EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-45050 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr5:18748313-18749630 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RUNX3MA0684.1chr5:18749604-18749614TTTGCGGTTT-6.02
SOX21MA0866.1chr5:18748702-18748717CACAATTGCAGTGTT+6.64
Sox11MA0869.1chr5:18748702-18748717CACAATTGCAGTGTT+7.09
Sox1MA0870.1chr5:18748702-18748717CACAATTGCAGTGTT+6.47
ZNF384MA1125.1chr5:18749584-18749596TGTAAAAAAAAA+6.07
Enhancer Sequence
ATCTAGAACT AACTTGACAA ACACTAGTTT AAAGGGATAT TTCGCCCAAA AATGTTAATT 60
TCCTCACCAT TTACTCACAC TCAAGTGATT TTAAAACTTT GAATAAAAGG ATATTTTGAA 120
CAATGTTTGG AAAAAATATC TTATAGTCTG TCTCCCCCAG TTCTGATGTG CCGTCGGCTT 180
CAGACTCAGG AATGAAGCCG ACTGCAAGTC TCTGCATGTT TCTATCTATC CTGTGGTTCG 240
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 300
TGTGTGTGTA TAAAGTTTAT GAAAAACAGG AATGCAGATT ACTATTCAGC GATTCATTTA 360
ATATTGCATA TGGAGTCTTT TTAGGTTCAC ACAATTGCAG TGTTTGTTGT GCAACAGTAT 420
TTTGTTTTGC GAGTCTTTAA GCTTTCACAC AGTATCTGCA GACTGCATTG TACAAGCTTT 480
GACTTGTTTG GCACTTCCTT CTATTGTATG ATCTGTCAGC GATTAATGAA AATGTTGCAA 540
ATCACAATGT TGTCCCTCTT TTCCTAACAA TTCACCAGAG TTTGAGTTGC CTTATTCAAA 600
TCCTGTATAC AGTATAGTAA GTTTTAATAC ATTAATACAT TTTAATACAC AAATCAACTG 660
GATGGAAATG ATAAATTAAG TTTATATATG TATATGTAAA AAAACTGAGA GAGAGAGAGA 720
GAGAGAGAGG GAGAGTTTTT TTCTTATTAT TAATAGGACT CTAAAGAAAC TCTTGATGTG 780
CTACTTGCAA ACCACTTCAC ATTTAAATTT AGTCATTTAT AGTAGCATAT GCTTTTATTC 840
AGTGACTTAA AATGATGAAG TGGTTTAAGT ATCTATATTT TACCATAACA CCCTTTTGAT 900
TTTTTGCCTT ATTTCTGCCA TGACATCTCT CTAAGTGTTA TAGATCTGCT TCGCTGCTGC 960
TTTGATTATT GGTGCAGAGA CTTGCTACTG CCAGTAAATT CACAGACATG TTGTCTGAGA 1020
ACGTAACATA CTGCTGCTGT AAGCATAACA GACATGGAAC CCCCAACAAT GCAGGAGAAC 1080
ATGAAGACAA ATCAAACCAA TGAAAACTTG ATTCTGTGTG TAAACAAACA GTTGCGTTAA 1140
CAATCATGCA CATATCCACA CTAATTGACT GAGACATAAA ACATTCAATA AACACAGTCC 1200
AAAACAGGAG ATCTAGAACC ATGACAAGTT TTTTTGTAAA TAAGTTTTAT GGTATTTATG 1260
GGAGAGTACA CTGTAAAAAA AAATCCGTAA TTTTGCGGTT TTTTCCGGCA GCTGGGG 1317