATTGTGGGT CGTAAAACTG CTAGGATCCA AAAGCCTGCA CGAAAAGTTG 120
CCACCCACTA ATTTGCATAT CCGTCACGTC ATCTTGTAAT ATCTGGCAAG CGTAAGCCCG 180
TCATCTCTTT ACTCTCCGAG GTGCAGTGTA TTATATTACA TTTAAACATT ACATCCAGAT 240
ATAAATAGGT TCTAATTAAC ATATTGCTTT GCGCGATGTC GTCATTGCAT AATCAACTCA 300
AAACTACATC TTTATGTTGT ATAAAAAATA ATTTACGTTT TCTCAAATTG ACTGGCCATC 360
TCAGCAAAAA CATTATTTGA AATATGTCCA TATAGATTTG TATGAAAAAT AGAATTGACT 420
ATTTGTAAAA GTAATGCAAA CACTTTTTGG ATAAGAATTT TTCCCCGTAA ACACTGATTA 480
TGAACAGGTA CATTCTTTTA AACAATCTGT ACTTTTTTTA ACTTGTGAAA TTACCACATT 540
TATGAAAGTG ACAGCAATTA CAGCACTATT GGAATTTATT GCTACCCAAG TTACCAACAA 600
TTAACAGTAA ATTAACAGTT ATGAAATGCA ATCTGAGCTA GCAATTTACT GAGTGAAGCC 660
TGCAGTCACT ACTCTGAGTC ACTTTTTCAA AATTTGCTAA AAGTAGCCAA ATGAATGTTA 720
TCAATTGCTA AGTTTGTTGC TAGGGGCTTT TTGAAAAAAA AAAGTTGCTA AGTCTAGCTA 780
CAAAATTGCT TAGTTGGCAA TACTGACAAT GATGTTCTGT ACACAGTTTA ATACTAATTA 840
GGTTGTGTAT AAAAATCCAA AA 862