EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-48662 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr6:30369615-30371112 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
JDP2(var.2)MA0656.1chr6:30370233-30370245TGTGACGTCATG-6.02
NR4A1MA1112.2chr6:30369708-30369718GTGACCTTTA-6.02
Nkx3-2MA0122.3chr6:30369636-30369649ATTAAGTGTTTTA-6.16
Rarg(var.2)MA0860.1chr6:30369699-30369716TGAGCTTTAGTGACCTT-7.12
Enhancer Sequence
TTAATTATTC AAACATTTCT CATTAAGTGT TTTAATTCCT ATTCATATTT AAAGTATGTT 60
TTGACCAAGT GCATGCAACT TTGGTGAGCT TTAGTGACCT TTACAAACAA AATATCAAAT 120
AAAAATTCAT TTTTAAAGAG CCCAGATGCA AAAGCCTTTA AATTCCATCT AAATTTTCTT 180
CTAAAATGAT TTTTCTCAGC CTCTTATGTT TATGTTTAGT TATTTCACTT TAAAGGTAAT 240
GAAAAGAACC CATCCCAGCA AGCAATAGCC ATCATTTCAC CGTCTATGTC AACCATATAG 300
ACCAGATCTA GTCCGGCTAC ATGCAACCCA ATTTTAGCCC GAATAACCTT AAATTTGGTT 360
GCATGTTGGT TTTTTGCAAA TTAAAGCTTA TGATATGTAT GATATTCCAT CATGTAAGCA 420
AAGTCAATTA CATTTATGAA GTACCTACAA GTAATAGTTT CTCTTTTTCG GTGAAGTATA 480
GACCCAATCT AGTCCGGCTA TGTGTAACAC ATCTCTAGCC CAAAAAAACT TAAATTTGCT 540
TACCTGTCTT TTTTGGCTAA ATACCTGGTG ATATGTATGA TATTCAGTCA AGTCAGGAAA 600
GTCAATCCGC TTGTTAAGTG TGACGTCATG CGGAGCGGCT TCCGAGTCCA AGGGCTCTAT 660
TTAACTGAAT GGGGAGATTA ATGAAATGGT AATAATAAAC GTTTACAAAG CGATTTAATA 720
CTTTCGAAAG TCCCGATCGC AATATATATA TGTATATGCC TAATATCTGA TGGCCAGAAA 780
GTAATTCATT GTTTTATAAA TTGTTAAAAT TTTGGTATTT GTTATGCAGC AAGCCCAGAG 840
ATTGTTGTGT ACACTATGAC TTTATATAAA ATTAACTTTA ATGTGCGATA TAAATAAAAA 900
GTGATCATAA ACAAATGATT TCTCCACTCA AGTGAATGGC GGCTTGGACC CGGAAACAGT 960
ATTACATACG TCACAAACAC TTCACCACTT AACAAGCGGA TAGCATTTAT AAGGTGTTTG 1020
GGTTTTTAAA AAATATATGT TATTTTCATA GCCTGAGCAT ATCACCATAA ACATGAAAAT 1080
ACAGAACCTA CATACAAAAG CCTGAGAGAA ATACAAATTT TAGAAGAACA TTTATAAAAT 1140
TAGAGAAATT GGAAGAGAAC CTTCATTCAT AGGGCATTAA ATAATACTGT TTGATTATCG 1200
ATGCAAACTG TAAACCATAT ATCTTACAAA TCAAACAGAA ACACAAGTTC ATATCAGAAC 1260
ATGTAAATAT TCCCCAGAGC AGCGACTTTT CCTCCACATT TCAGAATCCA CTTGTCCTGT 1320
CCCGTATAGC TACACAGCCA ATGCCCTTGC TGCAGGTGGA AAAGTGAATG AGTGATTGAG 1380
TGGATAAGCA TGCTGAATAA CTTTTACTCA GCTCCGTCAG CCATCAGTCA GCCTCCTCAC 1440
ACACAGCAGG GGCCGCTCTC AGCCTGCCAT TGCAGTAAAG CACAACTGGA AGCCCCC 1497