EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-49525 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr6:49548229-49549130 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr6:49549034-49549044GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr6:49549034-49549044GTCACGTGAC-6.02
Foxd3MA0041.1chr6:49548801-49548813AAATAAACATAC-6.11
MITFMA0620.2chr6:49549030-49549048GTCGGTCACGTGACTAGT+6.35
MITFMA0620.2chr6:49549030-49549048GTCGGTCACGTGACTAGT-6.35
Nkx3-2MA0122.3chr6:49548668-49548681TAATCCACTTAAA+6.13
Rhox11MA0629.1chr6:49548834-49548851TTGATTTACAGCGGCGC-6.11
SPICMA0687.1chr6:49548928-49548942ACAAAGAGGAAGTC+6.12
USF1MA0093.2chr6:49549033-49549044GGTCACGTGAC-6.14
USF2MA0526.2chr6:49549030-49549046GTCGGTCACGTGACTA+6.34
Enhancer Sequence
GTTAGTTTAC TCTATATCTC ACTTGTCAAC TGAGGGTAAC TTTAAATGAC TACATGACAT 60
TGCGTGCTAA ACAGTAAGTT ACTAGGGCAC GGTGTGTGTG AAACACTTTA TGTTGTAGTG 120
TAAAAGTGCA TACAGGCTGT ACTTAAAGTA TGACACGTAT TTTGTACGTT TTAAAGGTTA 180
TAAGCTAATG TTATCCAAGC GTGTTAACCG GAATCGACCC CGGTGGTCAG GCTGGCTAAC 240
AAACTGACAG TCAAGCTCCA GTCAACTAAA CTACATTGGT ATGTACTATT TAATTCAAAG 300
TACAACATAA TTTCCACCAT AAATTATTTA ATACATCACA TATTACCTTG TTGGCTAAAC 360
CTAGCTGTTT ATTACAGTAA GGTTACTTTT TATAATACCC CAGGATGTTA CCGTTAGCTC 420
CCCAACTCGC AACTAGTGTT AATCCACTTA AAATTTCCCC AGGCAGGGAC CTTTGTTCTT 480
ACAACATCAG AAATGTAAAA ATGGTATAAA AAATTATTAA AGTCAACAGT GATAACATAG 540
CAGATTCTCT TTAAACCGCC TCATAAAGCT TTAAATAAAC ATACTAAAGC ACGTTACCTG 600
CCATCTTGAT TTACAGCGGC GCTGTCACTC CACTTCCTCA AAAGATTTCC TGCTCTTATT 660
TCAATCCCGG CATCTATGTG AAGATCGAGT ACATATAAAA CAAAGAGGAA GTCAACGAAA 720
CAAAGCACTT TATAGCGAGT AAATAGCGCA AATTCCCGTA TCACTCAACC GAACGCTCGG 780
TGAGGAAAAA AATAAGACAA TGTCGGTCAC GTGACTAGTC TACAGACGTC CGATTCGTGA 840
ATGAGTTGTT CACATGAGTC GGATCTTTTC CGGGAATCAA TTGAACCGTC TCACAGAAAA 900
G 901