EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-45554 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr5:29859223-29860341 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr5:29859833-29859854CCGCTGTTTCAGTTTCTTTCT+6.05
IRF3MA1418.1chr5:29859836-29859857CTGTTTCAGTTTCTTTCTTCT-6.21
IRF9MA0653.1chr5:29859837-29859852TGTTTCAGTTTCTTT-6.12
Enhancer Sequence
TAACAAATTT CTCTTCAACA CAGTTACTGA CCCCCAAACA TACTCAAGCA ACCTCTCACC 60
CGACTGTGAA AGTCAGCTGC TGCAGTCACT CTTCCAGCAC TGTGTGCGAG TGTGTGTTTG 120
TCTATGTGTC CCCACAAGTA TAGCAATACC AGTAACTTAG GAGACATTGT TTGGTCATAG 180
GCTATAAAAA CACACGAAAT TAAGTGTTTT GAAAATGTTT CTTGTGAATG TTGGGTTTAG 240
AGGTAGTGTT AGCATAGGAG GACAGAATAT ACAGAATAAA AGTTACCGTC TATAGGAAGT 300
CCCCATGAAG ATAGATGTAC AAGTGTCTGT GTGTTCACTG TCTACTTACA GCCTCCCCAG 360
TCTTCTCTCA TAGGTCTAGC CAGACTAACT AGCGCTCTAG GCATTGGGGC TCATTATATT 420
TTACATGGAC AATACTCAGC TCAGTTTGGC TCGATGACAC CAGTGACATT ACTAAAATAG 480
CAAGGCACAG GATGGCCCGC TTACAAGAGA GCAGCCGTCC ACTTCAGCTA ATTAAATTTA 540
CTTTTAATGA AGCATGGAAT AATTTACGCG AATGTAACGA ATGGTCCTGA GACCTCTGAA 600
AACAAACACG CCGCTGTTTC AGTTTCTTTC TTCTGCTGAA CACAAAAGAA GATATGATGA 660
AGGATGCTGG ACACTTGTAA TCATTGACTT CCATGCTATT TTTCCCACTG TGGATATCAG 720
TGGCTGCCAG TTTCCAACAT TCTTCGTAAT ATCTTCTTTT GTGTGTCCAA CAGAAGATAA 780
AAAAATCATA AAGGTTTGGA ATCACCGGGT GTAAAAGTCT TTATCACTGA GCCATTATCT 840
ACAAGAGCAG CCAATAGAAC GTCTGGAAAC ATATGCTCTT CTGTTTTAAC GAGGTCTCCC 900
CTGTCAGGAG AGTGCAGACA GTGCACTGGA ACAAGTAAAC GTTAACTGAT GGGTAACGTA 960
GCAACAGCAT TCTTCTCCAA CAAAAGGGTG TCAGCACAGC TGGTATGCAT GCTGGAGATG 1020
CCACGACACA GACCAACACA AAGCCCACAG CACTAAACCT CTGTGTGCAA AAGACATTTT 1080
ATGACACGAC CGTCCTCTGT TTGGGAACAA CTGCCAAG 1118