EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-45613 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr5:31160340-31161856 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4A(var.2)MA1494.1chr5:31160543-31160558TTAACCTTTGAACCC-6.24
HNF4GMA0484.1chr5:31161646-31161661TGAACTTTGACCTCT-7.99
Hnf4aMA0114.3chr5:31161644-31161660ACTGAACTTTGACCTC-7.51
NR2C2MA0504.1chr5:31161646-31161661TGAACTTTGACCTCT-6.99
Nr2f6MA0677.1chr5:31161646-31161660TGAACTTTGACCTC-6.83
RXRBMA0855.1chr5:31160544-31160558TAACCTTTGAACCC-6.49
RXRBMA0855.1chr5:31161646-31161660TGAACTTTGACCTC-7.22
RXRGMA0856.1chr5:31160544-31160558TAACCTTTGAACCC-6.68
RXRGMA0856.1chr5:31161646-31161660TGAACTTTGACCTC-7.42
RxraMA0512.2chr5:31160544-31160558TAACCTTTGAACCC-6.59
RxraMA0512.2chr5:31161646-31161660TGAACTTTGACCTC-7.38
Enhancer Sequence
GCACCACCGC GTCACCCTCC TACAGAATAA TGTCCCTTAA AAGTACATGA GTCTACTATA 60
AATGTTTGGA TAGATCTTGT ATGTGACAAA CAAACACAGG TAAATGTGAT CACATGTCTT 120
TCAGGAAACT GAGAAAAGAA GCTGGTAAAA TTGACCCAAT GGTAAAGACA AATTCACCTT 180
TGAAGAGCAG CAGCCAGAAG AATTTAACCT TTGAACCCAC AAGCGCTCCA AGCTTCTCCA 240
TGAATGAGAG TCTAAATTCT GAGTGGCACA GCGGATTTAC TGCTCTGTGA TCACAATCAG 300
AGGGTAGACG GTGTGCATGA CAGCAAATAC ACCTTAAGTG GACAGGAACG GATTGAATAG 360
TAAGCTGAAG ACAAAGCACA ATGATTGAAA TCTGAACATG CAGAAGCAAA AAGCACAAAA 420
GACATTGTTG AGGGACGGAA GGAAAGACAA GTATGAACAG ACTAAAATGT GCATGAACGG 480
CAGAATGTAA GGGCAGGGTT CAAAGTCCCC ATGTAATTCC GTCTCCTGAA TGTTCAATAG 540
GCACTTTAAG TCATCAGAAA CGGCAATAAT CAAAGTTCTG GTGGACCATT ACAGCTAGTT 600
TAATGCCAGT CATTATTCAC CCTAGGAGTT TTCTTCTCTC TGTGGTAGGT TCTCCCCGAA 660
CAAAGGCTTT GATTTAAGCT CTGTGAATGT AATGAAGTAT CCAGACGCTA GAGCTCTGCT 720
TTGATGGTGC AACCAAACTA AAGCATGTGC TCATTTGACA TAACCCAAAT CTATCAGACG 780
CTATTAATCT CACGATGTAG ACTCTACTGC AGTAAAATGG CCATAAGAAC ACTCCGATAT 840
GAAAAGACTG ACACTGACTT GAGTGAAGAA TGTACTGGAA TCATTAGAAT GGCAACAATA 900
TCACGTTTCA TCCTGTTCGG GACTGTACGT ATTGTACAAG TTTTGCTCTA AGCTTTCAGA 960
GAATACAAAA CAGTTGGTTG GCGTGTCTAT ATTTTCATAA TAGTAGGCTA TAAAATATCA 1020
AGGCTTGTAA TTCAAATAGG GTTACTTTCT AACGGGTGTG GATATCATCT GTGTTTCTTG 1080
TGCTGATAAA ACAGCTTAGT CTACACAGTT TTAAAAGGAT TTTAAACAGG CAGACGTGAA 1140
GATTTGAGGT GGAGGAGATG CGTTTATTAA AGCTGTCGAG ACACACCGCC ATCTACACCG 1200
AACTGTTTGC ATGAAGGACA GGAGGAACGT GTGAATGGGA AAGAGGTAAA CCAAGTGGAC 1260
ATTCTCAGCC ATGTTGTCTG TGCAACCCTG CAACATATCC GGCCACTGAA CTTTGACCTC 1320
TGGAAACCTG TGACAATGCA AAAACAGCGA GCACAGGACA CAGCTGTGGA AGACCTGCAA 1380
AAGCCTTACA CATACGATTG GACAAATCTG TGAATTTGAA CAATTAGAAA AAATGAGGTT 1440
TGGCGTAAAA CAAGCATTAA ATCAAAAACT TTTTCTAGTG ACAGACAGAA AAGGGCCAGT 1500
CATGTTTTGC GAAGTA 1516