EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-48025 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr6:13113776-13116036 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr6:13114320-13114337TCCATTAATTAATTCAC+6.03
ArxMA0874.1chr6:13114320-13114337TCCATTAATTAATTCAC-8.17
ArxMA0874.1chr6:13114319-13114336GTCCATTAATTAATTCA+9.08
Atoh1MA0461.2chr6:13114932-13114942AACATATGTT+6.02
Atoh1MA0461.2chr6:13114932-13114942AACATATGTT-6.02
HOXC13MA0907.1chr6:13115914-13115925GTTTTACGAGC-6.14
OLIG1MA0826.1chr6:13114932-13114942AACATATGTT+6.02
OLIG1MA0826.1chr6:13114932-13114942AACATATGTT-6.02
POU6F1MA0628.1chr6:13114323-13114333ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr6:13114323-13114333ATTAATTAAT-6.02
Sox1MA0870.1chr6:13114205-13114220CACACTGCTATTGTG-6.19
Enhancer Sequence
GTCCATATAT ACTAGACGGC CAAGTGCATT AGAGCTAGCT GAAATGAGTC GCTACAGGGC 60
CTGCTAATCT AATGAAGAAG AAAAAAAAAA TAATCATGGC CTGGCAGAGT CTGCATCAAA 120
TAATTAAAGT CATAAATTAA ATCCACACTT CTACACTCTC TGACCTTCTC TCAGGCTCTC 180
AACAAAGCTC TTAAACACGG TCACTCTCCA TCAAGCCCAA AACAGCTATT GTATTAATGA 240
TTTCCCCCAT TAAAACGATC AATAGAGCAG CGACGTTGAG TTTTAATAAA GCACGAATGC 300
AAGGGGACTT TAGTCTTTTG CTGAGAGGAG ATTCTACAAT GCAAATCCAT TTTTAGAAAG 360
ATTTAAACAT CATCCGTGTG CTTTCAGACT GACAATGAAT GGCATCAAAA GGGCAAAAAG 420
CAGATTTAAC ACACTGCTAT TGTGATGGTA AAAAGAGGAT TCTGCAATGA AAGCCTTTAG 480
AAGAGAAAAT AAGTAGCTAA AAAAGAGACC CTGACATCGC TAATGTTTTC CCCCCTAAAT 540
GTAGTCCATT AATTAATTCA CTGTGCGTTT ACTGAATTTG TAAAATTAGC ATTTATAAAA 600
AATATGATAA ATTCTCTCAA AAAAACAAAA CATTACGTAG TTTCATTCTG TATCTAAACA 660
CCTACAAAAA TTTAATGTAA TAAATGTTTA AGCTAGTATT CCATACTTGA TTTTTTTTTT 720
TCAGTTTTAT CTGTAGTTTT ATCCGTAAAA TTATTTGACA TTTCCTTCTG CCATTAAACC 780
TTAAATCGTC TTCTGATGAC TGCGTGTTAA ATGGCAGTTG AGGTGTCGTA GGATGTGCAT 840
CAGATGAGAT ACCATATAAG AGTGAGTGCA GCCACTATGC CGTTGAGTAT AGCCATACTG 900
TAGCCCATGT GGAAAGAGTG TCCGGTCATT TTTCTGCAAA ACGAAAACAC AAACAGGTCG 960
TTAGTCCATG ATGAAGATTT TTACTAAACC TATATGAAGA CACATTTAAT TGGGTGAGTG 1020
GAGGGCCCTA CGAATCTGCC ATTATTTGTC TTTGAAAACA GGTGACAGGT TAAGGCAAAG 1080
GGGTCATAAA AGAGCACGAG AGAGGCTTGG GGATACAATG AGAACCATCT GTGTCAGAAA 1140
AGCATGAAAT GTATACAACA TATGTTGAAA CTGTCATGTA TGTTTGAAAA GACACATACT 1200
GTATGGGAGA GAAGAGTCCA GTTTAGATGT TTGAAACAGA TATTAGTCAT GAGTACCAAG 1260
TGTGTACTAT ATATGTAAAA ACAGTGATGA ATACATTAGA TCTTTACATT ATGAGGGCCA 1320
ACAACAAGAA GGGACTTTAA ATTGGGGTCG TAAAGGAGTA GGAGCTGGGA GCGGCCTGTT 1380
GAACCAGTAA ACAGCTGTGA AAACACAAAG GTGGGAGGAA GCAAGGATAA AGGGTATAGC 1440
AAACGGGAGG GACATTGGAT TTGTCCTGGG GAGAGACTGA AATGGATCTG CTCCAGTCTG 1500
TCTCTGCTTT TTTGTAAAAT TTTCCAATAA AGTATATTCT TCTGATATTA ATAACCTTCA 1560
GACTGAGTTT GATTTATTAA GAGAAAAGCC AAAAACCATG ACATCAACTG TTGTTAAATA 1620
TTGTCCTTGC TGTGTTTGTA ACTTAGTCCA ATTTTGGCCC ATTTCCACTG AGTGGTACGG 1680
TAAAGTATGG TACAGTTCGG TAAGCTTTTT TGTCTGTTTC CACTGTCAAA TGGTACCAAA 1740
AAGCAAAACG TACCATGCCC ATTTCCACTA AGTGTTATGG TACGGTAAAG TTTGGTACGC 1800
TTTTATGGCT GTTTCCACTG TCAAAGGGTA CCTAAAAATC GCACCATACC ATACTACTTT 1860
TTGGTCACCC TTTGCAAAGC GTACCTAGCA TAAAAAAGGT TACAGAAAGG CGGAACAAGA 1920
CGCACAGCTG AAAGCTGTTG GTTTACAGAG ATACGTCATT AGCAGAAGCA GGAGAATAAA 1980
AAAAAGAAAC CGCCATTTTT AAATACACAG CCGAGACATC ACACCCTAAC ATTATATACA 2040
TATAATAACA AGCCATGGTC GAACCGAGCT CAAACAAATC TTGTCATCTT GATGAACAGC 2100
CACAAAGCCA AATACAAAAT CTCTAGTGCC CTGTTTTTGT TTTACGAGCC CGTCTAAAAG 2160
TGAGAGTGGT TTCACTTTCT CCAGAGAGTT CTCGATCGCG TATTCATTTG AAATAACGAA 2220
CTTCTTGAGC TGATAATAAT GTGCACTTGA TTATTGAAGT 2260