EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-47190 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr5:65325155-65326553 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr5:65325969-65325980GATTTAATTAA+6.02
NR2C2MA0504.1chr5:65326240-65326255TGAACTCTGACCTGC-6.16
POU1F1MA0784.1chr5:65325253-65325267TTAATTAACATAAT-6.24
POU3F1MA0786.1chr5:65325254-65325266TAATTAACATAA-6.04
POU3F2MA0787.1chr5:65325254-65325266TAATTAACATAA-6.07
POU3F3MA0788.1chr5:65325254-65325267TAATTAACATAAT-6.62
POU4F1MA0790.1chr5:65326467-65326481GTGCATTATTCATG+6
POU4F3MA0791.1chr5:65326467-65326483GTGCATTATTCATGTG+6.13
Enhancer Sequence
AATATTATTA GCACCCTTAA GAGTCTTTTT TTTTGTTTTT GTTTTTTTTT TGTTTTTTTT 60
TGGCTATAGA ACCAAACCAT TTTTGTGCAG TGACTTCATT AATTAACATA ATTAACCTAG 120
TTACATCTTT AAATTGTACT TTAAGCTAGT TATTAATTGT TAGCATTAAA ACTAATTCTT 180
CGCTCTGCTG AACATCACTT AAAAATATTT GAAAAAGAAT TAGAATTACT CTTCTAAGCT 240
GTGGTCACAC TGCACTTTCG CCCCATTGAC CTCCATTCAT CCCAACATAG GCTCATTCAG 300
AAAACGTAGG CCTACATTTC TGGAGATCGT AAATTATCAA GCCAGAGGAC CATGACTGCA 360
TTTTGGTGAA TTACATTTGT TGTCCTTAAA ACGAACGCTA CGGGGCGGTA TCGACATTTC 420
TTTTCGCCCT TATTAGCGCT TACATCTGTA TGGCTGGCTT TCCCACTGTT ACCAGTTTGT 480
CCAATAACGT AGGCAGACTT GAGATGCAGA GAGGAGTTGA CAACGACGAC AGGGTTCAAG 540
TCCGGTGTAG AACGGTTCCA GAAAGTGGGT AAAACAAAAA CAAGCCAAAA GATTTAATAA 600
GCAAGTAAAT AAAAGGGTGA GAATGTGGTA AAATCTGAAA ACGTGATCGA AATCAGGCGA 660
GGGCTTTTCT TTTTCTGGAT TGCTTTTTAA AACTGTTGGA TGGGTTTAAG GAAGTGGACA 720
GGTCAGTCGT TGCTTTTGAA AACACTATTG GTTGGGTTTA GGGGCAGGTG AGGGGTGAAT 780
CAGTTGATCA GTCAGTCGAC AGCGGCCTCT GGTAGATTTA ATTAAGAACA ACAGGCACGA 840
ATGGCATTCT CTAGAAAAAT TTTAGATCTA AAAAAGCACA GCAGCCTCTG GTGGATTTGC 900
GAAAACAAAA ACTGCAAAAA AACGTACCTC CTGGGATGTA TTTGGCACTC TCCAGAAATG 960
TATGTAGTGG TACATTATCA GAATGAGCCT GGGTTGATTT TTATGTAAGC AAATGCGACA 1020
AACCGAAAAC GCAAGCTCAT GCAACAAGTT TTTGCATGTT GCTGCATTGC AAAGTTCAAG 1080
CTTGGTGAAC TCTGACCTGC GATATCGCAT CATGTGACTG CATGAGACCA ATCGAAGATC 1140
CAAACATGAC CACTCTGTAC AAAAATTTTA AATATATGGA CCAATCTTTT TTTAAACGTC 1200
TAATCATCTT GTTTAATCCC GCCCCTTGTC GGAGCGCTGT ACGATAGAAT TTCGCATGCT 1260
CAAACTGTAA TGTGACCGCG GCATCATTCA TGGCCACATC AGCACCTCAG GTGTGCATTA 1320
TTCATGTGCA TAATCCAACA TCCCATCATC TATCATGGCT TACTGTATAT ATACAGTACA 1380
ATGTTTGCTT TAGGCACA 1398