EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-48635 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr6:29728685-29729690 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MEF2CMA0497.1chr6:29729478-29729493GTCTATTTTTGGAAT-6.76
RARA(var.2)MA0730.1chr6:29729104-29729121TGACCTTCACATGAACT-7.21
Rarb(var.2)MA0858.1chr6:29729104-29729121TGACCTTCACATGAACT-6.63
Rhox11MA0629.1chr6:29729131-29729148ATGTTTAACAGCGTCCA-6
TFAP2B(var.2)MA0812.1chr6:29728947-29728958TGCCTCAGGCT-6.14
TFAP2C(var.2)MA0814.1chr6:29728947-29728958TGCCTCAGGCT-6.32
Enhancer Sequence
TCTTACATGA CTCTGGTTTG TCTCAACATA ATTAGATCAT AATAAGCCTT TTGTGTACGT 60
GTGGAGATGA ACTGTATCAG TATCAGGCTT GCTAAAGAGC CCCACTAGGT GTCACCCAAG 120
ACCAATACTG TCCTAAATGG CCTCACAATA CATTCATCTC CTCGTTTTGT CCGCCAAATC 180
AAGTGTTTGA GCTCATACTG AAGTCAAGTT TGTAGTTTTT ATTACGTTCA GCCGTGTTAA 240
CCGTGACGTT GCGCACGTGT GGTGCCTCAG GCTTCAAAGC TTGTATTCAC TCCTAATGGG 300
GCCTTAAACA GTGTTTCTCT ACAGCGAGAC TGTTTGGAAA AGAGGGGGTT GGCAGCACAT 360
GCTTATTCAT GAAGGTGGGC TAGGTCAGGC GTCTTACGCT TCTGAATGAT ACACAAGCAT 420
GACCTTCACA TGAACTCTTG CTGTGGATGT TTAACAGCGT CCATATTTTT AGCCAAAGAC 480
TTTTAAGTTC TGACTGAACA TGAACTGTTT TATCTTAGTA AAGGAATCTT GAACTGGCGT 540
CTTATCTATT TTAGGCTAAC TTTAATGATT TTGAGATTTT AAATGATAAT AAAAAACAAA 600
ATTATTCAAA AGAGATAGTT ACACCATGTA ATTTTGTAGA TTAACCGATA TCTAATAGAC 660
GACTAAACAG ATTTTTACTG TCAGACCAAA TTTAGCTTTG TTTAGCCAAG ATGTCTAATA 720
GATGTCTAAA GTCCAAAAAT AGGCTAGTCA TCAAATAGAC AGATTAGACA TATTTCATGT 780
GTCATTCATT CCTGTCTATT TTTGGAATAG ATGTCTGTTA GATTCTCACT GACCGTACTG 840
AAAAAAACAG CTTAAACCAG CCTAGGCTGG TTGGCTGGTT TTAGCTGGTC GACCTGGCTG 900
GTTTTAGAGG GTTTTTGGCC ACTTCCAGGC TAGCTTCCAG CCATTTCCAG CCTGGTCTCA 960
GCTGGTCAGG CTGGGAGATG ACCAGCTATA ACCAGCTTGA CCAGC 1005