EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-49743 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr6:54489604-54491844 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr6:54491803-54491820AGAGCTAATTAATTATT+6.52
BHLHE40MA0464.2chr6:54489728-54489738ATCACGTGAC+6.02
HNF1AMA0046.2chr6:54491809-54491824AATTAATTATTAAAT+6.39
Lhx3MA0135.1chr6:54491805-54491818AGCTAATTAATTA-6.09
Lhx3MA0135.1chr6:54491808-54491821TAATTAATTATTA+6.18
POU4F2MA0683.1chr6:54491807-54491823CTAATTAATTATTAAA-6.46
POU4F3MA0791.1chr6:54491807-54491823CTAATTAATTATTAAA-6.61
SREBF2(var.2)MA0828.1chr6:54489728-54489738ATCACGTGAC+6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr6:54489728-54489738ATCACGTGAC+6.02
TFAP4MA0691.1chr6:54490366-54490376ATCAGCTGTT-6.02
TFEBMA0692.1chr6:54489728-54489738ATCACGTGAC+6.02
ZNF384MA1125.1chr6:54490589-54490601TTTTTTTTTTAT-6.27
ZNF384MA1125.1chr6:54490590-54490602TTTTTTTTTATT-6.62
Enhancer Sequence
TGTCAGACAT TTCTAACTGT ACAAAATGTT TTTGCGTTAA ATTAGTTTCA TGTTTCACAT 60
CAGCTTTCAA CAAAGATAAT AATTCTAAAG CATCAAATTA GGACAGTAGA ATCATTTCTG 120
AAGGATCACG TGACACTGAA CTCAAATAAT GATGCTGCTA ATTCAGCTTT GCATCCCTTG 180
CATAAGCATG ATTCTAAGAT TATAAGCATA TATAATAATG TATACAACTA CATCAACATT 240
ATTAATGAAA AAAGACAATA CTAATATATA CAAAAAAACA GATTTTTTTA AATCAGATTC 300
AAAAGTTTTT GTGTATACCC ACCTATATAC CCAGACACTG ATACGAATCA AACCTGGCAG 360
GAAACCTTAC TTTAACCACT AAATGACTTG GCCGGAAGAG ATCTGTGGGT GTGAATATTT 420
TTTCCTTGGC AGAAAGAAAA AAAACATACC TATATATAAG CCTGTATATT TCCTCTTTGC 480
ATAACACAGC AGCTCTTAGG TGAAATATAC AGTCTTAATA CGACAATGGT GTTTTTTGGA 540
GGATTGATGT ACATCTGTTT TGAAGTGCTC ATTGCTATCG GCTGTGTTCT GGGCAATGGG 600
TTGGTGATGT GGGCCGTGTG GAGGAGTGGT TCATTAAGTA AGCCCACTTT CTGCTTGATT 660
GTATCTCTGT CAGTGGCTGA TCTCCTGGTC GGGGCTGTGG CTGTTCCTCT GGCTCTGATT 720
GTGGATATGC ATGTGAAGAT GTCTTTCCAT GCATGTCTGT TCATCAGCTG TTTTCTCATC 780
GTGCCGCTTC AGGCGTCAGT GCTCACACTT CTGGCCATCG CTGTTGATCG TTGCCTGCGG 840
GTTTGCATCC CATTCAGGTG AGTCGGCCTC AAACTTTAAT GTATTTCAAG GTGTTGCATG 900
TTTAAATTAG TGTAATGCAA CACAGAATGC ATTGGATTAT AGGGATTTTG TAATTTGACC 960
TTGCAATTTC AAAGCATTTA AAAACTTTTT TTTTTATTTA TTCTGTAAAT ATGTAATTTT 1020
GTATATATAA AAAAATGTAT TAAAAATGTT ATAATTATTA AAAATGTATA AAAATGTAAT 1080
TTTATAAATA CACATCATAA CTATAATTTT AAACCCCCTC AAATAACTGT AAAACACCTT 1140
GGGTGTATGG TTATATATAA ATCCACATTA CCTTATATTA CATGAAATTT TTTTCCTTAC 1200
AAACTGATTT TTATACACTC ACCGGCCACT TTATTAGGTA CACCTGTCCA ACTGCTTGTT 1260
AATGCAAATT TCTGATCAGC CAATCACATG ACAGCAGCTC AATGCATGTA GACCAGGGGT 1320
TTTCAAACTG GGGGCCGCCA GATCGCGCTA GGGGGGCCGC AAAAATTTTT AGATAAGGGG 1380
TAATCAATGG GCCCACATGG ATGAATTTTG TGTCCCGCAT CATTCTGAAG GTTAATATAT 1440
TTTTATTATA ATTTAAGCTC AAAAGTACTG CAAAAATTAA GCTTTATGCT TATGTCATTT 1500
AAATGCAGTT GACACTTTCG TGAAACAGGA TAAGAAGCGC AGCGGCTTGC CTCTGTGCAC 1560
AGGGACTTTT ATTGAATAAG CGCTTCTGTC CGGCCGCTTC CTGTGATTTT TGGCGCTTGT 1620
CTGCCGCACC TGACGGCGTT TACCTTTCAC TTACGCTTAC CTCTTTTACG CTAAACAACT 1680
AAATGAATGC TCAGGTCTAT TTACTGACAA TATTTCAGTT AAAATACATG ATCAATAAGA 1740
ACATTATCGG AGGCTGAAAG TACTTCTCTG TTTATGGCTT CCGTTCCTAA GTAAGCGATC 1800
AGCTGGGTGC TGCGGAGTGC GCGCCTCTCT GCGCAGGCTT CACTCATATA AAACAAATAG 1860
CATTTTAAAG ACACGGCACA ACATTGCACC TCGTCCACAG TGAGACAGGC TTTACACTTT 1920
GCATTGTACA AATATCAGAC GGTCCTCTTT GCAGCATGGC AAACAAACAT ATTAAAGATG 1980
TAAAGCAAAA AGTGCTGCAA TAACAATGAA TGGAGCTGTC ATCACATCAG CGAGTGCTCA 2040
GAGTTTCACT CCTGTTACAC TAATGACAGC TGGATGAGCT CTGCAGTGGA CCTCTTACAT 2100
TGGTTCATAA ATGGATAATT AAAAAAATTA AATTGTATAC ACCCTGAGTA AAACCACTAT 2160
AGCCTATAAA AATGATAATG TATCTGTTTG TGTTGTTATA GAGCTAATTA ATTATTAAAT 2220
ATTAAAATGT ATTAGTGCTC 2240