EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-48256 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr6:19006217-19007429 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Atoh1MA0461.2chr6:19007220-19007230AACATATGTT+6.02
Atoh1MA0461.2chr6:19007220-19007230AACATATGTT-6.02
DMRTA2MA1478.1chr6:19006284-19006296AATGTAACATTT-6.52
DMRTA2MA1478.1chr6:19007079-19007091AATGTAACATTT-6.52
IRF1MA0050.2chr6:19006299-19006320ATTTAGTTTCACTTTATGTCT+6.27
OLIG1MA0826.1chr6:19007220-19007230AACATATGTT+6.02
OLIG1MA0826.1chr6:19007220-19007230AACATATGTT-6.02
POU1F1MA0784.1chr6:19006777-19006791CTTATTTGCATAAA-6.22
POU3F1MA0786.1chr6:19006778-19006790TTATTTGCATAA-6.07
POU3F1MA0786.1chr6:19007390-19007402TTATTTGCATAA-6.07
Pou2f3MA0627.1chr6:19007388-19007404TCTTATTTGCATAAGG-6.29
Pou2f3MA0627.1chr6:19006776-19006792TCTTATTTGCATAAAG-6.76
Enhancer Sequence
TGGCTACGTT AGATAAAAGG TACATTTTAG TTTTGTCTTA AAAGATTGAA ATTCATAAAC 60
ATGTTTGAAT GTAACATTTG CCATTTAGTT TCACTTTATG TCTACACATA GCAATGTGGC 120
AATAAAGCTT GAGTTGACTT GAATAATGGC CTAGAGCAAG GGGGCCCAGA CTTAGTCCTG 180
GAGGGCTGGC GTCCCGCAGA TTTCAGCTCC AACTTGCCTC AACACACCTG CACAGATGTT 240
TCTTGGAAGC CTTGGTTAGC TAGGCCAGGT GTGTCTGATG GGGGGGACAC CAGCGCTCCA 300
GGACTTTGTT TGGGCACCCC TGGCCTACAC TAAAAACATG TTGTGTTTAG ATAGTTTTGT 360
CTTTGGTGTA GTTGCTATTT TTCTCATTTA GCAACGTGAG GACAATTGTA AGAGTTGATT 420
AAATATCCAT ATAATGTTGA CAAACCTTTT TTCTGAGCAT TCATTTATTT AATGTTGTAA 480
TTCTCTGATT AACATTTAAT TATATGATAC AAAGTATTAT TTAAAGAGCT TACAAGACTA 540
GGGTGTTTTT CCCAGTTGGT CTTATTTGCA TAAAGAAAAA GATTTAGAGA AAAAAATTCT 600
CAAAAAACAT GAACTTTCAA ACGTTTTCAC TTCTTGCTGA TTTCATTTTT TTATTCTGAT 660
ATTTAAAGAA AAGTTTAAGC TTTGTAAATA ACCTTCTTTA CATATGGGGT ACATATTGTT 720
GCTTGAAAAT AGGCTACTTT AGATAAAAGG TACATTTTAG TAACTCTTAA AAGAGTGAAC 780
CCTAGTATTT TTATTATTAG TATTTTGTAC CTTAGTTTTT TGAAGTTTTT TTTGAAGTTT 840
TTGAAATTCA TAAACATATT TGAATGTAAC ATTTGCCATT TCATTCCACT TTATTTCCGC 900
ACATGGCAAT GTGGCAATAA AGCTTGACTT GACTTGAATA ATGGCCTAGA GGAGGACACC 960
AGCACCCCAG GACTGAGTTT GGGCACCCCT GGCCTAGACT AAGAACATAT GTTGTGTTTG 1020
TAAGAGTGGA TAAAATATCT ATATAATGAT GACAAACCTT TTTTGTAAAC ATTCATTTAT 1080
TTATTGTTAT TATTATCTGA TAAACATTTC ATAATGTGAT ACAAAGTCTT ATTTAAACAG 1140
CTAACAAGAC TAGGGTGTTT TTCTCAGATG GTCTTATTTG CATAAGGAAA GAAATTGAGA 1200
GAAAAAGTTC TC 1212