EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-48288 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr6:20478385-20479543 
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr6:20479396-20479406TTTAATTAGA-6.02
ARGFXMA1463.1chr6:20479396-20479406TTTAATTAGA-6.02
ATOH1(var.2)MA1467.1chr6:20479248-20479258GACAGCTGTT-6.02
MITFMA0620.2chr6:20478966-20478984AAAGGTCATGTGACCGAC+6.15
MITFMA0620.2chr6:20478966-20478984AAAGGTCATGTGACCGAC-6.15
POU4F1MA0790.1chr6:20478418-20478432CATTAATTAATCAT-6.04
POU4F2MA0683.1chr6:20478416-20478432CTCATTAATTAATCAT-6.67
POU4F3MA0791.1chr6:20478416-20478432CTCATTAATTAATCAT-6.6
POU6F1MA0628.1chr6:20478419-20478429ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr6:20478419-20478429ATTAATTAAT-6.02
RFX1MA0509.2chr6:20479454-20479470AGTTGCTATAGCAACG+6.46
RFX1MA0509.2chr6:20479454-20479470AGTTGCTATAGCAACG-6.47
RFX2MA0600.2chr6:20479454-20479470AGTTGCTATAGCAACG+6.91
RFX2MA0600.2chr6:20479454-20479470AGTTGCTATAGCAACG-6.95
RFX3MA0798.1chr6:20479454-20479470AGTTGCTATAGCAACG-6.4
RFX3MA0798.1chr6:20479454-20479470AGTTGCTATAGCAACG+6.77
RFX4MA0799.1chr6:20479454-20479470AGTTGCTATAGCAACG-6.31
RFX4MA0799.1chr6:20479454-20479470AGTTGCTATAGCAACG+6.51
RFX5MA0510.2chr6:20479454-20479470AGTTGCTATAGCAACG+7.22
RFX5MA0510.2chr6:20479454-20479470AGTTGCTATAGCAACG-7.28
Enhancer Sequence
AATTATTCGA TTCCCTAAAT CTTAATTATT ACTCATTAAT TAATCATAAT AATTAATCAT 60
CATAGCCAGT GGAAGTGTGG AGTAAAATCG TTCACTTCAT AGGCACAAAC CTAATAGATA 120
GAGTGCACCT AACTTTACAT TTATTTTTTC TCTTTTTCTT TTCTGTAAAA TGTGTAAAAA 180
GACAAAAGGG GAGATAAAAC AGACTTGTTC TTAAGCTCGC TATAAGATTA AATATTTTTC 240
AATAGGCCAA TCAGCTTTCA GCAAAACTTC ATTGCGTCAT CACCCACATT CATCTTTACA 300
ATATGTTTAT ATTTATAATC TTTACAGTTA TCGAAAATCG CACAGAAATT CAAGAATAAA 360
GTTTTTAATA AACAGTACTT AACAAACGAG CTCTTCTATA ACGTTAAATG TAACTTACCA 420
TAATGAAGAA GTGGACGAGG ATGATATTGT TCTCCATTCG GGAGATCTAC TGGCATTATA 480
AACTGTTTTC AGAAAAATTA TTGTATTACT TTCTGAGGAA CACATTTTGT TTACGCTAAA 540
TTTCATATTA TTGCCGAATC ACGCTGAAGC AGGGCATTAT GAAAGGTCAT GTGACCGACG 600
TCCCTGACGT CACTCCTTGC GTAATAAATG TATGGCCAAC GCACAATTAA GGTATGTTAA 660
TGAATTATAT TTTTAAATAA AATAAATTGT ATGATAATAA AAACAACAAT AATATTAAAT 720
TAAATAAGGC TTTTAGTATT TCATATGTGA TCATGGTAAT TTGGTGTCAA CTGATCGTGT 780
CTGTTATTAA ATTGTAAATT GAAATTAAAC TCCTGGAATA TATTAATGCT TGTGTATATT 840
GTTTTATTAT GCTGAGATGC GAAGACAGCT GTTCAAATGA GCCATTTTTA TTTGAGTTGA 900
TAGCTCGATC AGTGTATGGT GATGACGCAG TATTGATGAA AGATGATTGG CCTTTTGAAA 960
TTTATCCCAG AAGTTCTTTT TTTATACATT TTTAATTTAA TAACAAGAGC TTTTAATTAG 1020
AACTAGTCGG ATTTACACCC CTTTTTGTCT ATTTGTCTTT TACAATGTTA GTTGCTATAG 1080
CAACGAGTGT TATGATATGA ATTCTGACTG CATACAAAAA CAAACCCATC GCAATCTGTT 1140
GGTTGAGAGA CGAGGCGA 1158